New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2060970 | 242 (0.640) | 24 (0.070) | 10/244 | NT | 11.1% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
? | NC_002947 | = 2061044 | 169 (0.510) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGGGCTT > NC_002947/2060895‑2061192 | gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGCGCCGACCTTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGTAATCCGCGGAGGAGCGGGTT‑c > 1:4169967/1‑150 (MQ=255) cAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Ca < 2:1445663‑M2/150‑2 (MQ=255) aGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cac > 1:4136081‑M2/1‑148 (MQ=255) aGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cac > 1:2704871‑M2/1‑148 (MQ=255) aGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACATTGGGATATAACTGC‑CCTCAGGTTCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cac < 2:2091711‑M2/150‑3 (MQ=255) gAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacc > 1:8278010‑M2/1‑147 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgc > 2:1583914‑M2/1‑144 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgc > 1:6764478‑M2/1‑144 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaa > 2:4006645‑M2/1‑141 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaa > 2:3930063‑M2/1‑141 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGAGATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGGAGGAGCGGGGT‑Cacctgcgaa < 1:283566‑M2/150‑10 (MQ=255) gATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACATTGGGATATCACAGC‑CCGCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccccgaag < 1:5260829‑M2/150‑11 (MQ=255) tgtgCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaagag > 2:3184931‑M2/1‑138 (MQ=255) gAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCa > 2:6019967/1‑150 (MQ=255) gggaacGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGt > 2:2859846/6‑150 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGGGTAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 1:7898677/1‑150 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGGGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 2:5029663/1‑150 (MQ=255) tGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CAACCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGc > 2:6967100/1‑150 (MQ=255) 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tacccAACTGCAACGGCCTCTTCGGGGTTAAACCCGCTCCTCCTTTGGTATATCAGTGC‑CCCCTGGTGCTGTTACAGGGTGAAATCCGCGTTGGTGCGGTTT‑CACCCGCTAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCaa < 2:8658425/147‑1 (MQ=255) aTCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAAc > 2:4727557/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggta < 2:8478559‑M2/150‑53 (MQ=255) aaCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCaa > 2:7895817/1‑149 (MQ=255) cAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACATTGGGATATCACAGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGGT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAAGCAAACCCTcccca > 2:7353918/1‑149 (MQ=255) aaCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑AACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCCACCCATccccaa > 2:5922743/1‑148 (MQ=255) agggCCTCTTCGGGTTTAAACCCGCTCCTACTTTGTTTTATCAGTGC‑CCTCTGGTGCTGTGACTGTGTTAAATCCGCTTTGGTGGGGGTT‑CACCCGCTATGTGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTAc < 2:4267173/148‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTg > 2:627765/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCAACATTTGGATATCACAGC‑CCACAGGGGCAGTGACACGGGGAAAACCGCGGAGGAGCGGGTT‑AACCCCCCAAGACGCCCGCCCACCTCCCCACAAGGCCACCCCAAGCAACCCAACCCCAACAgg > 1:6532097/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat < 2:3694193‑M2/150‑66 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat < 2:3073330‑M2/150‑66 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcgc > 1:5427987/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcgc > 1:6416844/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcgc > 2:1251012/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAATAGGGATATAACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACATGGTGAAATACGCGTAGGAGCGGGTT‑CACACGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAACGCCACCCCATGCAACCCATCCCCAACTGGCGCCt > 1:5500511/1‑150 (MQ=255) 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cccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Tacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgca < 1:2979578‑M2/150‑80 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcac < 1:3236644‑M2/150‑81 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc > 2:2838396/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc > 2:2408027/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Cacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacg < 2:7004371‑M2/150‑82 (MQ=255) 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ggATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGc > 1:7617203/1‑150 (MQ=255) cctgtCACTGCACCTGAGG‑GCAGTGATAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGcc > 1:3342756/5‑150 (MQ=38) tatCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCct > 1:2246005/1‑150 (MQ=255) tCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgc > 1:379840/1‑150 (MQ=255) c‑ccTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Tacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtggtccatcaa < 2:4928709‑M2/150‑106 (MQ=255) c‑ccTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑Tacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtggtccatcaa < 2:5457858‑M2/150‑106 (MQ=255) ccTCTGGTGCAGTGACTGGGTTAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGATGTGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTc < 2:7932434/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCca > 1:1161585/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcacc > 2:4604364/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgca > 2:2615185/1‑150 (MQ=255) cAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgcacc > 1:3893687/1‑150 (MQ=255) aGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgcaccg > 1:4802402/1‑150 (MQ=255) gTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGt > 2:444705/1‑150 (MQ=255) tGACTGGTTGAACGCGGCGTTGGCGGGGTTT‑CACCCGCGACGTGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGtt < 2:2116826/150‑1 (MQ=255) gggTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTgg > 2:8451298/1‑150 (MQ=255) ggTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgc > 2:4914114/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg > 1:5616388/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg > 2:1013686/1‑150 (MQ=255) tGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc < 1:2472367/150‑1 (MQ=255) tGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc > 2:2308994/1‑150 (MQ=255) tGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc < 2:1288571/150‑1 (MQ=255) aaaTCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTg > 1:4644607/1‑150 (MQ=255) aagccGCGTAGGCGGGGGTC‑CCCCCGCGAAGCGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGt < 2:3441726/147‑1 (MQ=255) aTCCGCGTAGGCGGGGGTT‑CACCCGCGAAGTGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTa < 2:6409388/150‑1 (MQ=255) tCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTAc > 1:6221257/1‑150 (MQ=255) gcgTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCACCCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 1:6024176/1‑150 (MQ=255) gcgTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 1:7078216/1‑150 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGa > 2:7252780/1‑150 (MQ=255) ttcgcggGTA‑Aacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtggtccatcaacgcaatggccatcatcgcctcggcaatcggcgtg < 2:7746538‑M2/147‑140 (MQ=255) ttcgCGGGTG‑AACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGacca > 1:5385125/4‑150 (MQ=255) gTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGGGc < 2:1751171/150‑1 (MQ=255) gTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGGGc > 2:1137981/1‑150 (MQ=255) | GCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTT‑CACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGGGCTT > NC_002947/2060895‑2061192 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |