| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 380858 | 134 (0.360) | 31 (0.100) | 16/230 | NT | 23.3% | intergenic (+45/+64) | gbcB/PP_0317 | glycine‑betaine dioxygenase subunit/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| ? | NC_002947 | = 380892 | 93 (0.300) | intergenic (+79/+30) | gbcB/PP_0317 | glycine‑betaine dioxygenase subunit/methyl‑accepting chemotaxis transducer | |||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GACGAAGCCGAGGGCTACATCCTGTCGTGCTGCAGCGTGCCGAAAGGGGATGTGCGGATCGATTACTGATCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCACCGACAGGTCGTTGATGTT > NC_002947/380745‑381041 | gACGAAGCCGAGGGCTACATCCTGTCGTGCTGCAGCGTGCCGAAAGGGGATGTGCGGATCGATTACTGATCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtg < 2:6078918‑M2/150‑3 (MQ=255) gcgcatcagaccagcgcggcgagtgccgagctgtcgcgcctggcggtagacctcaatggcctggtagcccggttccgcacctagaagcagTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgt > 1:5266731‑M1/91‑150 (MQ=255) gcgcatcagaccagcgcggcgagtgccgagctgtcgcgcctggcggtagacctcaatggcctggtagcccggttccgcacctagaagcagTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgt > 1:5741458‑M1/91‑150 (MQ=255) 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aCGAAGCCGAGGGCTACATCCTGTCGTGCCGCAGCGTGCCGAAAGGGGATGTGCGGATCGATTACTGATCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgt > 2:7198528‑M2/1‑147 (MQ=255) gcatcagaccagcgcggcgagtgccgagctgtcgcgcctggcggtagacctcaatggcctggtagcccggttccgcacctagaagcagTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAAGGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgtg > 1:167584‑M1/89‑150 (MQ=255) gcatcagaccagcgcggcgagtgccgagctgtcgcgcctggcggtagacctcaatggcctggtagcccggttccgcacctagaagcagTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTgg > 1:972939‑M1/89‑150 (MQ=255) gcatcagaccagcgcggcgagtgccgagctgtcgcgcctggcggtagacctcaatggcctggtagcccggttccgcacctagaagcagTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTgg > 1:6479537‑M1/89‑150 (MQ=255) gAAGCCGAGGGCTACATCCTGTCGTGCTGCAGCGTGCCGAAAGGGGATGTGCGGATCGATTACTGATCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgtgg > 1:7127107‑M2/1‑145 (MQ=255) 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aTCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCCGGCCATTGAGGTCTACCg > 1:1429762/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCg > 2:3652277/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTTTGGTCTACCg > 1:6808604/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCGTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACGGCGTCTAGGTGCGGCACCCGGCGACCAGGCCAATGAGGTCTACCGCCCGgcc > 1:6237897/1‑149 (MQ=37) tGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCGTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCGTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCCGGCCCTTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCt > 2:6636373/1‑150 (MQ=255) 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CACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATgcg < 2:5708190‑M1/150‑1 (MQ=255) aca‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaagccagactggccactggatcagtaatcgatccgcacatcccctttcggcacgctgcagcacgacaggatgtagccctcggcttcgt < 2:7059966‑M2/150‑114 (MQ=255) ACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATgcgc < 2:6043332‑M1/150‑1 (MQ=255) a‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaagccagactggccactggatcagtaatcgatccgcacatcccctttcggcacgctgcagcacgacaggatgtagccctcggcttcgtcc < 1:1116743‑M2/150‑116 (MQ=255) A‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGccc < 1:2861767‑M1/150‑1 (MQ=255) A‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGccc < 1:2292654‑M1/150‑1 (MQ=255) t‑CATAGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaagccagactggccactggatcagtaatcgatccgcacatcccctttcggcacgctgcagcacgacaggatgtagccctcggcttcgtcctctt < 1:983261‑M2/150‑120 (MQ=255) tCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaagccagactggccactggatcagtaatcgatccgcacatcccctttcggcacgctgcagcacgacaggatgtagccctcggcttcgtcctcttcgg < 2:8072211‑M2/150‑123 (MQ=255) tCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGc > 1:143964/1‑150 (MQ=255) cGCTATCTTCCGGACTGCGGTGAACCTTGGGGGCGGGGGCGTGCCCACGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCa < 2:3619832/150‑1 (MQ=255) tATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTtgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaagccagactggccactggatcagtaatcgatccgcacatcccctttcggcacgctgcagcacgacaggatgtagccctcggcttcgtcctcttcggtaat < 1:4388547‑M2/150‑127 (MQ=255) tATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCActc > 1:442264/1‑150 (MQ=255) ttCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCa > 1:8549886/1‑150 (MQ=255) tCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCAc > 2:4117459/1‑150 (MQ=255) tCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCAc > 2:5929345/1‑150 (MQ=255) tCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCAc > 2:7639077/1‑150 (MQ=255) cAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCAcc > 1:88330/1‑150 (MQ=255) tGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCACCGACAgg > 2:3382789/1‑150 (MQ=255) cGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCACCGACAGGTc > 2:4829152/1‑150 (MQ=255) ggTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCACCGACAGGTCg > 1:4744814/1‑150 (MQ=255) 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ttGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCACCGACAGGTCGTTGATGtt > 2:550126/1‑150 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCACCGACAGGTCGTTGATGtt > 2:4577970/1‑150 (MQ=255) | GACGAAGCCGAGGGCTACATCCTGTCGTGCTGCAGCGTGCCGAAAGGGGATGTGCGGATCGATTACTGATCCAGTGGCCAGTCTGGCTTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGGT‑CATCGCTATCTTCAGGACTGCGGTGAACCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGCTTCTAGGTGCGGAACCGGGCTACCAGGCCATTGAGGTCTACCGCCAGGCGCGACAGCTCGGCACTCGCCGCGCTGGTCTGATGCGCCCCGGTAGCACTCTGCACCGACAGGTCGTTGATGTT > NC_002947/380745‑381041 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |