| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 2,827,887 | G→C | 5.1% | A156A (GCG→GCC) | curA → | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,827,887 | 0 | G | C | 5.1% | 1140.1 / 35.5 | 333 | A156A (GCG→GCC) | curA | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (154/162); new base C (11/6); total (165/168) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 347 total aligned reads displayed.
CTGTCCGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGA > NC_002947/2827738‑2828036 | tCCGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTggcggcg < 1:1711180/150‑1 (MQ=255) tCCGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTggcggcg < 1:7897879/150‑1 (MQ=255) cGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGTCGGACGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTggcggcggc > 1:232677/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |