| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 5,451,289 | T→G | 15.0% | L146R (CTC→CGC) | thiE → | thiamine‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,451,289 | 0 | T | G | 15.0% | 580.1 / 17.2 | 324 | L146R (CTC→CGC) | thiE | thiamine‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (133/120); new base G (45/12); total (183/141) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.14e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
GGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCC > NC_002947/5451141‑5451438 | ggCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTc < 2:500118/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGa < 2:6627075/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAg < 2:166381/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGcgcgcg > 1:5130947/1‑148 (MQ=255) gTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGc < 1:7109315/150‑1 (MQ=255) gTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGc < 1:1982796/150‑1 (MQ=255) gTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGGGc > 1:235072/1‑150 (MQ=255) tCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGcc > 2:4923777/1‑149 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAgg > 2:368908/1‑150 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAgg < 1:8292411/150‑1 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAgg > 1:8812849/1‑150 (MQ=255) ggCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGc < 1:6386565/150‑1 (MQ=255) gCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGGCGGcc > 1:3160236/1‑150 (MQ=255) gCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCAGGcc > 1:232854/1‑150 (MQ=255) gCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTGTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCAGCGCCAGCAGGcc > 2:3985668/1‑150 (MQ=255) cAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGccc < 2:2523644/150‑1 (MQ=255) cAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGccc < 2:7406484/150‑1 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGcccc > 2:7984235/1‑149 (MQ=255) atcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCTAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTTTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGccgac < 2:8105134/150‑4 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCcgcg < 2:644217/150‑1 (MQ=255) atcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGcc < 2:4336475/150‑1 (MQ=255) atcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGcc > 1:1449470/1‑150 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCCCGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCCGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCGTTGGCCGCTTCGGCCAGTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCCACGTCGGCCGGCGCGAGCGGGCCCGCGccc > 2:112699/1‑150 (MQ=255) ggCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCCGGCcccccccccg > 1:7014273/1‑148 (MQ=255) ggCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCAGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAg > 2:188088/1‑150 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGCGCACGCCCGCGcccccg > 1:2686516/1‑147 (MQ=255) tCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCCGGTg > 1:4942609/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCCGCGACGGCGCCAGCTACGGGGCCTTTGGCGGCTTCTTCAATTCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGCCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGaaa < 2:1749547/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCACGCCAGCCTCGAACGGGCCGCCCTGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGATAGGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTGGGCCTGCTCGGGCAGGCCCGCGCCCAGGTGaaa < 1:2465124/150‑1 (MQ=255) cTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCCACGTCGGCCTGCGCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGGGAAACt > 1:2879924/1‑150 (MQ=255) tGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTg > 2:4846982/1‑150 (MQ=255) cACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCCGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTATTCAATTCTGACCCCACCCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCg < 1:669131/150‑1 (MQ=255) cACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGCGCCGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCg > 1:4877369/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCACGCCCCCCCCCCCGTGAAAAAGCCGagc > 1:5915017/1‑148 (MQ=255) cAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCAGGCCCCCGCCCACCTGAAACTGCCGAACGc > 1:6806223/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCCCGGGAAACTGCCGAACGcc > 1:4575708/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGa > 2:1524457/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGa > 2:5934105/1‑150 (MQ=255) 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ccAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAAAGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACg > 1:6210651/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACg > 1:6593698/1‑150 (MQ=255) cagcGGGCGCGCCCGGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGc > 2:504619/4‑150 (MQ=255) cagcGGGCGCGCCCGGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCCTCACCCGCGCCAACGCCGCCCCACGGGTCGCCCACCGCGCCGCCCAGCTGGCGGTGATCCACGGc > 1:6273819/4‑150 (MQ=255) cGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGt > 2:4251227/1‑150 (MQ=255) gcgccccccc‑GCTCCCCACGACCGCCACCTCCACCCGCCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGtt < 1:1495166/143‑1 (MQ=255) gcgcgcCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg > 1:1893425/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg < 2:6550939/150‑1 (MQ=255) cgcCC‑GCGGCCACCGCGGGCCGGCGCGCCCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTg < 1:1698397/150‑1 (MQ=255) ccc‑GCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGACCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGcc < 2:5130947/150‑1 (MQ=255) cagCTGCCAACGTCGGCAAGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCCATCGCCGTTATCGGTGTCATCAACATAGAAAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCCAACTGCTTGCGGTGAAACAAGGCTTGTTATGTGCCg > 2:3308562/3‑150 (MQ=255) c‑GCTGCCCACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGa < 2:8792107/150‑1 (MQ=255) gCCACCGGCGGCCGGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgc < 2:3329200/150‑1 (MQ=255) ccAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcg > 2:1632228/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCAGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:4454453/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAg < 2:7169268/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAg > 2:2310430/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCGGCTCGTGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAg < 1:4360887/150‑1 (MQ=255) gcgaccggCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAgg < 2:2398890/143‑1 (MQ=255) gCCTGCCCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCAGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCCGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAg < 1:368908/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCa > 1:3370070/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAccc > 1:3444318/1‑150 (MQ=255) | GGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCC‑GCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCC > NC_002947/5451141‑5451438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |