| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5821876 | 117 (0.310) | 34 (0.100) | 14/240 | NT | 24.2% | intergenic (+57/+72) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
| ? | NC_002947 | = 5821903 | 111 (0.340) | intergenic (+84/+45) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
AAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGC > NC_002947/5821754‑5822052 | aaGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTcaca < 1:6921457/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 2:4497471‑M2/1‑143 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 2:5401660‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 2:5226659‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 1:3353807‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 2:8697464‑M2/1‑142 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg > 1:1040796‑M2/1‑141 (MQ=255) tggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagc > 2:4784577‑M2/1‑137 (MQ=255) gCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgg > 1:8034675‑M2/1‑135 (MQ=255) gCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgg > 2:1749505‑M2/1‑135 (MQ=255) gCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgg > 2:6119477‑M2/1‑135 (MQ=255) cAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggc > 2:5718811‑M2/1‑133 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcg > 1:5045535‑M2/1‑132 (MQ=255) aGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgcgc < 2:3612228/150‑1 (MQ=255) tgcCTAAAGAGCAGCTGGTGTGTCTGGCCATGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGTTCCCGGCCCCTTCGGGGGCACGCCCGCTCCCACG‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACTTTTGGGCGGGGGCGCGCCCGCGaa < 1:6001234/150‑1 (MQ=255) tgcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaa < 2:4371287/150‑1 (MQ=255) tgcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCCCACGGTA‑CGCGTCGGGCGCGCGCGCCGCGCCCCAACCGGTGGGCGCGGGCGCGCCcccgcc > 1:7014080/1‑148 (MQ=255) gcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCA‑GGTAGCGCGTCGCGCTCGCCCGCCGCTCACCTAACTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaaa > 2:1012211/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTGGCGCGCGCAGCTCACCTGCCGGTGGGAGCGGGGGCGCCCCCGCAAggg > 2:2544872/1‑150 (MQ=38) gAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCGCCCGCGCAGCGCACATACCCGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCCAggg > 2:8146971/1‑150 (MQ=38) agcagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCA‑CGTAGCGCGTCGCGCGCGCGCGCACCTCACATACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAAAGGGCCatt > 2:2522537/1‑150 (MQ=255) agcagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCttt < 2:881463/150‑1 (MQ=255) gcagcTGAGTCTGGCCAAGCTTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg < 2:1178674/150‑1 (MQ=255) gcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg < 2:1478889/150‑1 (MQ=255) gcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg < 2:1478655/150‑1 (MQ=255) ccagcTGAGTCTGGCCAAGTGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑CCTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg < 2:4750090/149‑1 (MQ=255) tGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCGCCCCCA‑GGGAGCGCCTCGGGCGCCCGCGCAGCACACAAAACTGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCCCAAAGGCCCTTTCAGCtaca > 1:8740706/1‑149 (MQ=255) gAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCCCC‑GGGAGCGCGTCGCGCGCGCGCGCAGCTCACATACCGGTGGGGGCGGGCGCGCCCCCGCAACGGCCTTTGCCGGgacga > 2:157971/1‑148 (MQ=255) tgTCTGGCCTAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGGGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGtactac < 2:6635972/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCGGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACaa < 2:379767/150‑1 (MQ=255) tGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGc < 2:495973/150‑1 (MQ=255) cAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCttt < 2:3131623/150‑1 (MQ=255) aGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGa < 1:5723762/150‑1 (MQ=255) ttAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCaa < 2:3105330/150‑1 (MQ=255) gcgcTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCt < 1:6528032/150‑1 (MQ=255) gcgcTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCt < 2:2761620/150‑1 (MQ=255) gcTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATCCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCa < 1:2625659/150‑1 (MQ=255) gcTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCa < 2:6786338/150‑1 (MQ=255) tATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCA‑GGTAGCGCGTCGCGCTCGCGCGCCGCGCACAAACCAGTGGGCGCGGGGGCGCCCGCGCAAGGGCCTTTTCAGGGACTACAAGCCATTGATCAAACCGCGCGCCcacacc > 2:1232099/1‑148 (MQ=255) ccGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAAc < 2:3639564/150‑1 (MQ=255) ccGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAAc < 1:2122002/150‑1 (MQ=255) ccccTGCGCGGGCACGCCCGCGCCCACT‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGccc < 1:3691077/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagc < 2:6950125‑M2/129‑80 (MQ=255) 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ccGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATc < 2:8276567/150‑1 (MQ=255) cGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggcc < 1:7236346‑M2/150‑110 (MQ=255) gCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACCtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggcca < 1:25583‑M2/150‑111 (MQ=255) gCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGGACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCGCCATCGGCAGCATccc > 1:5320339/1‑150 (MQ=255) cTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccac < 2:847810‑M2/150‑112 (MQ=255) tCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccacc < 2:62846‑M2/150‑113 (MQ=255) tCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggcctgtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccacc < 2:933767‑M2/150‑113 (MQ=255) tCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagcagctgctctttcggcagcacccgcttggccccc < 1:1951483‑M2/150‑113 (MQ=255) tCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATccccg > 2:8526685/1‑149 (MQ=255) tCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATcccc < 2:6008548/149‑1 (MQ=255) 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ccACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagc < 1:7943312‑M2/133‑98 (MQ=255) ccACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagc > 2:7943312‑M2/1‑36 (MQ=255) ccACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcgtggccaccac < 2:39583‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCCGGTACTACAAGCCGTTGATCAACCCTCGCTCCCGCAGCCGCCGCAACGCCCCCGCCCTCGTCAGCCTCCCCGcc > 1:8371873/1‑150 (MQ=255) ccACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAAGCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCAACCCCAcc > 1:4316148/1‑150 (MQ=255) ccACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc > 1:5843301/1‑150 (MQ=255) ccACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCAACGTCAGCATCCCCTcc > 2:7091816/1‑150 (MQ=255) caca‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacg < 2:6482370‑M2/150‑116 (MQ=255) caca‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg > 2:8418992/1‑150 (MQ=255) caca‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCACGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCAACCCCTccg > 1:1830260/1‑150 (MQ=255) a‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtag < 2:4119911‑M2/150‑119 (MQ=255) a‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgccg > 1:6304684/1‑150 (MQ=255) a‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCT‑‑‑cctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgctt < 2:4865496‑M2/150‑122 (MQ=255) gTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtg < 1:4224681‑M2/150‑121 (MQ=255) gTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCACCATCGTCAGCATCCCCACCgccgcc > 2:7999525/1‑150 (MQ=255) cgcgTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATCCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGccgccccgc < 1:2407114/150‑1 (MQ=255) cgcgTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCGCCATCGTCAGCATCCCCTCCGccccccccc > 1:5946752/1‑148 (MQ=255) gTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCt < 2:3716267/150‑1 (MQ=255) tCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATACCCAACGCccccccccccgg > 1:2920174/1‑148 (MQ=255) cGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGc < 1:4917667/150‑1 (MQ=255) cGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGc < 2:4770632/150‑1 (MQ=255) tctcGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagta < 1:1648001‑M2/150‑133 (MQ=255) tctcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCAACCCCTCCGCCGCCCCGCCCGGCATc > 2:4783531/1‑150 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCCGCCTCCGCAACGCCCCCGCCCTCGTCAGCATCCCCGCCACCGCCCCGCCCGGCCTCAc > 1:5176726/1‑150 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCAc < 1:2023183/150‑1 (MQ=255) cgcgcgCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACt < 2:7262180/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttaggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggc < 1:6989989‑M2/150‑137 (MQ=255) cgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGa < 2:835536/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 1:1340350/150‑1 (MQ=255) gCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACaa < 2:1722423/150‑1 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTgc < 1:4788340/150‑1 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACGGAAGACAACTgc > 2:1691673/1‑150 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCGGCATCACTGAAGCCCACTgc > 2:3420036/1‑150 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCACCGCCGCCCCGCCCAGCAACACAGAAGACAACAgc > 1:697422/1‑150 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCATTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCACCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAACACAACTgc > 2:4425438/1‑150 (MQ=255) caTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCAGCAACACTGAAGACAACAgcg > 1:2054570/1‑150 (MQ=255) aTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCAGCATCACTGAAGACAACAgcgc > 2:8730975/1‑150 (MQ=255) | AAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGC > NC_002947/5821754‑5822052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |