Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_002947 | 3,984,646 | G→T | 5.1% | I326I (ATC→ATA) | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,984,646 | 0 | G | T | 5.1% | 1268.6 / 37.2 | 373 | I326I (ATC→ATA) | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (167/186); new base T (6/14); total (173/200) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 374 total aligned reads displayed.
GGGCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTT > NC_002947/3984498‑3984795 | gggCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGa > 2:5274842/1‑150 (MQ=255) gggCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGa > 1:8644836/1‑150 (MQ=255) gggCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGa < 2:3563372/150‑1 (MQ=255) gggCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGACGCGTGa < 2:7778018/150‑1 (MQ=255) ggCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGAt > 1:1907020/1‑150 (MQ=255) gCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATa > 1:3941598/1‑150 (MQ=255) cATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATaa > 1:6018676/1‑150 (MQ=255) cATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATaa > 2:2888162/1‑150 (MQ=255) ttGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATg > 2:6048279/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgcgc > 2:8545600/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCg > 2:5939048/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCg > 1:6347464/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGt < 1:1510176/150‑1 (MQ=255) gCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTc > 2:2767943/1‑150 (MQ=255) cGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTcc < 1:3570535/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCGGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGAGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa > 1:746695/1‑150 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa > 2:477617/1‑150 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa < 2:794934/150‑1 (MQ=255) 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aGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaaagcaa > 2:2279840/1‑150 (MQ=255) gcggcgGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgcaat < 1:743748/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCa > 1:6244650/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATgg > 1:6879162/1‑150 (MQ=255) aGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGcc < 1:6617909/150‑1 (MQ=255) aGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGcc < 2:7474319/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCa < 2:7027937/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCa < 1:7189938/150‑1 (MQ=255) tCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAgg > 1:7871835/1‑150 (MQ=255) tCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAgg < 1:3835500/150‑1 (MQ=255) 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< 2:4902304/150‑1 (MQ=255) gTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGcc > 2:3172746/1‑150 (MQ=255) gTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCGCCGGCCATGCACTGTGCAGGGCCAGGTCGCGCGCGcc > 1:7230081/1‑150 (MQ=255) gcTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCt < 1:2008511/150‑1 (MQ=255) cTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCTGGGCGCGCGCGACCTGGCCATg < 2:6809164/150‑1 (MQ=255) ggggTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCACGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTc < 2:8714043/150‑1 (MQ=255) 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gctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGc > 1:6958429/1‑150 (MQ=255) ctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGcc < 2:3507397/150‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCt > 2:6996983/1‑150 (MQ=255) ccATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCg < 2:123378/150‑1 (MQ=255) ccATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCg > 1:2720988/1‑150 (MQ=255) cATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCgg > 1:8570152/1‑150 (MQ=255) cATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCgg < 1:7376245/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGa < 2:4806845/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGa > 2:1714715/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGa < 2:2031900/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGCTGTc > 1:3711961/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTc < 1:2162830/150‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTcg > 1:8442025/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCTGACCGGCCTCGTGATAATGCGCCCGTACAGCACCGGCAAATCAATGTGCATGGCCAGCTAGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCACAGCCAGGCAGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTcg > 1:5272088/1‑150 (MQ=255) gAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTcgcg < 2:210414/150‑1 (MQ=255) aaGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcgg < 1:3381661/150‑1 (MQ=255) aaGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcgg < 1:1134800/150‑1 (MQ=255) aaGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcgg < 2:3941598/150‑1 (MQ=255) cTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGa > 1:32289/1‑150 (MQ=255) gcgTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCa > 2:6480549/1‑150 (MQ=255) cgTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAg < 1:1793748/150‑1 (MQ=255) | GGGCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTT > NC_002947/3984498‑3984795 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |