| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,951,580 | G→C | 5.7% | P312A (CCG→GCG) ‡ | yijP ← | phosphoethanolamine transferase CptA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,951,580 | 0 | G | C | 5.7% | 1112.8 / 41.4 | 332 | P312A (CCG→GCG) ‡ | yijP | phosphoethanolamine transferase CptA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (156/155); new base C (14/5); total (170/162) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.83e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
ATTCTGGTTGCGCTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGTTGGGCGTGG > NC_002947/2951431‑2951729 | aTTCTGGTTGCGCTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACgg > 2:4854160/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGACTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCt > 2:4987619/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGa < 2:5652006/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGa < 1:7921250/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACCCGTCGCTGat < 1:6251015/150‑2 (MQ=255) cgcTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAgg < 2:4510680/150‑1 (MQ=255) gcTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGa > 2:2424682/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGaaa > 1:2078333/1‑150 (MQ=255) ttgttCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACgg > 1:5123080/1‑150 (MQ=255) tCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCg < 2:8196100/150‑1 (MQ=255) tCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCg > 1:8627823/1‑150 (MQ=255) aGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCggg > 2:3699114/1‑150 (MQ=255) aGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCggg > 1:5035353/1‑150 (MQ=255) ggTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTTATCAAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCATCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGt < 1:646279/150‑1 (MQ=255) gTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGACACGGTCCGGGtt > 1:2586389/1‑150 (MQ=255) cacCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTg < 1:7870959/150‑1 (MQ=255) acCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGc > 2:6902030/1‑150 (MQ=255) acCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGc > 2:7038677/1‑150 (MQ=255) cGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCtc < 1:4520603/150‑1 (MQ=255) cGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCtc < 1:4861756/150‑1 (MQ=255) tCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCg > 2:7945059/1‑150 (MQ=255) tGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGaa > 2:8532005/1‑150 (MQ=255) tttGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACg > 2:1190297/1‑150 (MQ=255) tgctgcGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTg < 2:3854894/150‑1 (MQ=255) gctgcGAGAAGGTGGATAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGTTTGGTGATCCATAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCCGGTGGATCAGCTACGTGCCGCTGAGGACACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGACCGTGa < 1:1532928/150‑1 (MQ=255) ctgcGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCAGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAg > 2:60205/1‑150 (MQ=255) tgcGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAgg > 1:3726675/1‑150 (MQ=255) tgcGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAgg < 2:5125035/150‑1 (MQ=255) cGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGTAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGAt > 2:5467867/1‑150 (MQ=255) cGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGAt < 1:8411980/150‑1 (MQ=255) aaGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATctgc < 1:3169534/150‑1 (MQ=255) ggtggtGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATctgctg < 2:273451/150‑1 (MQ=255) ggtggtGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATctgctg < 2:7331858/150‑1 (MQ=255) gtggtgAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGACACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCtgctgc > 1:5861288/1‑150 (MQ=255) ggtgAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCAt < 2:4113288/150‑1 (MQ=255) gtgAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATc < 2:3000413/150‑1 (MQ=255) tgAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCa > 2:6574463/1‑150 (MQ=255) gAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCAc < 2:4704215/150‑1 (MQ=255) tGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGa < 1:4370785/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGgtg < 2:1651954/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTa > 2:3620033/1‑150 (MQ=255) gcTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCATCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACg > 1:3448317/1‑150 (MQ=255) gcTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACg < 2:6705525/150‑1 (MQ=255) gcTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACg > 1:6177132/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACgg > 1:7337368/1‑150 (MQ=255) gTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGgcgc < 1:8753169/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGcgcg > 1:8057645/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGcgcg < 1:3895550/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGcgcg > 1:2032618/1‑150 (MQ=255) aaGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCgcggc < 1:7148233/150‑1 (MQ=255) aaGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCgcggc < 1:32868/150‑1 (MQ=255) aaGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCgcggc < 1:6735940/150‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGa < 2:2517529/150‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGa < 1:4310770/150‑1 (MQ=255) tgctgGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATAcc > 2:1257553/1‑150 (MQ=255) tgctgGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATAcc > 2:7302368/1‑150 (MQ=255) gctgGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCa > 1:7511172/1‑150 (MQ=255) gctgGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCa < 2:1795420/150‑1 (MQ=255) tGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGa > 2:2192721/1‑150 (MQ=255) cAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACg < 1:6902030/150‑1 (MQ=255) aGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACgg > 2:142854/1‑150 (MQ=255) gAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGt > 2:7003936/1‑150 (MQ=255) aaGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTc < 2:3356579/150‑1 (MQ=255) aaGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTc > 1:2994572/1‑150 (MQ=255) aaGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTc > 2:7840209/1‑150 (MQ=255) aGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCa < 2:15870/150‑1 (MQ=255) gTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAgg < 2:4325041/150‑1 (MQ=255) tCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGc < 1:572357/150‑1 (MQ=255) ttGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGctc < 2:7516368/150‑1 (MQ=255) ttGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGctc < 1:3953709/150‑1 (MQ=255) gcctgcctGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTc < 1:5498982/150‑1 (MQ=255) ctgcctgTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGc < 2:7683130/150‑1 (MQ=255) tgcctgTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCt < 1:3620033/150‑1 (MQ=255) ctgTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTggc < 1:4102303/150‑1 (MQ=255) tgTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGACCACGGTCAGGCTCTTGTCGCTggcg > 2:6320425/1‑150 (MQ=255) tgTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTggcg < 2:8420482/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTggcgg < 1:2915478/150‑1 (MQ=255) cagcagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAg > 2:5891079/1‑150 (MQ=255) cagcagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCCCTTGTCGCTGGCGGCCAg > 2:609060/1‑150 (MQ=255) agcagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgc > 2:4579900/1‑150 (MQ=255) agcagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgc > 1:6549223/1‑150 (MQ=255) gcagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgcg > 1:6067119/1‑150 (MQ=255) gcagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgcg > 2:5818558/1‑150 (MQ=255) gcagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgcg > 1:1005229/1‑150 (MQ=255) cagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgcgc > 1:1338869/1‑150 (MQ=255) cagGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgcgc > 2:1881381/1‑150 (MQ=255) agGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCCGCCAgcgac < 2:4147653/150‑3 (MQ=255) gtagATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTAGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTc > 2:862056/4‑150 (MQ=255) gTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTc < 1:5400506/150‑1 (MQ=255) ttGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTTGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCCGCGCGTCg > 2:3502646/1‑150 (MQ=255) tGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAgcgacaaga < 2:5272013/150‑7 (MQ=255) tGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGa < 1:229932/150‑1 (MQ=255) tCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGt > 1:3402510/1‑150 (MQ=255) tCAGCGACCCGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGt > 1:7745932/1‑150 (MQ=255) tCAGCGACCCGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGt > 1:5938734/1‑150 (MQ=255) tCAGCGACCCGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGt > 1:205920/1‑150 (MQ=255) tCAGCGACCCGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGt > 2:8745076/1‑150 (MQ=255) cAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGtt < 2:5035353/150‑1 (MQ=255) gCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGTTgg < 1:1782806/150‑1 (MQ=255) gggTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGTTGGGCgtg > 2:7102529/1‑150 (MQ=255) | ATTCTGGTTGCGCTGGTTGTTCAGGTACACCGGCGCGTCTGTTTGCTGCGAGAAGGTGGTGAGCATGGTGTTGCGCTTGGTCAAGGTCTGCTGGTTGGTGATCCAGAAGGTCTTGTAGCCTGCCTGTTTCAGCAGGTTGATCAGCGACGGGTCGCTGAGGAAACGGTCCGGGTTCTGCTCGTCGCCGAACGTGAGGATCTGCTGCATCACTTCGATGGTGTACGGGCGCGGCGATACCACGTCGCGGAACACGGTCAGGCTCTTGTCGCTGGCGGCCAGCGCGTCGAGGTTGGGCGTGG > NC_002947/2951431‑2951729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |