| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,480,485 | A→C | 5.3% | L407W (TTG→TGG) | PP_3087 ← | excinuclease ABC subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,480,485 | 0 | A | C | 5.3% | 687.4 / 12.4 | 227 | L407W (TTG→TGG) | PP_3087 | excinuclease ABC subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (149/61); new base C (5/10); total (154/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.86e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAAGCAGC > NC_002947/3480336‑3480634 | gccgTGGTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCaa < 2:6068504/150‑1 (MQ=255) cgTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAgc > 1:7130707/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAgccggccg > 1:8006940/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAgccggccg > 1:2818858/1‑150 (MQ=255) gCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGa > 2:4244263/1‑150 (MQ=255) gCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGCT‑TGCACCCGGCCGa < 1:2859056/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGc > 1:3923662/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGc > 2:6727885/1‑150 (MQ=255) aGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCtc > 1:5285497/1‑150 (MQ=255) ggCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCtcgtcg > 1:4877006/1‑150 (MQ=255) gCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCtcgtcgc > 2:3139409/1‑149 (MQ=255) ccTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGt > 1:4660694/1‑150 (MQ=255) ccTACAACCACCCGCCTGGGGGCGCGGCGGTTGGTGACCGTGCCTTGCCCAACCCCTTACACCTTTTGGCACGCCTTTTTCGGGCGCGGCTGGGCTTCTAACGGGGCTTCCGTGTGGGCGGGTT‑GCACGCGGGCCGACGGCTCGTCGAGt < 2:1897876/150‑1 (MQ=255) cTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTa > 2:7418343/1‑150 (MQ=255) aCATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACg > 2:6986549/1‑150 (MQ=255) caccaGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAac > 2:5241754/1‑150 (MQ=255) cgcctggcggcgcggcgCTTGGTGTCCCGGACAGGCCCCCCCCCGTACCCCGTGGGGCCCGCCTGTTTCCGGGGCTGCCGGGCTTCCACCCGCGCTTCACTGCCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAaccacc < 2:2881477/143‑1 (MQ=255) gcctgTGGGCGCGGCGCTGGGTGTCCCGGTCTTGCGCCACCAGGTCCACGGTGTTGCCCGCCGGTTTCGGGGGCTGCTGGGCTTGGACCCGGGGTTCAGTGTGGGCGGGGT‑GCACGCGGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCAccc < 2:7891371/150‑1 (MQ=255) ccctgtgggcggggcgcGTGGGGCCCTGGTCATGCCCCACCCCGCACCCGTGGTTGCCCGCCTTTTTCCGGCGCTGGGGGGGTACGACCCGCGCTCCCCTGGGGGCGGGGG‑GACCGCGGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCAccc < 2:3451960/143‑1 (MQ=255) gggcgcggcgcTTGGTGTCCAGGAAATGCTCCACCACGAACACCGTGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGATTCTAACAGCGCTTCACTGTCGGCGGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACa < 2:5813910/149‑1 (MQ=255) gcggcgcATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTg > 2:1110956/1‑150 (MQ=255) gggtgggTGTCCTGGTCTTTCTCCACCAGGTACCCGTTGTTGCATGGGGTTTTCTGGGGGGGCTGGGTTTCGAAACGGGTTTCAGTGCGGGCGGGGT‑GCACGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGaa < 2:7760194/145‑1 (MQ=255) gcATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAAt > 1:8752516/1‑150 (MQ=255) tGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCa > 1:5056032/1‑150 (MQ=255) tgtCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGCGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGcg > 1:7478737/1‑149 (MQ=255) tgtCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCt > 2:7543108/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGACCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTgg > 2:2274924/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTggg > 1:4375329/1‑150 (MQ=255) cAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGt > 1:1095152/1‑150 (MQ=255) cAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGt > 1:5900095/1‑150 (MQ=255) cAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGt > 2:615861/1‑150 (MQ=255) aGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGACTTCAGCTGGGTg > 1:2684639/1‑150 (MQ=255) gTCATGCCCCACCACGAACCCCGAGTGGCCTGCCTTTTTCTGGCGCGGCTGGGCTTCGAACCGGGCTTCCCTGTCGGCGGGGT‑GCACGCGGCCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGc < 2:2796948/150‑1 (MQ=255) tCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCcaggcgc > 2:3901114/1‑150 (MQ=255) tCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCcaggcgc > 2:7661010/1‑150 (MQ=255) tCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCcaggcgc > 1:8086343/1‑150 (MQ=255) ccccccacGTACCCGGTGTGGCCCGCCTTTTCCGGGCGGTTCTGGGCTTCCACCCGGGCTTCCGGGGGGGCGGGGC‑GCACGCGGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCcaggcgc < 2:3773812/146‑1 (MQ=255) ccaccaCGTACACCTTGTGGCCCGCGTGTTTCTGGCGCTGCCGGGCTACCACCCGCGCTCCCCGGCCGGCGGGGG‑CCACGCCGCCCCACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAACCAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCcaggcgca < 2:262268/150‑1 (MQ=255) ccacGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCcaggcgcaggc > 2:7978857/1‑150 (MQ=255) cacGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCcaggcgcaggcg > 2:5096927/1‑150 (MQ=255) gTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTg > 2:6422867/1‑150 (MQ=255) ccccgtcgTTGCCACCCTGTTACCGGCGGGCCCGGGCTTCTAACGGCGATCCAGGGGCGGCGGGGT‑GAACGCCGCCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCa < 2:320533/143‑1 (MQ=255) cacCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAg > 2:3398869/1‑150 (MQ=255) cacCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAg > 1:7082922/1‑150 (MQ=255) acCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGt > 1:7375017/1‑150 (MQ=255) acCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGt > 2:1525392/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTc > 1:1341427/1‑150 (MQ=255) gcgTTGCCTGCGTGTTGCGGGGGGTGCTGGGCTTCCACCGGCGCTCCCCTGGGGGGGGGGG‑CCCCGCGGGCCCACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAACCAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCa < 1:1354953/148‑1 (MQ=255) gAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCa > 2:7194044/1‑150 (MQ=255) gTTGCCCGCCTGTTGCCGGGGCTGCTGGGCTTCGAACCGCGCTGCCCGGGCGGCCGGGT‑GCAAGCGGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCAcc < 2:596791/150‑1 (MQ=255) gTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCAcc > 1:1552613/1‑150 (MQ=255) tggCCCGCCTGTTTCCGGCGCTGCCGGGCTCCGAACCGGGCTACACTGTCGGCCGGGT‑GCACGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCa < 2:3632262/148‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCaga > 1:3638238/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCaga > 2:8533987/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCagaa > 1:345899/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCagaa > 1:6348837/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACa > 2:4169557/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACa > 1:5108219/1‑150 (MQ=255) cTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACaa > 1:1470537/1‑150 (MQ=255) tttttCTGGCGGTGCTGGGATTCCACCCGCGCTACCCGGGCGGCGGGGG‑CCACCCCGCCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAg < 1:7179405/148‑1 (MQ=255) tGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAg > 2:5497504/1‑150 (MQ=255) ctggCGCTGCTGGGCTTCGAACTGCGATTCACTGTCGGCGGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCgg < 2:4365407/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCgg > 1:1584220/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCgg > 1:331194/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCgggg > 1:7140324/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCCGGGGTTCGACCCGCGCTTCAGTGTCGGCGGGGG‑GCACGCCGCCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGt < 2:5139449/150‑1 (MQ=255) gcTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGtgc > 2:2337474/1‑150 (MQ=255) gcTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGtgc > 2:4544856/1‑150 (MQ=255) cgggCTTCGAACCGCGCTCCCCTGCGGGCGGGGT‑GCACGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTgcgc < 2:5651448/149‑1 (MQ=255) gggCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGACGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCt > 2:8262050/1‑150 (MQ=255) ttagAACAGAGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACATCTGCGAATTCATCTGTGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGATCACCAGAATACAAGGTCGGGGTGCTGAGCTCCAg > 2:1378693/4‑150 (MQ=255) ttCTAACAGCGCTCCACTGCCGGCGGGGT‑GCACGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAg < 2:7086091/150‑1 (MQ=255) gcgacccgcgcGTCAGTGGCGGCGGGGT‑GCACGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCACACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAgg < 2:8336581/143‑1 (MQ=255) aaCAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAATCAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGcc > 1:6644643/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAg > 1:2391810/1‑150 (MQ=255) ggttctgtgtgGGCGGGGT‑GCACGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAg < 1:8590969/143‑1 (MQ=255) ttCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgcc > 1:4781674/1‑150 (MQ=255) cccgggcggcggGGG‑GCCCGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCCACCCGCTGCGCCGTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccga < 2:6110331/144‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGGGGC‑GCCCGCCGGCCCACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccga < 2:1116897/148‑1 (MQ=255) cgggggggCGGGGG‑GCACGCGGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAACCAGCTGCGAAGTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgag < 2:5938980/144‑1 (MQ=255) aCTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGATGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgag > 2:3925714/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgaggc > 2:6575132/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgaggc > 1:2193990/1‑150 (MQ=255) cgTCGGCCGGCT‑TGCACCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgaggc > 2:4653364/2‑150 (MQ=255) gTCGGCCGGCT‑TGCACCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTTCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgaggcc > 1:8199902/1‑150 (MQ=255) tCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgaggccg > 1:993205/1‑150 (MQ=255) cggcggGGT‑GCACCCCGCCCCACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgaggccga < 1:6056437/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAgccgaggccgag > 2:5170115/1‑150 (MQ=255) gCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCAAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGAGCTCCAGGGCCAGGTAGccgaggccgagg > 1:7868027/1‑150 (MQ=255) cGGGTGGCACGCCGGGCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGAGAAGTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCGGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGt < 2:2198109/150‑1 (MQ=255) gggT‑GCATGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCa < 2:8712759/150‑1 (MQ=255) gggT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCa > 1:418460/1‑150 (MQ=255) ggT‑GCACGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCaa < 2:1341427/150‑1 (MQ=255) gT‑GCACGCCGCCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAag < 2:5252306/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGTGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAagca > 2:6014718/1‑150 (MQ=255) gCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAagca > 1:3743431/1‑150 (MQ=255) aaGCGGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAagcagc < 2:6962642/150‑1 (MQ=255) aaGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAagcagc > 2:7244099/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAagcagc > 1:3353649/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAagcagc > 1:7795111/1‑150 (MQ=255) | CGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGT‑GCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCTGGGTGGCCAGGCGCAGGCGTTGCAGTTCACCAGAAGACAAGGTCGGGGTGCTGCGCTCCAGGGCCAGGTAGCCGAGGCCGAGGTCAAGCAGC > NC_002947/3480336‑3480634 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |