| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2055551 = | 100 (0.270) | 29 (0.110) | 9/202 | NT | 29.6% | intergenic (‑52/+123) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2055661 = | 65 (0.240) | intergenic (‑162/+13) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAAC > NC_002947/2055523‑2055809 | gcgACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGGACCCCCTCCTAACGGGGTGTGACAGAGCCCGAAGAAGGCGGGGGGCCTGTAGGAGCGGGGTCACCCCCGCAGAGGCCCCCCCACGTTACGCAAAACcaacaaa > 2:5948229/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGGCGTTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACGGGTATGTCACAGACCCCTAACAGGGGGGGTTGCCTTTTGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTg < 2:7513705/150‑1 (MQ=38) tgtgGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCATCGCGGGTGAACCCCCTCCGACCGGGCAGGAACCCAGCCCGCACACCGCGGGGTGCCGGGACGAGCGGGTTCACCCCCCAACACGCCCCCCCAGGGTACGCAAAACCATCAATCGGGc > 2:8483099/1‑150 (MQ=255) gggCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGTGCCCGCTCCTACGGGGGTGTGACCGGGCCCCGAGAAGGCGGGGTGCCTGTGGGAGGGGGTGGACCCCCGAAGAGGCCCCCACCCGTTAAGCCAAAACAGCAAACGTGcttgt > 2:4157618/1‑148 (MQ=255) CTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCACCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTgcggc > 2:7235670‑M1/1‑150 (MQ=255) gCGGCCCGCTGCGGGGGTCACCCCGCCCCGCGGGGGATGTCACCGCGCCGGAAGAGGGGGGGGGGCCTGTCGGCGGGGGTTACCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACa < 2:4733491/150‑1 (MQ=255) gggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacaggcaccccgccgtcttcgggctctttgacatccccgtaggagcggggtcacccgccaagaggcccgcacacgCTACGCAAAACCAACCATCGTGCGTCTTCATCAGGTGCGGCGACAgg > 2:7816128‑M2/104‑150 (MQ=255) gcctcttcgcgggtgaaccccctcctacaggcaccccgccgtcttcgggctctgtgacatccccgtaggagcgggttcacccgcgtagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAAACGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACCGGtt > 2:5119316‑M2/102‑150 (MQ=255) gcctcttcgcgggtgaaccccctcctacaggcacccccccgtcttcgggctctgtgacaaccccggaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcccaggTTACGCAAAACCCTCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGtt > 2:4931841‑M2/102‑150 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGATCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGtt < 2:3510858‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTGAACCCCCTCCTACGGGGATGGCACAGAGCCCGCAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACACGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCAAAAGGGGCGGCGACAGGtt < 2:2037960‑M1/150‑1 (MQ=255) TCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACACGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTAATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAg < 1:2096868‑M1/150‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGTGAAACCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCCAAGACGGCGGGGTGCCAGTAGGAGCGGGTTCACCCCCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAAACATCAAAAGTGCGTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGc > 2:3747406/1‑150 (MQ=255) 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2:2838004‑M2/127‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAgccagcca < 2:5259561‑M2/129‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAgccagcca > 1:6963731‑M2/22‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAgccagcca > 1:5170243‑M2/22‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAgccagcca > 1:8580245‑M2/22‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAgccagcca > 2:2317285‑M2/22‑150 (MQ=255) gcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCCCg > 1:6076389‑M2/20‑150 (MQ=255) gcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACg > 1:4879105‑M2/20‑150 (MQ=255) gcgaagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACg < 2:4946995‑M2/131‑1 (MQ=255) aagaggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTg > 2:1673616‑M2/17‑150 (MQ=255) aggcccgcacaggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAgg < 1:5959452‑M2/137‑1 (MQ=255) 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aggTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACa > 2:247403‑M2/4‑150 (MQ=255) | GTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCACAGCAGCAACAAGCCAGCCACGGTGAGGATGCTGGACAAC > NC_002947/2055523‑2055809 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |