| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 1424596 = | 90 (0.310) | intergenic (‑130/+7) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
GTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGAGTT > NC_002947/1424447‑1424745 | gttgtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCGGTGGTGACCCAGGGGGAGCGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCt > 1:2021546/1‑150 (MQ=38) ttgtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGGACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGGGTGACGGGTGTGGTGGCCCTGGGGGTGCGGGCGTGGCCGCGTAGATGCCTg > 2:2593467/1‑150 (MQ=38) tgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGGGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGAcc > 2:2716245/1‑150 (MQ=255) ttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCACGGACTGTGCAGTGCGTGACGGCGGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGAccag > 2:1553062/1‑148 (MQ=255) tGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGGCGGGTGTGGTGAACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCAGCTAAAGc > 1:7259628/1‑150 (MQ=38) gCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTACTGTGCAGTGGGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAg < 2:7870413/150‑1 (MQ=255) cATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCGTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCACgg > 2:4503105/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTTTTTTTCCCTGTTTTGTGGGTTGCCTGGGGTGGCCTCTTGGGGGGCAGGCCGGCTCCCACCGGTACTGTGCTTTGGTTGACGTCTTTGGTGACCGTGTGGGAGGGGGGGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAgg < 2:1848613/149‑1 (MQ=255) 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tGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGGGTGAGGCTCTGGGGGTAAATGc > 2:599571/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTGGGCTGGCCTCTTAGCGGGCACCCCCCCTCCCACACGTAATGTTCAGAGCGTGACGGCGGTGGTGAACCGGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAACAGGCCGGACCAGCTAATGCAGGGTGTGAGGCGCAGTGGGTAAATTCGAc > 2:2925710/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACTGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGc < 2:1922933/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCCCGCCCACAGGTACGGTGCAGTGCGTGACCGCGGTGGTGACCCCGGGGGAGCGGGCCGGCCCCCGCAGAGGCCGGCCCGGCGAATGCCACGGGGGCGGCGCGGGGGGTAAAAGCGACCCCATCTGcc > 2:1624426/1‑149 (MQ=255) TCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGGGTGAGGCTCGTTGGGTAAATGCGACCGCATCTTCAACTGCa < 1:4256281‑M1/150‑1 (MQ=255) 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gcccgcgaagaggccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTggg < 2:3496243‑M2/135‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCg > 1:2582803‑M2/14‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCCTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCgg < 2:483975‑M2/138‑1 (MQ=255) cgcgaagaggccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGGGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCCTCACGATCGAGCTGTGGGCgg > 2:165383‑M2/13‑150 (MQ=255) gcgaagaggccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGt > 2:66116‑M2/12‑150 (MQ=255) agaggccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTAGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGt < 2:3808053‑M2/143‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCGACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa > 2:7734183‑M2/4‑150 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 1:7602569‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 1:185149‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa > 2:2339754‑M2/4‑150 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 2:2124999‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 1:464577‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 2:3988156‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 2:456110‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa > 1:7923675‑M2/4‑150 (MQ=255) cTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGAGt > 1:1469377‑M2/2‑150 (MQ=255) cTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGAGt > 1:1176764‑M2/2‑150 (MQ=255) | GTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGAGTT > NC_002947/1424447‑1424745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |