New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2053786 = | 169 (0.450) | 30 (0.090) | 15/242 | NT | 15.8% | intergenic (+33/+106) | PP_1821/PP_1822 | glutathione S‑transferase family protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2053877 = | 172 (0.520) | intergenic (+124/+15) | PP_1821/PP_1822 | glutathione S‑transferase family protein/hypothetical protein |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCG > NC_002947/2053729‑2054026 | atcatcgcttacctggatgagcggtttgccgccatctgactgacgctgcagatcCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCt > 2:7543996‑M1/55‑150 (MQ=255) tgtgCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCa < 1:2529376/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGAGGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTGTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCa < 2:7272838/150‑1 (MQ=255) gtgCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAg < 1:4405739/150‑1 (MQ=255) gtgCCGAGGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGGAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAg < 2:1416551/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCACCCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCGCCCCCAAGGGATcgggccgc > 1:1002684/1‑143 (MQ=37) gATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtca > 1:1642903/1‑150 (MQ=255) ggtggGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtcagtc < 1:7821329/150‑1 (MQ=255) ggCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGAt < 2:5808118/150‑1 (MQ=255) gAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATggcg < 1:7757168/150‑1 (MQ=255) gAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATggcg < 2:5543007/150‑1 (MQ=255) cGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAc < 2:1109715/150‑1 (MQ=255) gACCTGTGTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAcc < 2:8615443/150‑1 (MQ=255) cgccatctgactgacgctgcagatcC‑TTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCt < 2:157762‑M1/125‑1 (MQ=255) ccTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGc < 2:1437667/150‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCCCCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCACACCGCt > 2:216950/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCt < 1:4705024/150‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCt > 2:8771403/1‑150 (MQ=255) tGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTc > 1:6812699/1‑150 (MQ=255) gTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCa < 2:5908150/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATcc < 2:1227325/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCACCCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCa < 1:854139/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAgg > 2:2305074/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTaa < 1:2859568/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTaa > 2:8172343/1‑150 (MQ=255) gcTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGc < 2:5320675/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAATCGTTGTGGGAGCGGGCGTTCCAGCGAACACGTGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTTCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCATCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAgaga < 2:3206452/150‑1 (MQ=38) ttGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAAGGGCTCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCCCTCAACCAGGTAACCga > 1:4422929/1‑150 (MQ=37) 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gcgGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGc > 1:6238802/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGc < 1:2732162/150‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCAc > 2:6096405/1‑150 (MQ=255) tGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACtt < 1:1919447/150‑1 (MQ=255) ccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTc > 2:3496162‑M2/33‑150 (MQ=255) ccTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTc > 1:3725853/1‑150 (MQ=255) cTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCa > 1:6069438/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAATGGATCGGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAACCCGCTCATCCAGGTAAGCGAAGGTTGCCTAGGACTCATACATCCAGGTCACCAAGCCGCCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCAcc > 2:2904863/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCg > 2:4141627/1‑150 (MQ=255) ggagcgggcgagcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCg > 1:7508408‑M2/28‑150 (MQ=255) gagcgggcgagcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCgg > 1:5530568‑M2/27‑150 (MQ=255) cgGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGgccg < 1:3627714/150‑1 (MQ=255) gggCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGgccgc < 1:8769993/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCAcc > 2:926692/1‑150 (MQ=255) gcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATg < 1:7110344‑M2/110‑1 (MQ=255) cgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCt < 1:3934164‑M2/137‑1 (MQ=255) ccactaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCGACCTTCCTGCAgg < 1:6626131‑M2/142‑1 (MQ=255) ccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAgg > 1:3878154‑M2/9‑150 (MQ=255) ccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAgg > 1:5648432‑M2/9‑150 (MQ=255) cacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAggg > 2:2799713‑M2/8‑150 (MQ=255) cacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAggg > 1:7798382‑M2/8‑150 (MQ=255) cacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAggg > 1:1160394‑M2/8‑150 (MQ=255) cacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCGTCCTGCAggg > 2:6213394‑M2/8‑150 (MQ=255) acaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTCCAGGGc > 1:5375514‑M2/7‑150 (MQ=255) ggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCaa > 2:5057626‑M2/3‑100 (MQ=255) gGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGc > 1:3229060‑M2/2‑150 (MQ=255) gGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGc > 1:5012652‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCG > NC_002947/2053729‑2054026 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |