| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 367,370 | 0 | T | G | 5.2% | 982.7 / 25.2 | 330 | intergenic (‑53/+21) | PP_5442/PP_0306 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (165/144); new base G (11/9); total (177/153) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
CTGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTAGAGGTTTTGTC > NC_002947/367222‑367519 | tGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGCGCGctct > 1:6354231/1‑150 (MQ=255) tGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGCGCGctct < 2:5320873/150‑1 (MQ=255) tGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGCGCGctct > 1:2530774/1‑150 (MQ=255) 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aaaTCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGt < 2:1709364/150‑1 (MQ=255) ccTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTGGATGCTTAGTCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTAcc < 2:8809323/149‑1 (MQ=255) cTTCCCATGTCTCGCGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGGTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTAccc < 2:7058266/150‑1 (MQ=255) cTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTAccc < 2:126548/150‑1 (MQ=255) cTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTAccc < 2:2315975/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gggTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCgg > 2:3614728/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTaga < 1:5912615/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTagag > 2:7347526/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTagag > 2:2122451/1‑150 (MQ=255) aGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTAGAgg > 1:3379611/1‑150 (MQ=255) 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CTGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCAGATGACCAGAACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTAGAGGTTTTGTC > NC_002947/367222‑367519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |