| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,866,181 | A→C | 5.2% | intergenic (‑138/+99) | ligA ← / ← PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,866,181 | 0 | A | C | 5.2% | 882.3 / 23.8 | 285 | intergenic (‑138/+99) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (175/88); new base C (5/12); total (185/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.20e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGC > NC_002947/4866032‑4866329 | tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAc > 2:3623808/1‑150 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 1:8460827/150‑1 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 1:5139562/150‑1 (MQ=255) gcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTg < 1:5238377/150‑1 (MQ=255) ggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTa < 2:3333940/150‑1 (MQ=255) gggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑ACCCCACCCCCAAGGGCGTCACAAGCCCGAGGGC‑GGTGATGTAACGGTGGGAGCg > 1:3863238/1‑150 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:1350809/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 2:3108592/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 2:3442182/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCGTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCGTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 2:8228703/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCggg < 1:1141753/150‑1 (MQ=255) gATGTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAACGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCggg < 1:6416801/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGt < 1:1557428/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGAGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGt < 2:7849033/150‑1 (MQ=255) tttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGtt < 2:6629678/150‑1 (MQ=255) ttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGttt < 1:2387181/150‑1 (MQ=255) ttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAA‑CCCGCGCCCACAACCGCGAGACAAGCCCGAGGGC‑GGTGATGGACCGGGTGGAGCGGGttt > 1:6001709/1‑150 (MQ=255) gTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAc < 1:2277082/150‑1 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCACCCACAAGCGCGTCCCCAGCCCGAGGGC‑GGGGGTGTACCGGGAGGGGCGGGTTTTCCcg > 1:3101754/1‑150 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑ACCCCACCCACAAGGGCGTCACATCCCCAAGGGC‑CGTGAAGTACCAGTAGGAGCCGGTTTACCcg > 1:1428613/1‑150 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAA‑AACCCTCCCACAACGGCGGCCAATGCCCGAGGGG‑GGGGATGGAACTGTATGAGCGGGGTTAacccc > 1:3726759/1‑148 (MQ=255) ctctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGGAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 2:7987282/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:5647955/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:2004013/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAGGGC‑GGGGCTGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:2981526/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAAGCCCTAGGGC‑GGGGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 1:5827596/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCACCCCCCACGGCGTAACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:1239883/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCACCCACCAGGGCGTCCCATGCCCTAGGGC‑GGTGTTGTACCGGTAGGAGCGGGGTTAACCGCGa > 2:2360588/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 2:3160730/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAag > 2:7603638/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCAAAATGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 1:8676631/1‑150 (MQ=255) tGCAACGCAAATGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGAGTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAaga < 2:5948622/150‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag > 2:5131892/1‑150 (MQ=255) caaagcaaaTTAGCTGCTTGGGGTGGTGGTTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACATGGGCGTCACTTGCCCTTGGGC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAgg < 2:4064395/150‑1 (MQ=37) caaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑ACCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg > 2:8371717/1‑150 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGGCACATGCCCAAGGGC‑GGGGATGTACCGGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGcc > 1:5723753/1‑150 (MQ=38) agcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CACGCTCCCACAACGGCGTCACAAGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 2:1653689/1‑150 (MQ=38) gcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAG‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 2:6980822/150‑1 (MQ=255) caaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGc > 2:6439894/1‑150 (MQ=255) caaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAA‑CCCGCTCCCACCAGGGCGTCACATGCCCAAGGGC‑GGGGCTGTACCTGTAGGAGCGGGGTTAACCGCGAAGAGGCCGGc > 1:7931511/1‑150 (MQ=255) aaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAA‑ACCCCGGCCCCAAGGGCGTCACAAGCCCGAGGGC‑GGGGGTGTAACGGTAGGAGCGGGGTTTCCCGCGGAGAGGCCGGcaca > 1:6285375/1‑150 (MQ=255) cTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAGGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacga < 2:3559328/150‑1 (MQ=255) cTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑ACCCCACCCACAAAGGCCTCACAAGCCCAACCGC‑GGGGGTGGACAAGGAGGAGCGGGGTTACCCCCCAAAACGCCCGCACACGCAaccc > 1:5597686/1‑148 (MQ=255) ttGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCCCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacgac > 2:3916666/1‑150 (MQ=255) gtgCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCg > 2:4182303/1‑150 (MQ=255) gCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCGCCCCCAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGGGCTGTACCGGGAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCACGAAAACCGaa > 1:538323/1‑150 (MQ=38) ggggtCTGTTGACTGGGCCAGCCCCTTCGCGGGTAAC‑CCCGCTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGc < 2:4999784/147‑1 (MQ=38) gtgtCTGTTGAGTGGGCCCGCCTCTGCGCGGGAAAC‑CCCGCCCCCCCCCGGGCGTCACAGGCCCTCGGGG‑GTTGATGTACCTTTCGGCGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGcc < 2:8286794/150‑1 (MQ=255) tGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGcccgccg > 2:490270/1‑146 (MQ=255) gTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAgg > 2:3582513/1‑150 (MQ=255) gccggggCCCGCCTGTTCGCGGGTAAC‑CCCGCTCCCCCACGGGCGGCACAGGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTCCCTGTCGGCGGGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctg < 2:8458256/144‑1 (MQ=255) tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAAGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACGACGATACCCGAACCCGCCAGCACGCCCACAGgctgcac > 2:1131581/1‑148 (MQ=38) cccgCCTCTTCGCGGGTAAC‑CCCGCTCCCACACGGGCTTCACATGCCCTCGGGC‑GGTGATGTACATGTTGGCGCGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 2:718824/147‑1 (MQ=37) ccAGCCTCTTCGCGGGAAAA‑CCCGCTCCCACACGGGCGTCACAGGCCCTCGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 2:6072111/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAA‑ACCCCGCCCCCAAAGGCGTAAAAAGCCCCAGGGC‑GGGGATGTTACGGTAGGAGCGGGTTTAACCCCGCACAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCCAAACGGCCCGCACGCCCGCAGGCTGCTCTTTCgga > 2:1573372/1‑148 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAA‑CCCCCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCAAGGGC‑CGGGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCGCAGGCTGCTCGgtcgtcag > 2:8615349/1‑148 (MQ=38) tctTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATTTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTgg > 1:7187333/1‑150 (MQ=255) gagcgGGTTTA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATc > 1:8379970/3‑150 (MQ=255) cgcgGTTAAA‑CCCGCCCCCACACGGGCGCCACATGCCCTGGGGG‑GGTGATGTACCTGTAGGCGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt < 2:4665209/150‑1 (MQ=38) gcgGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTg > 2:7384309/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCCGCCCCCACAGGGGCGCCCCTGGCCCTGGGGG‑GTTGTTTTACGTTTCGGGGGGGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGt < 1:7108743/150‑1 (MQ=255) aaa‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcg > 1:8292957/1‑150 (MQ=255) a‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:7483670/1‑150 (MQ=255) a‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 1:4827875/1‑150 (MQ=255) a‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:4145373/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAaca > 1:2619154/1‑86 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAaca < 2:2619154/87‑2 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:4416727/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:5434214/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:6902267/1‑150 (MQ=255) cccccACACGGGCTTCACTTGCCCTGGGGG‑GGTTATGTACCTGTTGGCGGGGTTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 2:4798767/148‑1 (MQ=255) cTCCCACAAGGGCGTCACTTGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTTGGTGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 2:7338057/150‑1 (MQ=255) tCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg > 1:1692595/1‑150 (MQ=255) cccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGt > 1:952692/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 1:3972499/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 1:2979389/1‑150 (MQ=255) cacaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa > 2:1074164/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 2:2186747/1‑150 (MQ=255) accgggCGTCACTTGCCCTCGGGG‑GGTGTTGTACGTTTCGGCGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgc < 2:3988604/147‑1 (MQ=255) aaGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgcg > 1:7509710/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgcg > 1:3564883/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgcg > 2:5537618/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgcg > 1:7509363/1‑150 (MQ=255) tCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgcg > 2:7437278/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:7319620/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 2:915592/1‑150 (MQ=255) ccggCCCTTGGGG‑GGTTTTGAACCTGTAGGCGGGGTTTTACCCGCGATGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTc < 1:3623808/147‑1 (MQ=255) caTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTc > 1:7623656/1‑150 (MQ=255) gCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCTGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGTATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGAGCACGGCGCTCGaa > 1:4542385/1‑150 (MQ=255) gCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGaa < 2:8106183/150‑1 (MQ=255) ccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACt > 1:4506519/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga > 2:3361028/1‑150 (MQ=255) gggC‑GGTTATGAACATTAAGGAGCGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcgac < 2:1431714/150‑1 (MQ=39) gggC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcgac < 2:8655345/150‑1 (MQ=255) gC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa > 2:4953213/1‑126 (MQ=255) ggTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATa > 2:7051454/1‑150 (MQ=255) gATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTTGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 2:1850383/1‑150 (MQ=255) gATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGc > 2:5890214/1‑150 (MQ=255) aTGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCt > 1:5774160/1‑150 (MQ=255) gTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTgg > 1:146166/1‑150 (MQ=255) | TTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGC > NC_002947/4866032‑4866329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |