| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_002947 | 4,345,076 | 0 | A | G | 35.6% | 169.5 / 139.8 | 144 | intergenic (+68/‑263) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/35); new base G (27/24); total (85/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGC > NC_002947/4344927‑4345225 | gcTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGAcacca < 2:889962/150‑1 (MQ=255) aTACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACg < 1:3926398/150‑1 (MQ=255) gggCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTcgc < 2:8147501/150‑1 (MQ=25) 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gcgAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTTCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCt > 2:1336/1‑150 (MQ=255) gcgAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCt > 1:1758688/1‑150 (MQ=255) gAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTg > 2:426329/1‑150 (MQ=255) gAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTg > 1:1016344/1‑150 (MQ=255) aTGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAg > 2:3914724/1‑150 (MQ=255) 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GCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGC > NC_002947/4344927‑4345225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |