New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 967853 = | 441 (1.170) | 40 (0.120) | 17/246 | NT | 8.2% | intergenic (‑29/+139) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 967944 = | 502 (1.500) | intergenic (‑120/+48) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
Only 100 of 747 total aligned reads displayed.
TGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTC > NC_002947/967795‑968093 | tGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa > 2:7552310/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa < 2:2194248/150‑1 (MQ=255) caaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatggcctcttcgcgggtaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggcca < 2:5522469‑M2/1‑1 (MQ=255) ggCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAt > 1:8410626/1‑150 (MQ=255) ggCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAt < 1:7697511/150‑1 (MQ=255) ccGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCTGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCa < 2:8713509/150‑1 (MQ=255) ggATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGc > 2:2841297/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGGGTCAGGGGCCTGGCAGGTCCTCCGCGCGTGGGCGGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGACCCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcaca < 1:7859198/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcaca < 2:4799450/150‑1 (MQ=255) cggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCACAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCAcat > 2:6380012‑M1/47‑150 (MQ=255) ggTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCAcatca < 1:4908161/150‑1 (MQ=255) tGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATa < 2:2385545/150‑1 (MQ=255) gcgcggtgttggttggaacgcggcctatgatgtgtggctgagGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACTGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATa > 1:4628797‑M1/43‑150 (MQ=255) gTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCACACATCATAGGc > 2:6737151/1‑150 (MQ=255) gTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTGGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACACGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGc < 1:3480728/150‑1 (MQ=255) tGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCttt < 2:8325210/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccat < 1:2718506/150‑1 (MQ=255) aGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCaa < 2:4513378/150‑1 (MQ=255) tcGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGcc > 1:8062238/1‑150 (MQ=255) ggctggcAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTc < 1:3548972/150‑1 (MQ=255) tggcAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACg < 1:7056531/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGt < 2:6593735/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGttt < 1:6378203/150‑1 (MQ=255) 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TCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTggcggc < 2:6910131‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCa < 1:4301881‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCa < 1:1777134‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCAc > 2:6692684‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCg > 1:6458015‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCg < 2:1528176‑M1/150‑1 (MQ=255) ggtaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCa > 1:2285249‑M2/80‑150 (MQ=255) GGTGACCCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCa > 1:3666553‑M1/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAg < 1:2032895/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACATAg > 1:5019398/1‑150 (MQ=255) 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tttACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCTCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATa < 2:592304/150‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATa < 1:2160925/150‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATa < 1:5530727/150‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 1:8564861‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc < 1:6863071‑M2/137‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 1:2877562‑M2/14‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCg > 2:3728163‑M2/13‑150 (MQ=255) gcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGc < 2:725630‑M2/139‑1 (MQ=255) cgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCGTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCCGCAGGTCCTGATAGCGTCGcc > 2:1875516‑M2/11‑150 (MQ=255) aagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCAt < 2:2960735‑M2/142‑1 (MQ=255) agaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCAtt > 2:5831469‑M2/8‑150 (MQ=255) aggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTcc > 1:5294363‑M2/6‑150 (MQ=255) ggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCt > 2:10825‑M2/5‑150 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt > 2:5312168‑M2/4‑150 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt > 2:2593338‑M2/4‑150 (MQ=255) cATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGt > 2:8785156‑M2/2‑150 (MQ=255) aTCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTc < 2:7102790/150‑1 (MQ=255) | TGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTC > NC_002947/967795‑968093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |