Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,245,190 | G→C | 7.1% | intergenic (+18/‑107) | PP_2837 → / → PP_2838 | uronate transporter/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,245,190 | 0 | G | C | 7.1% | 849.6 / 40.3 | 255 | intergenic (+18/‑107) | PP_2837/PP_2838 | uronate transporter/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (101/136); new base C (4/14); total (105/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.35e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
ACCACAGCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCTGCATA > NC_002947/3245041‑3245339 | caGCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCtgcagtgca < 1:4173058/150‑1 (MQ=255) caGCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCtgcagtgca < 2:5094188/150‑1 (MQ=255) aGCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCtgcagtgcag > 1:3530890/1‑150 (MQ=255) gTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGccc < 1:5402450/150‑1 (MQ=255) ttCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCACTGCAGcccc < 2:886713/150‑1 (MQ=255) ttCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCACTGCAGcccc < 1:4744720/150‑1 (MQ=255) ttCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCACTGCAGcccc < 2:3705359/150‑1 (MQ=255) tCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCt < 1:2014869/150‑1 (MQ=255) tCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCt < 1:2351415/150‑1 (MQ=255) tCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCt < 1:2739322/150‑1 (MQ=255) aTGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACAGGGGCTGCACTGCAGcccccgt < 2:1548963/150‑4 (MQ=255) tGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGaa > 2:543770/1‑150 (MQ=255) tGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGaa > 2:3522765/1‑150 (MQ=255) tGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACAGGGGCTGCACTGCAGcccccgta < 1:4423998/150‑5 (MQ=255) aTCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAAcc < 2:3914578/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTg < 2:7778558/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTg < 1:7530605/150‑1 (MQ=255) gcgcGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCTCTGAACCCTgg > 1:8009371/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGt < 2:3337066/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATc < 2:8077905/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATc < 1:6748465/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATc < 2:2820399/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGAGGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATc < 1:5421203/150‑1 (MQ=255) gtggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGt < 1:7437317/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGa < 2:2201432/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGa < 2:3841331/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGa < 1:5600380/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGa < 1:6348290/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAg < 2:7591329/150‑1 (MQ=255) cgcTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAgg < 1:1435196/150‑1 (MQ=255) gcTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGc > 1:1037666/1‑150 (MQ=255) gcTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGc > 1:6560120/1‑150 (MQ=255) gcTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACAGGGGCTGCACTGCAGccccc < 2:7470573/128‑2 (MQ=255) tgtgCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGa < 1:2260289/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTACCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGAccc < 2:2369834/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGgcgc < 2:8769084/150‑1 (MQ=255) gCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGt < 1:1983726/150‑1 (MQ=255) gTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCa > 2:4944270/1‑150 (MQ=255) gTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCa > 2:6010598/1‑150 (MQ=255) tACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCAt > 1:454116/1‑150 (MQ=255) tACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCAt < 2:8213502/150‑1 (MQ=255) tACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCACAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCAt < 1:2532454/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGa < 2:2027542/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGa < 2:8327574/150‑1 (MQ=255) ctgctgCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCTTGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAggg < 2:2423671/150‑1 (MQ=255) ctgctgCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAggg < 2:3133729/150‑1 (MQ=255) gctgctACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGt > 2:4241765/1‑150 (MQ=255) gctgctACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGt > 2:6703184/1‑150 (MQ=255) tACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCtg > 1:2170056/1‑150 (MQ=255) aGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCtgtat < 2:2543821/150‑1 (MQ=255) gCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCtgtatgt > 1:6213770/1‑150 (MQ=255) gCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCtgtatgt > 1:7299245/1‑150 (MQ=255) aCCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTgtatgtat > 1:5624234/1‑150 (MQ=255) ccATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCcgc < 2:5848840/116‑1 (MQ=255) cATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGTCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATaaa > 2:708535/1‑150 (MQ=255) cttGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAAc < 2:6099530/149‑1 (MQ=255) aTTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATaaa > 1:3771051/1‑149 (MQ=255) aTTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAAc < 1:3181451/150‑1 (MQ=255) aTTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAAc > 1:8341661/1‑150 (MQ=255) aTTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAAc > 2:2671988/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTg < 2:4846599/150‑1 (MQ=255) gTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCt < 1:3667218/150‑1 (MQ=255) cAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTg > 2:8039710/1‑150 (MQ=255) cAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTg > 1:1800069/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGcc < 1:1075190/150‑1 (MQ=255) aGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGcc < 2:1139963/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGc < 1:6138149/150‑1 (MQ=255) tCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCa > 2:8422471/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCa > 1:7176116/1‑150 (MQ=255) gAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTCTGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAAc > 2:5532616/1‑150 (MQ=255) gAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAAc > 1:5276491/1‑150 (MQ=255) gAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAAc > 2:6426544/1‑150 (MQ=255) ggcgggcgGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCt < 1:7863206/150‑1 (MQ=255) cgggcgggATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCACCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGa < 2:7290402/150‑1 (MQ=255) ggcgggATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGAcc < 2:1351820/150‑1 (MQ=255) ggggtgctggcGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCGGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCg < 1:8525761/145‑1 (MQ=255) tggctggcGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGccc < 1:3003406/150‑1 (MQ=255) gcgcAACTGAACATGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATc < 2:5642792/150‑1 (MQ=255) gcAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTg > 2:2560717/1‑64 (MQ=255) cTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCgcggc > 2:2937902/1‑74 (MQ=255) cTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCgcggc < 1:2937902/74‑1 (MQ=255) gAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTc > 1:3248805/1‑150 (MQ=255) aCAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCg < 2:4262020/150‑1 (MQ=255) gTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTcgacg > 2:7932951/1‑150 (MQ=255) gTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACATCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTcgacg > 1:5850297/1‑150 (MQ=255) gAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCgacgac > 2:3002864/1‑150 (MQ=255) aaCGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGAcc > 2:5018072/1‑150 (MQ=255) aaCGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGAcc > 1:6515122/1‑150 (MQ=255) gCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGt > 2:6907268/1‑150 (MQ=255) tACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTCTCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTc > 2:1733939/1‑150 (MQ=255) tACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTc > 1:3352976/1‑150 (MQ=255) tACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTc < 1:880902/150‑1 (MQ=255) gggggCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTctac > 1:3891510/1‑150 (MQ=255) ggggCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTctact > 2:4554751/1‑150 (MQ=255) gggCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCACCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTctacta > 2:8701540/1‑150 (MQ=255) gggCTGCACTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGCCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTctacta > 1:2650697/1‑150 (MQ=255) ggCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCtactac < 2:213700/150‑1 (MQ=255) cTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCt < 2:7987487/150‑1 (MQ=255) tgcagtgcagCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCTg > 2:414945/1‑150 (MQ=255) agtgcagCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCTGCAt < 1:5052123/150‑1 (MQ=255) | ACCACAGCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCTGCATA > NC_002947/3245041‑3245339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |