Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,984,649 | A→C | 5.4% | I325M (ATT→ATG) ‡ | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,984,649 | 0 | A | C | 5.4% | 1228.5 / 39.5 | 364 | I325M (ATT→ATG) ‡ | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (160/183); new base C (6/14); total (167/197) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.92e-01 |
Only 100 of 378 total aligned reads displayed.
GCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGG > NC_002947/3984500‑3984798 | gCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATa > 1:3941598/1‑150 (MQ=255) aTTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAAt > 2:1793748/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATgc < 2:7290208/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGccc < 2:1419113/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGccc < 2:6550324/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCg > 2:2813633/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGt < 1:1510176/150‑1 (MQ=255) gCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTc > 1:216365/1‑150 (MQ=255) cGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTcc < 1:3735861/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa < 2:794934/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa > 2:4783640/1‑150 (MQ=255) gggCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCa > 1:6107698/1‑150 (MQ=255) aGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCttc < 2:7001723/150‑3 (MQ=38) aGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCttc < 2:8342546/150‑3 (MQ=38) aGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTcc < 1:2903604/150‑1 (MQ=255) cTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCTCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCgg < 1:5218850/150‑1 (MQ=255) cTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGGAGCTGGACGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCttcaa < 1:7193612/150‑5 (MQ=37) cTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCgg < 1:7490790/150‑1 (MQ=255) cTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCgg < 1:801098/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaaggc > 2:6339374/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgcaa > 1:8132818/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgcaa > 2:4039038/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGGGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgcaa > 2:2279833/1‑150 (MQ=255) gcggcgGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGgcaatgcaat < 2:2085080/150‑1 (MQ=255) cggGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGc < 2:4862690/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATg < 2:1932052/150‑1 (MQ=255) cAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGc > 1:8535703/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCCATGCACATTGCATTGccg < 1:2738640/150‑2 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCa > 1:632948/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAAGGTGCATGGCCa > 2:416726/1‑150 (MQ=255) tCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAgg > 1:3425842/1‑150 (MQ=255) gACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcg > 1:4448883/1‑150 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCTGGgcgcgc < 2:8077407/150‑1 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgc > 2:3881778/1‑150 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgc < 2:5218329/150‑1 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgc < 1:6408872/150‑1 (MQ=255) aCAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgc < 1:688813/150‑1 (MQ=255) cAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGTAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCGGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgcg > 2:2591298/1‑150 (MQ=255) cAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTcgcgcg > 2:3530986/1‑150 (MQ=255) cATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAg < 2:3461725/150‑1 (MQ=255) cATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAg > 2:7640443/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAgg > 1:7453220/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAgg < 1:2530839/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTCGGGGTGGGCACGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAgg < 2:6737209/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGcc < 2:4318777/150‑1 (MQ=255) gcTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCTGGGCGCGCGCGACCTGGccat < 2:1212337/150‑3 (MQ=255) gcTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCt > 1:5573808/1‑150 (MQ=255) ggggTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTc > 2:7731452/1‑150 (MQ=255) ggggTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTc > 1:2485903/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTg < 2:5884484/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTg < 1:3843904/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTg < 1:5775591/150‑1 (MQ=255) gcgcGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCt < 1:8586221/150‑1 (MQ=255) gcgGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCGGGCTTc < 2:2347436/150‑1 (MQ=255) gTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCcca < 1:477617/150‑1 (MQ=255) gCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCccagcc > 1:5985509/1‑150 (MQ=255) cAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCccagccc > 1:2036995/1‑149 (MQ=255) aGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCACTGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCccagccag > 2:4638486/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCt < 1:1042642/150‑1 (MQ=255) aaCGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTg < 2:7499123/150‑1 (MQ=255) aaCGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTg < 2:3349084/150‑1 (MQ=255) gTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGtt > 2:2760564/1‑150 (MQ=255) gTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGtt < 1:3295423/150‑1 (MQ=255) tCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTgggaa < 1:8266007/150‑4 (MQ=255) ggACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTc < 1:3158830/150‑1 (MQ=255) gACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTcc > 2:5619930/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTg > 1:7868539/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTgc < 1:6652409/150‑1 (MQ=255) 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gctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGc > 1:2070395/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCt > 1:7103032/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCt > 1:6764997/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCt > 1:3578620/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCt > 2:6996852/1‑150 (MQ=255) gcCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTgca > 1:4862635/1‑150 (MQ=255) cAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTgcagc > 1:7021160/1‑150 (MQ=255) cATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCgg < 1:7376109/150‑1 (MQ=255) cATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCgg < 2:3120532/150‑1 (MQ=255) aTGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCggg > 1:7419447/1‑150 (MQ=255) aTGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCggg > 1:4214202/1‑150 (MQ=255) gAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTcgcg > 2:679448/1‑150 (MQ=255) aaGCTGAGCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGTCAATGCATTGTGCATGGCCAGGTCGCTCGCGCCCTGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcgg < 2:4919111/150‑1 (MQ=255) aaGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcgg < 1:1134800/150‑1 (MQ=255) aaGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcgg < 2:5048806/150‑1 (MQ=255) aGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcggc < 2:746575/150‑1 (MQ=255) aGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcggc < 2:8644836/150‑1 (MQ=255) gCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCgcggcg > 1:6459721/1‑150 (MQ=255) gCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGAGGTCgcggcg > 2:7392316/1‑150 (MQ=255) cTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGa < 2:5985509/150‑1 (MQ=255) ggacGGGCGCATTATCACGCGCCCGGTCAGCTTCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGaaa > 2:8503140/4‑150 (MQ=255) gACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGaaa > 2:612861/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACg < 2:1688355/150‑1 (MQ=255) cgTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAg < 1:1793748/150‑1 (MQ=255) gATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGtt > 2:6369847/1‑150 (MQ=255) aTAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTg > 2:5439425/1‑150 (MQ=255) aaTGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTggg < 2:7194217/150‑1 (MQ=255) | GCATTGGGCAGGCGGGCCAGCTCGACCCAGCGGCGGGCCAGCTCGGCGACAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGGTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGG > NC_002947/3984500‑3984798 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |