Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,674,726 | G→C | 6.4% | T21T (ACG→ACC) | nuoN → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,674,726 | 0 | G | C | 6.4% | 1017.1 / 40.4 | 305 | T21T (ACG→ACC) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (159/125); new base C (6/14); total (165/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.48e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
TCGACACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACAA > NC_002947/4674577‑4674875 | tCGACACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACg > 1:7428522/1‑150 (MQ=255) tCGACACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACg > 1:2720030/1‑150 (MQ=255) ccTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACggtggtg < 2:3064691/150‑1 (MQ=255) ccTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACggtggtg < 1:73148/150‑1 (MQ=255) ccTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCACCACCGTggtgatg < 2:1618145/150‑1 (MQ=255) ctctGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACggtggtgg < 1:8622987/150‑1 (MQ=255) gccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGTATTCTCCTCTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGgtggtggtggt < 2:1333238/150‑3 (MQ=255) gccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACCACCGTGGTGAt < 1:5003903/150‑1 (MQ=255) ccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACCACCGTGGTGATg < 2:265163/150‑1 (MQ=255) gccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCt > 2:8745236/1‑150 (MQ=255) gccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCt > 2:8342386/1‑150 (MQ=255) gccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACCACCGTGGTGATggt < 1:3901977/150‑3 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTgg < 1:6242804/150‑1 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTgg < 1:8233877/150‑1 (MQ=255) accaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGc < 2:6288825/150‑1 (MQ=255) caTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGa > 1:8377475/1‑150 (MQ=255) aTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGAt > 2:5516650/1‑150 (MQ=255) aTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGAt > 1:4502306/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATc > 2:8286322/1‑150 (MQ=255) aGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCACTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGc < 2:3175454/150‑1 (MQ=255) tggtgTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCt < 2:7693486/150‑1 (MQ=255) tgCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAg < 2:7523185/150‑1 (MQ=255) gcagcaGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAgc < 1:6857558/150‑1 (MQ=255) cagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCaa < 2:5321980/150‑1 (MQ=255) cagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCaa < 2:1974519/150‑1 (MQ=255) agTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAAc < 2:7028130/150‑1 (MQ=255) agTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAAc < 1:2116925/150‑1 (MQ=255) cTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTc < 2:6158765/150‑1 (MQ=255) ggATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCa < 2:3879378/150‑1 (MQ=255) cTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTc < 1:7925669/150‑1 (MQ=255) cTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTc < 2:2280841/150‑1 (MQ=255) cTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTc < 1:2327965/150‑1 (MQ=255) tCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctg < 1:5981041/150‑1 (MQ=255) aCTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctgct > 2:8166477/1‑150 (MQ=255) tCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGt > 2:2769404/1‑150 (MQ=255) tCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGt > 1:311689/1‑150 (MQ=255) cAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTc < 1:3572840/150‑1 (MQ=255) aaCTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTcc > 2:5409960/1‑150 (MQ=255) aCTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCa > 2:3253517/1‑150 (MQ=255) cTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCAc > 2:4558858/1‑150 (MQ=255) gCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGt < 1:1784709/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTg < 1:2959840/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTgg > 2:7811855/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCCCCGTGGGcc > 1:2195021/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGcc > 2:5197587/1‑150 (MQ=255) cGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGaa < 2:407171/150‑1 (MQ=255) ggTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAAc > 1:5683166/1‑150 (MQ=255) aaGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTg < 1:641044/150‑1 (MQ=255) agagCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTgg > 2:7272764/1‑150 (MQ=255) agagCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTgg > 2:6137311/1‑150 (MQ=255) agCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGcc > 2:4003524/1‑150 (MQ=255) cTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCctgc < 1:7160680/150‑1 (MQ=255) cTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCctgc < 2:8251953/150‑1 (MQ=255) tATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCg > 1:7555098/1‑106 (MQ=255) tATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCctgct > 2:8588850/1‑150 (MQ=255) tATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCctgct > 1:4018960/1‑150 (MQ=255) tATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCATGGGCCTGAACCTGGCCctgct > 1:2433559/1‑150 (MQ=255) tGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGt < 2:7428522/150‑1 (MQ=255) tCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTgg < 1:4812352/135‑1 (MQ=255) ccacTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGc < 2:6552364/150‑1 (MQ=255) ccacTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGc > 2:4897502/1‑150 (MQ=255) cacTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGcc > 1:8499333/1‑150 (MQ=255) acTCAACCCTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCCCGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCg < 1:8318737/150‑1 (MQ=255) cTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCgg > 2:4689588/1‑150 (MQ=255) tCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgc > 2:6673480/1‑150 (MQ=255) tCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgc > 2:331841/1‑150 (MQ=255) tCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCCGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgc > 2:6775299/1‑150 (MQ=255) tCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGGGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTGCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgc > 2:5034662/1‑150 (MQ=255) aaCACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgcgc > 2:1096536/1‑150 (MQ=255) 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tCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTcg > 1:5283357/1‑150 (MQ=255) gCATTGGCGCCGTTGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCACGCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTcgcg > 2:297372/1‑150 (MQ=255) gCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTcgcg > 2:6212011/1‑150 (MQ=255) cATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCgcgc < 1:331841/150‑1 (MQ=255) gcgcCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTg > 2:6508392/1‑150 (MQ=255) cgcCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTgg < 1:5516650/150‑1 (MQ=255) cgcCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTgg < 2:8050807/150‑1 (MQ=255) cgcCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTgg < 1:101395/150‑1 (MQ=255) aTGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGc > 2:8507385/1‑93 (MQ=255) tGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACAt > 1:7026423/1‑150 (MQ=255) tGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCCGGCGATCGCCTGGACGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACAt > 1:1680708/1‑150 (MQ=255) tCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGc < 1:7672329/150‑1 (MQ=255) ccaccaTCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGa < 2:4191566/150‑1 (MQ=255) ccaccaTCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGa < 1:4750515/150‑1 (MQ=255) ccaccaTCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGa > 1:96841/1‑150 (MQ=255) accaTCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATc < 2:5980583/150‑1 (MQ=255) gcaTCACCACCACCGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCa > 1:6711265/2‑150 (MQ=255) ccaTCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCa < 2:8377475/150‑1 (MQ=255) caTCACCACCACCGTGGTGATGGTGGTGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCAc > 1:3428589/1‑150 (MQ=255) aTCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCAcc < 2:7124609/150‑1 (MQ=255) caccacGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCAt < 2:2419285/150‑1 (MQ=255) accacGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCTGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc < 1:8815737/150‑1 (MQ=255) accacGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc < 2:7656760/150‑1 (MQ=255) cacGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCgc > 2:3505125/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACa > 1:3440636/1‑150 (MQ=255) ggtggtggtGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACaa > 1:225665/1‑150 (MQ=255) | TCGACACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCATCACCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACAA > NC_002947/4674577‑4674875 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |