| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,667,968 | G→A | 8.0% | intergenic (‑143/+43) | PP_3226 ← / ← PP_3227 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein/LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,667,968 | 0 | G | A | 8.0% | 929.8 / 48.1 | 310 | intergenic (‑143/+43) | PP_3226/PP_3227 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein/LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (155/130); new base A (16/9); total (171/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
GGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTGCGGCTTGA > NC_002947/3667819‑3668117 | gCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGt > 1:384261/1‑150 (MQ=255) gCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGt > 2:6839860/1‑150 (MQ=255) gCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGt > 2:5368678/1‑150 (MQ=255) tCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTg > 2:3565958/1‑150 (MQ=255) aTCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCa > 2:5878361/1‑150 (MQ=255) aTCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCa > 1:3399675/1‑150 (MQ=255) tGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCAACGCAGccca < 1:7036863/150‑2 (MQ=255) aaTGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCttt < 1:4596931/150‑1 (MQ=255) aaTGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCttt > 2:1635188/1‑150 (MQ=255) aaTGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCAACGCAGcccaag < 2:7282190/150‑4 (MQ=255) aTGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTc < 1:6513701/150‑1 (MQ=255) aTGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCAACGCAGcccaagc < 2:7137602/150‑5 (MQ=255) aTGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCAACGCAGcccaagc < 1:6121738/150‑5 (MQ=255) aCGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGcc > 1:8082048/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCa > 1:5948265/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCa < 1:6903104/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGTTGCCTAAGACCATATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCa < 2:5016165/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAg < 2:6971354/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAg < 1:8457558/150‑1 (MQ=255) tAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCca < 1:7730762/150‑1 (MQ=255) tAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCca < 2:4565728/150‑1 (MQ=255) tAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCca > 1:4527866/1‑150 (MQ=255) gACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAg < 1:6167936/150‑1 (MQ=255) gACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAg < 2:3198557/150‑1 (MQ=255) gACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAg < 2:5218398/150‑1 (MQ=255) aCCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAgg > 1:3713940/1‑150 (MQ=255) cGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGcc > 1:7170625/1‑150 (MQ=255) gTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCa < 1:2667960/150‑1 (MQ=255) gTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCa < 1:2179924/150‑1 (MQ=255) ttCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTg > 1:870441/1‑150 (MQ=255) tCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGa < 1:2320104/150‑1 (MQ=255) cGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAg < 2:800046/150‑1 (MQ=255) gCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGc < 2:6353255/150‑1 (MQ=255) cATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGca > 1:5048440/1‑149 (MQ=255) cATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCt > 2:1882653/1‑150 (MQ=255) ggATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTAGATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATGTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCaa > 2:7630784/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAAccc > 1:8241812/1‑150 (MQ=255) gAAGGCTGTAAATGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCca > 1:6018340/1‑150 (MQ=255) aGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCcaac > 2:1989408/1‑150 (MQ=255) aGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCcaac > 2:5523215/1‑150 (MQ=255) gCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCCGTGAGCTCAACCcaacaa > 2:4646666/1‑150 (MQ=255) gCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCcaacaa > 1:3453608/1‑150 (MQ=255) tAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGa > 1:4374605/1‑150 (MQ=255) tAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGa < 1:7898184/150‑1 (MQ=255) aaaGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGAtt > 1:5350252/1‑149 (MQ=255) aaGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGt > 2:5114030/1‑150 (MQ=255) aGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTc > 2:1348446/1‑150 (MQ=255) aGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCGTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTc > 2:1140489/1‑150 (MQ=255) ggCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTcc > 2:3760073/1‑150 (MQ=255) cTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCa < 2:8231440/150‑1 (MQ=255) tataTGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCAc > 1:730899/1‑150 (MQ=255) tGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCaaa < 2:2920273/150‑1 (MQ=255) gCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCaaaa > 1:1811592/1‑150 (MQ=255) gCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCaaaa > 2:6114090/1‑150 (MQ=255) cTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCaaaaa > 1:3940724/1‑150 (MQ=255) cTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCaaaaa < 2:8258421/150‑1 (MQ=255) tAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAg > 2:2808051/1‑150 (MQ=255) tAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAg < 2:2243830/150‑1 (MQ=255) tAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAg > 1:1018673/1‑150 (MQ=255) tATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTcc < 2:4958948/150‑1 (MQ=255) tGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCAc > 2:4326896/1‑150 (MQ=255) tGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCAc > 1:1323401/1‑150 (MQ=255) tGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCAc > 1:7418792/1‑150 (MQ=255) tGAGTTTTAATGAATTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCAc > 1:6626201/1‑150 (MQ=255) ttttAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGc > 2:6790829/1‑150 (MQ=255) tAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTcc < 1:2754218/150‑1 (MQ=255) tGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGt > 1:1561722/1‑150 (MQ=255) tttAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTaaa < 2:237678/150‑1 (MQ=255) tttAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTaaa > 2:3861869/1‑150 (MQ=255) agagTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTa < 1:2861638/150‑1 (MQ=255) agTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTAcc > 1:3103160/1‑150 (MQ=255) tttGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAg < 2:7763418/150‑1 (MQ=255) ttGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAgg < 2:4815764/150‑1 (MQ=255) cTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAg > 1:7801714/1‑150 (MQ=255) ttGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAgc < 1:2506054/150‑1 (MQ=255) ttGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAgc > 1:5026537/1‑150 (MQ=255) ttGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAgc > 1:5853541/1‑150 (MQ=255) aTGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGa < 2:2693538/150‑1 (MQ=255) aTGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGa < 2:8539436/150‑1 (MQ=255) aTGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGa < 2:5136205/150‑1 (MQ=255) tttGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAg > 1:2054783/1‑150 (MQ=255) tttGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAg < 2:1867652/150‑1 (MQ=255) ttGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGc > 1:5456869/1‑150 (MQ=255) ttGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGc < 1:1878812/150‑1 (MQ=255) ttGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGc < 2:5948314/150‑1 (MQ=255) ttGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGc < 2:3681885/150‑1 (MQ=255) gaaagggCTGCAACGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCAc > 1:5643481/5‑150 (MQ=255) gaaagggCTGCAACGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCAc > 1:2382668/5‑150 (MQ=255) gCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCAc > 2:3488042/1‑150 (MQ=255) cTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCAcc > 2:3397056/1‑150 (MQ=255) cTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCAcc > 2:4739882/1‑150 (MQ=255) ttGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCt < 2:7552336/150‑1 (MQ=255) ttGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCt > 1:7506970/1‑150 (MQ=255) ttGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCt > 2:3444959/1‑150 (MQ=255) tGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTg > 1:4061290/1‑150 (MQ=255) agggCTGCAACGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTg > 1:5748459/2‑150 (MQ=255) gCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTGCgg > 1:8396303/1‑150 (MQ=255) cTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTGCGGc > 1:1707557/1‑150 (MQ=255) cGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCAGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTGCGGCTTg < 1:93683/150‑1 (MQ=255) gTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTGCGGCTTGa < 2:8464248/150‑1 (MQ=255) | GGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTTTAGCTATATGCTAATTATGAGTTTTAATGATTTAGAGTTTTGCTTGTTATGCGTAATTTGCATTTATAGCTTGGGCTGCGTTGCAGCCCTTTCGCCACGCAAGGCGCCACAGGCCAGTGAGCTCAACCCAACAACCGATGTCCCGCGACCTCACCAAAAAGCTCCACCGGCTCCTGTAAATTACCCAGGTAGCGCGGATGGAACAGCCACAGATCCACCTGCGGCTTGA > NC_002947/3667819‑3668117 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |