Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,585,597 | T→G | 6.3% | K942Q (AAG→CAG) ‡ | treSB ← | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,585,597 | 0 | T | G | 6.3% | 1174.1 / 46.4 | 347 | K942Q (AAG→CAG) ‡ | treSB | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (161/162); new base G (10/12); total (173/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 |
Only 100 of 363 total aligned reads displayed.
TAAGGGCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCTGTGCACACCAGC > NC_002947/4585449‑4585746 | aaGGGCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCtgcttgc < 1:2508236/150‑1 (MQ=255) ggCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCATGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCTTCACCCTGCACCAAGAGCACCTGGCACAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGTGCCTGCTTGCTCa < 1:966496/150‑1 (MQ=255) ggCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCa > 2:4305079/1‑150 (MQ=255) gCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCAAGCAGGCTCAg < 2:456638/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAgg < 1:1162466/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAgg < 1:6423718/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCAAGCAGGCTCAgg < 1:3501322/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTTGGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCAAGCAGGCTCAgg < 2:1537181/150‑1 (MQ=255) tgtgTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAggg > 1:5575145/1‑150 (MQ=255) ttttGCCCGGCGCTCTTCAAGGGTCCCGGCGGGTTCAACTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGAGCAGCTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCAGCGAGCTCAGGGTGTc > 2:5223869/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCg > 1:5965306/1‑150 (MQ=255) tGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGAt < 2:8244943/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGAtgt > 1:6827146/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGAtgt > 1:4402064/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGTACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGAtgtg > 2:3892765/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGAtgtg > 2:3152857/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGAtgtg > 2:6308157/1‑150 (MQ=255) cgcTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTgg < 1:1007980/150‑1 (MQ=255) cgcTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTgg < 1:7094363/150‑1 (MQ=255) cgcTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTgg > 2:3351356/1‑150 (MQ=255) cgcTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTgg < 1:4960595/150‑1 (MQ=255) gcTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTggg > 2:6630052/1‑150 (MQ=255) tcttctAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGcc > 2:771981/1‑150 (MQ=255) tctTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGcc > 2:268301/1‑150 (MQ=255) tctTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGcc < 1:5356876/150‑1 (MQ=255) ctTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCa > 1:48483/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAg < 1:3656351/150‑1 (MQ=255) ttCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAg < 2:1424003/150‑1 (MQ=255) ttCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAg > 2:238948/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAg > 2:8494783/1‑150 (MQ=255) cacAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGCTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCACGCCCCCCTGAGCCTGCTTTCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAg < 1:1749562/148‑1 (MQ=255) tCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAgg > 1:731982/1‑150 (MQ=255) aaGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGTCAGGcc > 1:3121029/1‑150 (MQ=255) aaGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGcc > 2:1058635/1‑150 (MQ=255) aaGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGcc < 1:4190598/150‑1 (MQ=255) aaGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGcc < 2:3805430/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGt < 1:5326731/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGGGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGt < 2:7036077/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGCTGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCa < 2:6077221/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACTAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCa < 2:7919129/150‑1 (MQ=255) cgggcgggTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGc > 1:3382162/1‑150 (MQ=255) gcgggTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGt < 1:4504147/150‑1 (MQ=255) gcgggTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGt < 2:1497874/150‑1 (MQ=255) cgggTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGtt < 1:3724499/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTtgctgc < 1:8728036/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTtgctgc < 1:6310765/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCGGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTtgctgc < 1:1761466/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAg < 2:2793167/150‑1 (MQ=255) 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tCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGAcc < 1:3287440/150‑1 (MQ=255) gATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCaa > 1:8377101/1‑150 (MQ=255) gATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCaa < 2:4750421/150‑1 (MQ=255) aTGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAg < 2:3715404/150‑1 (MQ=255) aTGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAg < 1:7575517/150‑1 (MQ=255) aTGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAg < 2:3508233/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACt < 1:591841/150‑1 (MQ=255) tAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTgg < 1:6685508/150‑1 (MQ=255) gCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTa > 2:5578169/1‑150 (MQ=255) gCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTa > 1:6968789/1‑150 (MQ=255) aTCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACACATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATc > 2:7807404/1‑150 (MQ=255) aCCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGTCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCt > 2:2899312/1‑150 (MQ=255) ccTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGt < 2:4211130/150‑1 (MQ=255) cTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTc < 1:5673210/150‑1 (MQ=255) ccacGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAgtg > 1:7418414/1‑150 (MQ=255) 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aGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAgg > 2:56897/1‑150 (MQ=255) gTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTc > 1:4592898/1‑150 (MQ=255) gTCGCCGTGTACACGCATAAGAAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTc > 1:205966/1‑150 (MQ=255) cGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGa < 1:5509775/150‑1 (MQ=255) gCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAg > 1:6513656/1‑150 (MQ=255) cGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGCCGAgcg < 2:4934618/150‑3 (MQ=255) acacGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTgg > 1:2746910/1‑150 (MQ=255) acGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGt > 2:3031469/1‑150 (MQ=255) acGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGt > 1:396234/1‑150 (MQ=255) atcgacACCCTGAGCAAGCAGGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGtcagttcagt > 2:3982306/6‑150 (MQ=255) ggCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGc > 2:1188841/1‑150 (MQ=255) cgacACCCTGAGCAAGCAGGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGc > 2:3584713/4‑150 (MQ=255) gCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCt < 2:5354836/150‑1 (MQ=255) gCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCt > 2:7357523/1‑150 (MQ=255) acACCCTGAGCAAGCAGGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTg > 1:1561087/2‑150 (MQ=255) tGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCtgt < 1:5818474/150‑1 (MQ=255) tGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCtgt > 1:2849757/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCtgtg < 1:1074370/150‑1 (MQ=255) gcttgctCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCTGTGCACAcc > 1:8786515/1‑150 (MQ=255) cttgctCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCTGTGCACACCa < 1:3892765/150‑1 (MQ=255) cttgctCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCTGTGCACACCa > 1:6244480/1‑150 (MQ=255) tgctCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCTGTGCACACCAgc > 2:2201410/1‑150 (MQ=255) | TAAGGGCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTTGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATCTGTGCACACCAGC > NC_002947/4585449‑4585746 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |