| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,345,602 | C→G | 5.6% | P152A (CCG→GCG) ‡ | folK → | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,345,602 | 0 | C | G | 5.6% | 1097.8 / 38.6 | 324 | P152A (CCG→GCG) ‡ | folK | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (125/181); new base G (7/11); total (132/192) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 335 total aligned reads displayed.
TGACCAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTGGCA > NC_002947/5345454‑5345751 | cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtc > 1:6139971/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtc < 2:6021977/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtc < 1:3306208/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtcgtc < 2:3637350/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAACGGGCATtcgtc < 2:1974021/150‑1 (MQ=255) cTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGc < 2:5585484/150‑1 (MQ=255) cTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGc < 1:7255815/150‑1 (MQ=255) tCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCACTCGCACAACTGCTCGACGAACGGGCATtcgtcgagc < 2:749347/150‑4 (MQ=255) cGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAACGGGCATtcgtcgagca < 1:7505981/150‑5 (MQ=255) cGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAACGGGCATtcgtcgagca < 1:8637250/150‑5 (MQ=255) gACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTg > 1:2046099/1‑150 (MQ=255) aCCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTgg < 1:737977/150‑1 (MQ=255) ccAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGa < 1:5825746/150‑1 (MQ=255) ccAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGa > 1:6877693/1‑150 (MQ=255) ccACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGGTTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGc < 2:6252693/150‑1 (MQ=255) ccACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGc > 2:7786603/1‑150 (MQ=255) ccACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGc > 1:1332392/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCt < 1:5860534/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCt < 2:1571999/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCt < 1:2994353/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGAAAGTGCCCCATTACCAAATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGAATCCGTAGCCCGAAATCGTACCGGGGGATATCCCCCTGGACGAAGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTCGAACGCCt > 2:1834464/1‑150 (MQ=255) ccTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTa < 2:8007595/150‑1 (MQ=255) gAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAgcc < 1:4730736/150‑3 (MQ=255) aaGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCg < 1:5450086/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCg < 2:1522873/150‑1 (MQ=255) tGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGc < 2:4087738/150‑1 (MQ=255) gCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCg > 1:5081312/1‑150 (MQ=255) gcGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGt < 2:4415849/149‑1 (MQ=255) cGCAGTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGATCgggtcct < 2:4146462/150‑5 (MQ=255) cATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTcc < 2:424673/150‑1 (MQ=255) cATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTcc > 2:7185924/1‑150 (MQ=255) cATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTcc > 2:6437831/1‑150 (MQ=255) tACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGc < 1:2435264/150‑1 (MQ=255) cccatgcaggCCCGCCCGTTCGTGCTGTCTCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTg < 2:3495670/148‑1 (MQ=255) cacaTGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTg > 1:1576156/1‑150 (MQ=255) acaTGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGc < 1:1055317/150‑1 (MQ=255) tgcCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCa < 1:3932966/150‑1 (MQ=255) ccgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCt < 2:2996490/150‑1 (MQ=255) ccgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCt < 1:8475451/150‑1 (MQ=255) cgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTc > 1:6563177/1‑150 (MQ=255) cgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTc > 1:8177777/1‑150 (MQ=255) cgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTc < 2:1454499/150‑1 (MQ=255) gcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCg < 2:5470685/150‑1 (MQ=255) cccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCa < 1:3507518/131‑1 (MQ=255) ttCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAAc < 2:2063725/150‑1 (MQ=255) cGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGc < 1:7701408/150‑1 (MQ=255) gTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGcc > 1:3609821/1‑150 (MQ=255) gTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGcc < 2:4359335/150‑1 (MQ=255) tGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCa > 2:6783494/1‑150 (MQ=255) tGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCa < 2:4301493/150‑1 (MQ=255) tGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCa < 2:2202407/150‑1 (MQ=255) tGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCa < 2:5734284/150‑1 (MQ=255) cTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGt > 2:6150467/1‑150 (MQ=255) gTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTaa < 2:7422151/150‑1 (MQ=255) tCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAacac > 2:4771993/1‑150 (MQ=255) tCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAacac < 1:291484/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATc < 1:1934136/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATc < 1:5273034/150‑1 (MQ=255) gAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTa > 1:4179878/1‑150 (MQ=255) aaCTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTaa < 1:2617799/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTaa < 1:4295726/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTaa < 1:1717133/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTaa < 1:1079466/150‑1 (MQ=255) tGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACaa > 1:5623023/1‑150 (MQ=255) tACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGc < 2:5108431/150‑1 (MQ=255) aCCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTAGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCg < 1:2289015/150‑1 (MQ=255) ccGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCgg < 1:4144497/150‑1 (MQ=255) ggggATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTaa > 1:4440081/1‑150 (MQ=255) ggggATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTaa > 2:2354395/1‑150 (MQ=255) aTTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAgg < 1:4619482/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAgg < 2:2687567/150‑1 (MQ=255) tttCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAggg > 1:7885488/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAg < 2:6921082/116‑1 (MQ=255) cGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGAt > 1:4320959/1‑150 (MQ=255) cGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGAt < 2:1184401/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGAtt < 2:921604/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTg > 1:6936902/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGGTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTg > 2:4955328/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGa < 1:7634225/150‑1 (MQ=255) ccGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTc < 2:3811601/150‑1 (MQ=255) cGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTcc < 2:3367416/150‑1 (MQ=255) cGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTcc > 1:421646/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCca < 2:6627249/150‑1 (MQ=255) cTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCa > 1:7154913/1‑150 (MQ=255) gCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGa < 2:8482105/150‑1 (MQ=255) aaCTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACtat > 1:1984977/1‑150 (MQ=255) aCTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACtata < 1:873840/150‑1 (MQ=255) gCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGc < 1:3086070/150‑1 (MQ=255) cTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCg > 2:6474975/1‑150 (MQ=255) cgacgaACGGGCATTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTc > 1:594749/1‑150 (MQ=255) gacgaATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTcc > 2:6623776/1‑150 (MQ=255) gacgaATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTcc > 1:6220796/1‑150 (MQ=255) gaATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCgt > 2:8707054/1‑150 (MQ=255) aaTGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCgtg < 2:6877693/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTCGTCGGCCTGGATCGGCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATGGCCACCTCGGTTACGCCAGTATCACCCTTATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTgg < 1:8706459/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTgg < 1:1813648/150‑1 (MQ=255) cccGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACACGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACGATAGGCGTCCCGTGTGGc > 1:3792635/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTATACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTGGCa < 2:4513298/150‑1 (MQ=255) ccGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTGGCa > 2:8241119/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTGGCa > 2:3566/1‑150 (MQ=255) | TGACCAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTGGCA > NC_002947/5345454‑5345751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |