Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,575,748 | C→G | 5.1% | P207A (CCG→GCG) | treY → | maltooligosyl trehalose synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,575,748 | 0 | C | G | 5.1% | 1233.7 / 38.1 | 362 | P207A (CCG→GCG) | treY | maltooligosyl trehalose synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (173/170); new base G (7/12); total (180/182) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
ACAAACAGCAGGGGCTGCTGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGACCTACCGC > NC_002947/4575599‑4575897 | aaCAGCAGGGGCTGCTGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGc > 1:4415985/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGGGGCTGCTTCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCt < 1:8596889/150‑1 (MQ=255) agcagGGGCTGCTGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTgg > 1:8663582/1‑150 (MQ=255) agcagGGGCTGCTGCAAGATGCCCATTAAGCGCATCGTTTCCCGATCAGCCCGGTCGATTACGGCTGGATACACTCGCTCAGCACCGAACATGCACGCCAGGTGCTGGCCGAGCGCGTCACGGCAATGGGCGACTCGGCCACCCCGCTgg > 1:6346523/1‑150 (MQ=255) ggggCTGCTGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGa < 2:274726/150‑1 (MQ=255) ggggCTGCTGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGa < 2:3163756/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATa < 2:1843803/150‑1 (MQ=255) gctgctGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAg < 1:3031482/150‑1 (MQ=255) tgctgcAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCAGCGGGGTGGCCGagtcgc < 1:2213264/150‑6 (MQ=255) tgctgcAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGcc > 2:261102/1‑150 (MQ=255) tgcAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGc > 1:7146096/1‑150 (MQ=255) tgcAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGc > 2:5422378/1‑150 (MQ=255) tgcAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGc < 1:2643833/150‑1 (MQ=255) gcAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGcc > 2:4495958/1‑150 (MQ=255) gcAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGcc > 1:2275440/1‑150 (MQ=255) gCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCaa < 1:3322931/150‑1 (MQ=255) gCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCaa < 1:1480966/150‑1 (MQ=255) gCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCaa < 2:1660253/150‑1 (MQ=255) ccATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGc > 1:8407934/1‑150 (MQ=255) aTTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCg < 2:8289441/150‑1 (MQ=255) tACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGaa < 2:2876332/150‑1 (MQ=255) aCGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAAc < 2:7754135/150‑1 (MQ=255) gcgcATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTg > 1:8314436/1‑150 (MQ=255) gcATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGc < 2:3755421/150‑1 (MQ=255) aTCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGccc < 2:1079392/150‑1 (MQ=255) tttCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCt > 1:5794278/1‑150 (MQ=255) gATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCg > 2:2267937/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCga < 1:931113/150‑1 (MQ=255) tCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCgag < 1:5441781/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCgaga < 1:3364104/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGaa < 2:5059610/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCGTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGaa < 2:1310959/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAg < 1:4986095/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAg > 1:6446867/1‑150 (MQ=255) cGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTg > 2:691533/1‑150 (MQ=255) cGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTg < 2:4189545/150‑1 (MQ=255) gTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGcc > 1:2069956/1‑150 (MQ=255) gTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCAGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGcc > 1:4272793/1‑150 (MQ=255) ttggcatggCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGa > 2:5599171/8‑150 (MQ=255) tACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTc < 2:3328318/150‑1 (MQ=255) ggCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGaa > 2:4448086/1‑150 (MQ=255) ggCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGaa > 1:4515847/1‑150 (MQ=255) ggCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGaa > 2:488623/1‑150 (MQ=255) 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cgcgCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCtggt < 1:2562782/150‑1 (MQ=255) gcgcTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCtggtg > 1:7647264/1‑150 (MQ=255) gcgcTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCtggtg < 1:8487613/150‑1 (MQ=255) gcgcTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCtggtg < 2:3483811/150‑1 (MQ=255) cgcTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCtggtgg < 1:5406757/150‑1 (MQ=255) 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aCTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGa < 1:5305333/150‑1 (MQ=255) aCTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGa < 1:2434562/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGTCTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTTCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAg < 2:8615641/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAgg > 2:6193175/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGc > 2:3911763/1‑150 (MQ=255) aaGGTTCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCCGCGAGGcc < 1:6540680/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGcc > 2:6696752/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGt < 1:1162591/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGTCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCaa > 1:7313623/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGcc < 2:902552/150‑1 (MQ=255) gcTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGc > 1:1581127/1‑150 (MQ=255) ttCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCAc > 1:2518578/1‑150 (MQ=255) cACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACct > 1:5567072/1‑150 (MQ=255) aCGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACctg > 2:4028265/1‑150 (MQ=255) ggCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACctgct > 2:6340569/1‑150 (MQ=255) aTTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACctgctgct < 1:7968795/150‑1 (MQ=255) aTTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACctgctgct < 1:445426/150‑1 (MQ=255) tGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTgg < 2:4753662/150‑1 (MQ=255) gCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAAc > 2:3597398/1‑150 (MQ=255) gACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGc > 1:6099828/1‑150 (MQ=255) gACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGc < 1:1285333/150‑1 (MQ=255) ctatCGGCCAGCGGGGTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGc > 1:3548615/4‑150 (MQ=255) atCGGCCAGCGGGGTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCa > 2:249942/2‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCGGGGTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAg > 1:1969628/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAg > 1:7795074/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTGTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAg > 1:6927947/1‑150 (MQ=255) cGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGa < 1:6749826/150‑1 (MQ=255) cGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGa < 1:6296130/150‑1 (MQ=255) ccccGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGACCTAcc > 2:5204970/1‑150 (MQ=255) cccGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGACCTACCg > 2:5349266/1‑150 (MQ=255) cccGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGACCTACCg > 2:8667311/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGACCTACCGc > 1:1109970/1‑150 (MQ=255) | ACAAACAGCAGGGGCTGCTGCAAGTGGCCCATTACGCGCATCGTTTCCCGATCTGCCCGGTCGATTACGGCTGGATTCTCGCGCTCAGCCCGGAACCTGCACTCAAGGTGCTGGCCGAGCGCTTCACGGCATTGGGCGACTCGGCCACCCCGCTGGCCGATAGCCTGCCGCTCCAAGCCGAACTGGCCCGCCTGGTGCGAGAAGGTGCCGACCTCGAATCGGCCCTGGTGGCCTTCGACAGCCGCAGCGAGGCCGGTTTCAAGCGCCTGCACCTGCTGCTGGAACGCCAGACCTACCGC > NC_002947/4575599‑4575897 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |