| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,866,177 | 0 | A | T | 7.2% | 755.2 / 6.3 | 285 | intergenic (‑134/+103) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (168/82); new base T (3/21); total (182/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACC‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCT > NC_002947/4866028‑4866326 | ggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGAt < 2:2938804/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGAt < 2:1216416/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGAt < 2:831761/150‑1 (MQ=255) 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gC‑GGTGATGTACC‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcgacga < 2:3426398/150‑1 (MQ=255) tGATGTACC‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACg > 2:3997545/1‑150 (MQ=255) gATGTACC‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTTGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 2:1850383/1‑150 (MQ=255) gATGTACC‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 2:5890214/1‑150 (MQ=255) | GGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACC‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCT > NC_002947/4866028‑4866326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |