| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,721,642 | G→C | 5.4% | Q626H (CAG→CAC) | PP_4173 → | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,721,642 | 0 | G | C | 5.4% | 1074.7 / 35.8 | 316 | Q626H (CAG→CAC) | PP_4173 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (122/177); new base C (6/11); total (128/188) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.12e-01 | |||||||||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
ACCCGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCT > NC_002947/4721493‑4721788 | aCCCGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGcagcag > 2:3064393/1‑150 (MQ=255) cccGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAgg < 2:852510/150‑1 (MQ=255) ccGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGt > 2:8443387/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaa < 1:4429845/150‑2 (MQ=255) tCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAgc < 1:3617262/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCACACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaatt < 1:4641355/150‑4 (MQ=255) cGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAgcgc > 1:508376/1‑150 (MQ=255) cGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaattc < 1:4822633/150‑5 (MQ=255) cGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaattc < 2:6158337/150‑5 (MQ=255) gCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCt < 2:222432/150‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCt < 2:2568157/150‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg < 2:5693263/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTgg < 2:7212309/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGt < 2:5130162/150‑1 (MQ=255) gCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAcc < 1:3630729/150‑1 (MQ=255) cccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAccc > 1:402296/1‑150 (MQ=255) cccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAccc > 2:5384159/1‑150 (MQ=255) cccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAccc > 1:2286993/1‑150 (MQ=255) ccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCg < 1:392881/150‑1 (MQ=255) ccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCg < 2:5816529/150‑1 (MQ=255) cAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCgg > 1:4353654/1‑150 (MQ=255) cAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCgg > 2:5033508/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGt > 1:4404570/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCa < 1:5745452/150‑1 (MQ=255) cgcCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGAc > 2:5180732/1‑150 (MQ=255) gCTACCGATCATCGCCCGGACCGCCACCGCGTTGCAGGGCGACCGCGATCGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCGTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACcgc < 1:6919259/150‑1 (MQ=255) cTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACcgcg > 2:2405544/1‑150 (MQ=255) tACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGACTTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGa > 2:4779086/1‑150 (MQ=255) tACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGa > 2:4920677/1‑150 (MQ=255) ccGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACt < 2:1804761/150‑1 (MQ=255) ccGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACt > 2:7304978/1‑150 (MQ=255) gATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTgg < 2:5618703/150‑1 (MQ=255) tcatcGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCg < 2:5860842/150‑1 (MQ=255) gCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATaaa < 2:6425468/150‑1 (MQ=255) gCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATaaa < 1:6149037/150‑1 (MQ=255) cccTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAAt > 2:2083416/1‑150 (MQ=255) cTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGc > 2:7673792/1‑150 (MQ=255) tGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCt > 2:1406889/1‑150 (MQ=255) ccGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTaaa < 1:107845/150‑1 (MQ=255) ccGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTaaa < 1:1556366/150‑1 (MQ=255) gCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGt < 1:8697945/150‑1 (MQ=255) gCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGt > 1:7411407/1‑150 (MQ=255) cAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTgt > 1:1373088/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCgg < 2:4358533/150‑1 (MQ=255) aCGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCgg < 1:6215505/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTc > 2:7453951/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTc > 2:4547096/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCtt > 2:4171480/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTa < 1:2483970/150‑1 (MQ=255) gggCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTaaa < 2:6291005/150‑1 (MQ=255) gCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAaca < 2:2891691/150‑1 (MQ=255) cGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAacac > 2:8312716/1‑150 (MQ=255) gACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACt < 1:713832/150‑1 (MQ=255) gACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACt < 1:1384620/150‑1 (MQ=255) gACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCGTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACt < 1:8497567/150‑1 (MQ=255) cgcgAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGa < 2:87654/150‑1 (MQ=255) cgcgAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGa < 2:47468/150‑1 (MQ=255) cgcgAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGa < 1:6457830/150‑1 (MQ=255) cgAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACa < 1:897406/150‑1 (MQ=255) gTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGAcc > 1:3371231/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCAt > 1:1994123/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATc < 2:71567/150‑1 (MQ=255) ccgccgGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGa > 2:1348442/1‑150 (MQ=255) cgccgGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGAc > 2:8244411/1‑150 (MQ=255) ggTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGa > 1:2829459/1‑150 (MQ=255) tATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGaaa < 1:4726815/150‑1 (MQ=255) aTGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGaaaa > 2:8018956/1‑150 (MQ=255) aTGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGaaaa < 2:4616062/150‑1 (MQ=255) ggACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATa < 2:7960327/150‑1 (MQ=255) ggACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATa < 1:5263627/150‑1 (MQ=255) ggACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATa < 1:2913762/150‑1 (MQ=255) gACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAg > 2:3581511/1‑150 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGa < 1:8623354/150‑1 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGa < 1:5652766/150‑1 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGa < 1:7975140/150‑1 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGa < 1:8293761/150‑1 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGa < 2:4049932/150‑1 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAACGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGa > 2:7042225/1‑150 (MQ=255) ccTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCa < 1:1785141/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCa < 2:1645860/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCa < 1:5495396/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCa < 2:1528857/150‑1 (MQ=255) cTGAGCAAAACCTTTCTCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACAGCGACTGGAGATAATTGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAg < 2:4659454/150‑1 (MQ=255) aaCCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCacac > 2:8072110/1‑150 (MQ=255) aCCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACAcc < 2:2748727/150‑1 (MQ=255) cccTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAACGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCt < 1:7042225/150‑1 (MQ=255) gccgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActtc > 1:73150/1‑150 (MQ=255) cgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActtctt > 1:6402414/1‑150 (MQ=255) gAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCa < 1:1674744/150‑1 (MQ=255) cgctGCAGCACCTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACAATGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAAAAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAg > 1:4156779/4‑150 (MQ=255) gctGCAGCACCTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAgg > 2:6778900/3‑150 (MQ=255) aTTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAgg < 1:3442403/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGt > 1:7685745/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGt < 1:7551640/150‑1 (MQ=255) ctGCAGCACCTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGt > 1:1050841/2‑150 (MQ=255) cagcagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTgcg < 1:5853235/150‑1 (MQ=255) agcagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTgcgc < 1:500653/150‑1 (MQ=255) gcagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCt > 1:3761503/1‑150 (MQ=255) gcagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCt < 1:5975592/150‑1 (MQ=255) gcagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCt > 1:6733332/1‑150 (MQ=255) | ACCCGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCT > NC_002947/4721493‑4721788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |