Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,215,290 | T→G | 7.1% | intergenic (‑159/+19) | rnd ← / ← PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,215,290 | 0 | T | G | 7.1% | 576.9 / 3.0 | 217 | intergenic (‑159/+19) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (105/87); new base G (5/17); total (112/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.02e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
ACTAACATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCG > NC_002947/5215143‑5215438 | aCTCACCTTGGCGCGCAGTAGATAC‑G‑GCGCGGGCACGGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGc < 2:3231381/150‑1 (MQ=255) aCTAACATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGc < 2:3841430/150‑1 (MQ=255) aCTAACATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGc > 2:7728576/1‑150 (MQ=255) aCTAACATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGc < 1:2052188/150‑1 (MQ=255) tAACATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGccc > 2:1562899/1‑150 (MQ=255) tAACATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGccc > 2:3813655/1‑150 (MQ=255) aaCATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGGATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCg > 2:5424315/1‑150 (MQ=255) aaCATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGAAGGCAAAACGGTGTATGGCCCGGGGTTTCCCCGGTTCGCGGGCGTGCCCg > 1:2536962/1‑150 (MQ=255) aCATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGAAGGCAAAACGGTGTATGGCCCGGGGTTTCCCGGGTTCGCGGGCGTGGCCGc > 1:4030870/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTc > 2:4799694/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCCGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTccc < 2:1355488/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTccc > 2:6522775/1‑150 (MQ=255) ccgcgcCGTATATACTGCGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTccc > 2:712775/2‑150 (MQ=38) cgcAGTATATCC‑G‑GCGCGGGCAGTGCGGGTGAAACGGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCGGGGTGCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAgg < 2:6169760/150‑1 (MQ=38) gcAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGGTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAggg > 2:4312903/1‑150 (MQ=255) cAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGc < 2:7794203/150‑1 (MQ=255) aGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCt > 2:2116308/1‑150 (MQ=255) tatataC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCATGAAGGCAACACCGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTc > 1:4214026/1‑150 (MQ=255) tataC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAg > 2:5375123/1‑150 (MQ=255) g‑gCGCGGGCACGGGGGGTTAAAGTGTCCGGCTTTTGGGGGGCAGTCCCCCGTGTGGTGGCGGGCGCGCCCGCGATTGAAGGCACCCGGGTGTAGGGCCCGGGTTGGCCGGGGTGCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCtt < 1:8649724/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGCACTGCGGGTGAATCTGTCCCGCTTTTGGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTGCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTg < 2:6280755/150‑1 (MQ=255) gcgGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGGGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACCCCGGGTATGGCCCGGGGTTGCCCGGGTTCGCGGGCGGGGCCGCTCCCACACGGCGTCAGCGCTTGgc > 1:8233763/1‑150 (MQ=255) gggCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGTGCGGGCGCGCCCCCGCAAGGAGGCCACACGGTGTATGGCCCGGGGTTGCCCGGGTTAGCGGGCGGGGCCCCTCCCACACGGCTTGAGCGCTTGgccg > 1:6111665/1‑150 (MQ=255) ggggTGAAAGTGTCCCGCTTTTGGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAATGACGGCAACACGGTGTATGGCCGGGGTGTGCCGGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCaa < 2:3703500/149‑1 (MQ=38) cGGGTTAACCTGTCCGGCTTTTCGGGGGCAGCCCACCCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCGGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGGGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCaa < 1:7131189/150‑1 (MQ=255) cGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAATGTAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCaa > 1:7744355/1‑150 (MQ=255) gttGAAACTGTCCGGCTTTTGGGGGGCTGTCCACCCTGTGGTAGCGGGCGCGCCCGCGAATGACGGCAACAGGGTTTTTGGCCCTGGTTTGCCGGGTTTCGCGGGGGGGCCCGCTCCCTCAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAgg < 2:4174666/148‑1 (MQ=255) tGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGTGCGGGCGCGCCCGCGGATGAAGGCAACACGGGGGATTGCCCGGGTTTGCCCCGGTTCGCGGGCGTGCCCGCGCCCACAGGGCGGCCGCGCGTGGCCGCCACCCAAgggc > 1:7652982/1‑148 (MQ=255) tGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCGTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGcc > 1:3514641/1‑150 (MQ=255) tGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGGCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCTGGCGGCCAAgcgc < 2:4037844/150‑4 (MQ=38) ggAACCTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGTAGCGGGGGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGcc < 2:6204370/149‑1 (MQ=255) gAAACTGTCCCGCTTTTGGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACAGGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccg < 1:7197220/150‑1 (MQ=255) tgcccccGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCCACACCGGGTATGGCCCGGGGTTGCCCGGGTTCGCGGGCGGGCCCGCGCCCACAGGGCGTCAGCGCGTGGCCGCCCGCCAAGGccggcaa > 1:1969639/5‑150 (MQ=38) cTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaa > 1:7998370/1‑150 (MQ=255) gTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaacc < 1:6522775/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCAACCCATTGTGAGCGGGCGCGCCCCCGAAGGAAGGGCCCACGGTGGGGGGCCCGGGGTTGCCCGGGTTCGCGGGGGGGCCCGCGCCCCCGGGGCGGCAGCGCGGGGCCGCGAGCGCGGGccggcccgcg > 2:8117287/1‑145 (MQ=255) cccGTTTTTGGGGGGCAGTCCACCGTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCTATTGACGGCCACCGGGTGTATGGCCGGGTTTTGCCGGGGGTGGCGGGGGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaccgg < 1:3336725/150‑1 (MQ=255) cccGCTTTGCGGGGGCCGTCCCCCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCTACTGAAGGCAACACGGGGTTTGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaccgg < 2:6980284/150‑1 (MQ=38) ccGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaccggc < 2:8747479/150‑1 (MQ=255) ccGCTTTTCGGGGGCAGGCCCCCGGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGACGGCACCCGGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCGGGGTTCGCGGGGGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaccggc < 2:5943981/150‑1 (MQ=255) cGCTTTTCGGGGGCTGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGACGGCAACACGGTTTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaactgccc < 2:3397216/150‑6 (MQ=38) cGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCAGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCCGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaacggca > 1:7096688/1‑150 (MQ=255) cTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCaaa > 1:5753691/1‑150 (MQ=255) ttCGGGGGCTGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACCCGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGGGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACAt < 2:1705351/150‑1 (MQ=255) gtggggggCCGTCCCCCGGGGGGGCGGGGGCGCGCCCGCTAATGACGCCAACTGGGTTTAGGGCCGGGTTTTGCCCGGGTTCGGGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACAt < 1:5242162/147‑1 (MQ=255) cgcGGGGCCCGCCCCCCCTGTGGGCGCGGGCGCCCCCGCGAAGGAAGCAAACACGGGTTCGGGCCGGGGTTGCCCCGGGTTCGCGGGCGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACAt < 1:6321461/148‑1 (MQ=255) ggggCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTGTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCGTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCACCCGGCACACATGTcc > 1:1377623/1‑150 (MQ=38) ggCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCACCCACAGGGCTTCAGCGCGTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCCAACAAGTCCAg > 1:7197073/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGAct > 2:4718104/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACAAGTCCAGCGAct > 1:8522165/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCCGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCCGCAAACAAGTCCCCCGAct > 1:7392752/1‑150 (MQ=38) cccccTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCATGAAGCCAACACGGTGTCTGGCCCGGGTTTGCCCGGGTGCGCGGGCGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGActgc < 1:4971575/148‑1 (MQ=255) cACCGTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGACGGCAACAGGGTGTAGGGCCGGGGTTGGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGActgc < 2:3876394/150‑1 (MQ=38) aCCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGActgct > 1:4220380/1‑150 (MQ=255) cccTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATTACGGCAACACGTTGTATGGCCCGGGTTTGCCGGGGTTCGGGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGActgctg < 1:3540412/150‑1 (MQ=38) cccTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGActgctg > 2:2950466/1‑150 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTgg > 1:5478732/1‑150 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTgg > 1:296858/1‑150 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTgg < 2:8633599/150‑1 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGACGGCAACACGGAGTATGGCCCGGGTGTGCCCGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTa < 2:5291902/150‑1 (MQ=255) tgggggAGCGGGCGCGCCCGCGAATGACGGCAACACGGTGTATGGCCGGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTa < 1:8595627/147‑1 (MQ=255) tgggggAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTa < 2:6621055/147‑1 (MQ=255) gggAGCGGGCGCGCCCGCGACTGACGGCACCCCGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTagag < 2:7577982/150‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGTTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGc < 2:605441/150‑1 (MQ=255) gggCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGt > 2:8558451/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCCGCGAATGAAGGCAACCCGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTAt < 1:7884148/150‑1 (MQ=255) cgcCCGCGAATCACGGCAACCGGGTGTCTGGCCCGGGTTTGCCGGGGTCCGGGGGCGGCCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTa < 1:3831933/150‑1 (MQ=255) ccGCGACTGCAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGGTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCCGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTCTGTAccg > 2:1811830/1‑149 (MQ=39) ccGCGAATGACGGCAACCGGTTTTAGGGCCGGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCt < 1:1223840/150‑1 (MQ=255) gAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCaa > 1:3563705/1‑150 (MQ=255) gAAGGCAACCGGGTGTATGGCCCGGGTTGGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAgg < 2:2930922/150‑1 (MQ=255) aaGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGc > 2:7268770/1‑150 (MQ=255) ggCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCa > 1:2670868/1‑150 (MQ=255) gtgtATGGCCCGGGTTTGCCGGGGTTGGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAg < 1:6958103/150‑1 (MQ=255) gtgtATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAg < 2:5678471/150‑1 (MQ=255) gtgtATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAg > 1:1394531/1‑150 (MQ=255) gtAGGGCCCGGGTTTGCCCGGGGTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTg < 2:5098715/150‑1 (MQ=255) cgcgaacccGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTg > 2:1416341/7‑150 (MQ=255) tGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGaa < 2:7870529/150‑1 (MQ=255) gggTTTGCCGGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGtt < 2:6850736/150‑1 (MQ=255) tttGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACCTGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTc < 2:8468443/150‑1 (MQ=255) tttGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTc < 2:1874377/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTcc < 1:4312903/150‑1 (MQ=255) cccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg > 1:129205/1‑150 (MQ=255) cccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg > 1:2676746/1‑150 (MQ=255) cccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg < 1:3628873/150‑1 (MQ=255) cccGGGGTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg < 1:680876/150‑1 (MQ=255) cttcattCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTggg > 1:387599/6‑150 (MQ=255) cGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGa > 1:5672410/1‑150 (MQ=255) ggccgcgGGCGGCCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAg < 1:1562899/147‑1 (MQ=255) gTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTa > 2:1018136/1‑90 (MQ=255) gTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTa < 1:1018136/90‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGc > 2:7664668/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGc > 2:2374625/1‑150 (MQ=255) gagcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGTCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCg > 2:2573729/3‑150 (MQ=255) gagcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCg > 1:6595752/3‑150 (MQ=255) cgcgGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCgg < 2:939479/150‑1 (MQ=255) gcgggcggGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCggg < 2:2536962/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCggg < 1:5424743/150‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGc > 2:1246515/1‑150 (MQ=255) | ACTAACATTGGCGCGCAGTATATAC‑G‑GCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCG > NC_002947/5215143‑5215438 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |