| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6004654 = | 406 (1.080) | 5 (0.010) | 5/260 | NT | 1.3% | coding (184/1428 nt) | PP_5256 | cyclic nucleotide‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 6004694 = | 359 (1.010) | coding (224/1428 nt) | PP_5256 | cyclic nucleotide‑binding protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
CTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTCCTCGCCGCCGTGGTCGCGGCCGCAG > NC_002947/6004546‑6004843 | cTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTa < 2:2123503/150‑1 (MQ=255) catcctgcagcaagcgcccgccatggctgccacgggccaccagcaacaggccgaataccacggttaccgtgcgcgcaccgaacagccaccagccgatggccaataCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTg > 1:474348‑M1/106‑150 (MQ=255) aTCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTg < 1:7843658/150‑1 (MQ=255) ccccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGc > 2:186155/1‑150 (MQ=255) cccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGcc > 2:2369497/1‑150 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATTGCCACGGTATTGGCCa > 2:8105011/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCg < 1:1769104/150‑1 (MQ=255) tgatgcgcCAGGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCg > 1:7972229/5‑150 (MQ=255) tCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCgg > 1:3406800/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCgg > 1:7091922/1‑150 (MQ=255) gatgcgcCAGGCATGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCgg > 2:6964606/4‑150 (MQ=255) cAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGc < 2:4325224/150‑1 (MQ=255) gcgcCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtg < 2:2668634/150‑1 (MQ=255) gcCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtggt > 2:6832473/1‑150 (MQ=255) gcCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtggt < 1:1619985/150‑1 (MQ=255) gcCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtggt > 2:5306272/1‑150 (MQ=255) cATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtggtgg > 1:4224365/1‑150 (MQ=255) cATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtggtgg < 1:7593917/150‑1 (MQ=255) cATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCCGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtggtgg > 1:6365340/1‑150 (MQ=255) aTGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGc > 2:4918054/1‑150 (MQ=255) tGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTc < 1:2834105/150‑1 (MQ=255) tGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTc > 1:2587024/1‑150 (MQ=255) gcgcATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCgg > 2:663796/1‑150 (MQ=255) 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cgcgcgcCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCAc < 2:3340921/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCAc > 2:1534468/1‑150 (MQ=255) cgcgcCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACgg < 2:190537/150‑1 (MQ=255) ggTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTTCAACCTCCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAAcctt < 2:3013301/150‑3 (MQ=255) gTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCCGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCTCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGTTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGTTAACCGTg < 1:4796790/150‑1 (MQ=255) gTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCAGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGCTAGTGGCCCTCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTg > 2:4711218/1‑150 (MQ=255) tGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTgg < 2:1022825/150‑1 (MQ=255) cTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTAtt > 1:8793811/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTAtt > 1:1940107/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTc > 1:245787/1‑150 (MQ=255) 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ttCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTg > 2:8742419/1‑150 (MQ=255) cAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCt > 2:7491273/1‑150 (MQ=255) aGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCtg < 1:512236/150‑1 (MQ=255) gCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCtgg < 2:6501606/150‑1 (MQ=255) cTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCtggt < 2:8474837/150‑1 (MQ=255) 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ccgccgTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGAtgtg < 1:2280586/150‑1 (MQ=255) ccgccgTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGAtgtg > 1:4361695/1‑150 (MQ=255) cgccgTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGCGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGc > 1:503526/1‑150 (MQ=255) cgccgTGGCCCGACGATGTCTCACGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGc > 1:6643675/1‑150 (MQ=255) aGTGGCCCGACGATGTCTCGCGAAAACTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACTGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCACGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGAGGTGCTgg < 2:8340953‑M1/149‑1 (MQ=255) GTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTggg > 1:272860‑M1/1‑150 (MQ=255) CCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGt < 1:8547219‑M1/150‑1 (MQ=255) cgacgaTGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGtt > 1:3698913/1‑150 (MQ=255) cgacgaTGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCACTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGtt < 2:7556019/150‑1 (MQ=255) gaTGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATc < 2:3189064/150‑1 (MQ=255) aTGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCt > 1:7226026/1‑150 (MQ=255) gTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTc < 1:3833443/150‑1 (MQ=255) gTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTc < 1:3389360/150‑1 (MQ=255) gTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTc < 2:8185199/150‑1 (MQ=255) ctcGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGACATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTACCt > 1:6876598/1‑150 (MQ=255) tcGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTCCTc > 2:1189901/1‑150 (MQ=255) tcGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTCCTc > 2:4158618/1‑150 (MQ=255) ccTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGc > 1:2974211/1‑77 (MQ=255) ccTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGc < 2:2973782/77‑1 (MQ=255) ccTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTCCTCGCCGCCGt < 2:5691313/150‑1 (MQ=255) ggccacggTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTCCTCGCCGCCGTGGTcgc < 2:3119973‑M2/142‑1 (MQ=255) gTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTCCTCGCCGCCGTGGTCGCGGCCGCa > 2:5478688‑M2/2‑150 (MQ=255) | CTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGGCTGTTCGGTGCGCGCACGGTAACCGTGGTATTCGGCCTGTTGCTGGTGGCCCGTGGCAGCCATGGCGGGCGCTTGCTGCAGGATGTGCTGGGGGCGTTGATCTTCCTCGCCGCCGTGGTCGCGGCCGCAG > NC_002947/6004546‑6004843 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |