| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 403,315 | 0 | G | A | 5.4% | 815.6 / 21.7 | 257 | intergenic (‑115/+54) | msrA/PP_0337 | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/sensory box protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (152/90); new base A (11/3); total (163/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
TTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCGCCCGGGAATCGGCCGGTCGAACAGGTAGCCCTGGCCCACGTCGCA > NC_002947/403167‑403464 | ttttGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGt < 2:5717487/150‑1 (MQ=255) tttGGTCCCCAGGATGTCCGACCGCAGGACCAGGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCACCGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTg < 2:2870340/150‑1 (MQ=38) ttGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGAACACCACAACCTTTGAAACCTGTGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCATGc < 2:7521/150‑1 (MQ=18) 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tgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCGCCCGGGAATCGGCCGGTCGAACAGGTAGCCCTgg < 2:4932578/150‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCGCCCGGGAATCGGCCGGTCGAACAGGTAGCCCTgg > 1:4931287/1‑150 (MQ=255) tttcgCGGGCACGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCGCCCGGGACTCGGCCGGTCGAACAGGTAGCCCTGGc > 2:3676883/5‑150 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCGCCCGGGAATCGGCCGGTCGAACAGGTCGCCCTGGcc > 2:6626816/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCGCCCGGGAATCGGCCGGTCGAACAGGTAGCCCTGGcc > 1:8082725/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |