| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,868,821 | T→G | 15.1% | S297A (TCG→GCG) | gllR → | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,868,821 | 0 | T | G | 15.1% | 753.4 / 49.0 | 325 | S297A (TCG→GCG) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (108/157); new base G (51/6); total (162/163) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
GCCTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCT > NC_002947/2868673‑2868970 | ccTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCg > 1:8278163/1‑150 (MQ=255) ccTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCg > 2:57401/1‑150 (MQ=255) tCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGcc > 2:7181908/1‑150 (MQ=255) cACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCg > 1:5821537/1‑150 (MQ=255) cGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGc < 1:5621952/150‑1 (MQ=255) cGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGc < 2:2894021/150‑1 (MQ=255) aCTCTGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGccc < 2:7864321/150‑1 (MQ=255) aCTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGAGCCGGccc < 2:1224937/150‑1 (MQ=255) tATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCGGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGccccg > 2:8536104/1‑148 (MQ=255) aTGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTc < 1:4761697/150‑1 (MQ=255) aTGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGAGCCGGCCCgcg < 2:4497308/150‑3 (MQ=255) tGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCa > 2:3650487/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCCGCCCGGCa > 2:5535194/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAg < 2:218545/150‑1 (MQ=255) gCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGTACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGGCAgcggc > 2:6094082/1‑150 (MQ=255) cGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAgctgct < 2:4029988/150‑1 (MQ=255) tctcGAGCCGATCATCAACGAGGAATTGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGAACCCGCTGTTGCACACTCACCTGTCGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTg < 1:3325792/147‑1 (MQ=255) gAGCCACTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGTCCGCTGCTCGACAACTGCGTc > 1:1136970/1‑150 (MQ=255) tcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCgg < 1:6461671/150‑1 (MQ=255) tcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCgg < 1:7649784/150‑1 (MQ=255) tcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCgg < 1:5481676/150‑1 (MQ=255) aCGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGcc < 1:2347283/150‑1 (MQ=255) aCGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCCGCCCGGCAGCTGCGCGACAACAGCATCGCCCCCGCGGGcc > 2:591137/1‑150 (MQ=255) cGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCCTCAGCAGCTCGACAACAGCTTAGCCGCCGCGCGccg > 2:1546321/1‑149 (MQ=255) gAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACa < 1:8471156/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCCGCGCCCCGGCCCCGCCCCTGCGCGACAACAGCGTCGCCCCCGCGGGCCAGACaccc > 2:4553477/1‑147 (MQ=255) ggtggtGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGcc < 1:1729205/150‑1 (MQ=255) ggtgCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGTCAGCGGCTCGACCACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCGGACAGCGCCGTg > 1:700662/1‑150 (MQ=255) catgaggCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCCGCCCGGCCGCTGCGCGACAACAGCTTAGCCCCCGCGGGCCAGACCGCCCCgggg > 2:3382995/6‑150 (MQ=255) tgCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGc < 1:3368015/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGAAAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGcc > 1:2099433/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCGGCTCGCCAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCAGACCGCCCCGGGGcc > 1:3850039/1‑150 (MQ=255) gCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCggtg < 1:677413/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCggtggt < 2:4316780/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCTGCTCGACAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCGGACCGCGCCGGGGCCggtggt > 1:8176091/1‑150 (MQ=255) cGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGgtggtg < 2:1605601/150‑1 (MQ=255) cGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGgtggtg < 1:5072389/150‑1 (MQ=255) cGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGgtggtg < 1:1431401/150‑1 (MQ=255) gTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGtggtgg < 2:3002758/150‑1 (MQ=255) gggggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGaaa < 2:2331615/150‑1 (MQ=255) gggggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCACGCCGGCCCGTCAGCGGCTCCACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACACCGCCGGGCCCGGgggtgggac > 1:7808608/1‑147 (MQ=255) gCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCCGCAGCTCGACCACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGAAAgcgc > 1:3656213/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCCGCTGCTCGACAACTGCTTAGCCGCCGCGGGCCGGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGTAAGCGCTg > 1:6701081/1‑150 (MQ=255) cccGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCGTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGa > 1:2987827/1‑150 (MQ=255) ccGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGAt > 1:8799304/1‑150 (MQ=255) gTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGc < 2:7751762/150‑1 (MQ=255) gTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGc < 1:1823360/150‑1 (MQ=255) gCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGGGGAAAGCGCTGATCTGGCGGt > 1:1141991/1‑150 (MQ=255) 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ccTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCCGCCCGGCAGCTGCTCGACAAAAGCTTAGCCGCCGCGGGCCGGACAGCCCCCGGGCCGGGGGGGGTAAGCGCTGATCTGGCGGTTATACGTgg > 2:1795008/1‑150 (MQ=255) cTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGc > 1:5693576/1‑150 (MQ=255) gCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACt < 1:4817204/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTg < 2:6660679/150‑1 (MQ=255) tCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGGCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCGGCTCGACACCAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGTCAGCGCCGTGGCCGGGGGGGGGAAGCGCTGATCTGGCGGGTATCCGTGGCCGACTgg > 2:3765827/1‑150 (MQ=255) 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1:5304023/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATg < 1:2588013/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACAGCTGCGCCCCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGAAAGCGCGGCTCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGGTCGGACAAGc > 2:7447953/1‑150 (MQ=255) gcTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTggcgg < 2:3569903/150‑1 (MQ=255) gcTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTggcgg < 2:1431807/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTggcggc > 1:2695145/1‑150 (MQ=255) gggTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGcggcgg > 1:7914364/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTTGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCt < 1:746918/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTg < 1:4338837/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTg < 1:798943/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTgc < 1:4553477/150‑1 (MQ=255) tgacgGGCCGGCGAGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTgcg > 2:8675910/4‑150 (MQ=255) tgacgGGCCGGCGAGCCGGCCCGCCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTgcg > 2:2500356/4‑150 (MQ=255) acgGGCCGGCGAGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACa > 1:32042/2‑61 (MQ=38) acgGGCCGGCGAGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACa < 2:32042/60‑1 (MQ=38) cgGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCAc < 1:4016431/150‑1 (MQ=255) cgGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCAc < 1:8333270/150‑1 (MQ=255) cgGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCAc < 1:8536104/150‑1 (MQ=255) cgGGCCGGCGAGCCGGCCCGCCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCAc > 2:7153650/1‑150 (MQ=255) gggCCGGCGAGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCAcc > 1:1259928/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCa < 2:2383126/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCa > 2:2053765/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGAGCCGGCCCGCCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCa > 1:4482156/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGAGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCa > 2:5045236/1‑149 (MQ=255) cGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGtt < 1:1345909/150‑1 (MQ=255) ggCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTg < 2:1755976/150‑1 (MQ=255) gCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTgg < 2:4439862/150‑1 (MQ=255) | GCCTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCGCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCT > NC_002947/2868673‑2868970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |