Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,345,604 | 0 | G | A | 5.4% | 1064.8 / 30.1 | 332 | P152P (CCG→CCA) ‡ | folK | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (132/182); new base A (7/11); total (139/193) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
ACCAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCCCGTGTGGCAC > NC_002947/5345456‑5345752 | cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtc > 1:6139971/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtc < 1:3306167/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtcgtc < 2:3637350/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |