| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,456,617 | C→T | 5.5% | P51S (CCG→TCG) | lnt → | apolipoprotein N‑acyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,456,617 | 0 | C | T | 5.5% | 1286.4 / 37.4 | 401 | P51S (CCG→TCG) | lnt | apolipoprotein N‑acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (190/189); new base T (12/10); total (202/199) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 408 total aligned reads displayed.
TGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTGGCC > NC_002947/5456468‑5456766 | gTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCcgc > 2:2334504/1‑150 (MQ=255) gATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCa < 1:2404653/150‑1 (MQ=255) aTCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGGGCTGAGCTCgcgcagg < 1:3838795/150‑4 (MQ=255) tCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAgg > 2:2151569/1‑150 (MQ=255) tCACCAGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCAgcgcgccc > 2:1076201/1‑146 (MQ=255) ccGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAt > 2:5129891/1‑150 (MQ=255) ccGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAt > 2:8058387/1‑150 (MQ=255) cGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAtg < 1:7688325/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCaagg < 1:1036487/150‑4 (MQ=38) ccccGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAtgtg < 2:3563183/150‑1 (MQ=255) ccccGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAtgtg < 1:8545983/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCaaggtag < 1:6330963/150‑7 (MQ=38) cGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcg > 2:5719792/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcgtg < 1:1750124/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcgtgg < 1:5879908/150‑1 (MQ=255) cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtggtg < 1:7414047/150‑1 (MQ=255) cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtggtg < 2:6499771/150‑1 (MQ=255) cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtggtg < 1:659430/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggttt < 1:7785353/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCATTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttggg > 1:201386/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCCCGGGCGGCCGGGGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttggg < 1:5251794/150‑1 (MQ=255) tgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggtttg > 2:8400539/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGgtttgggtttgg < 2:6798807/150‑1 (MQ=255) gcggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTAt < 2:7218006/150‑1 (MQ=255) gcggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTAt < 1:8193860/150‑1 (MQ=255) cggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATg < 1:3296128/150‑1 (MQ=255) ggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATgg > 1:3392762/1‑150 (MQ=255) ttCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCAc > 1:1429448/1‑150 (MQ=255) cACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtg > 1:8633073/1‑150 (MQ=255) cACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtg > 2:1384373/1‑150 (MQ=255) aCCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtgg < 1:7185030/150‑1 (MQ=255) cccTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtggt < 2:7399152/150‑1 (MQ=255) cctcctGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtggtg < 1:4998266/150‑1 (MQ=255) ctcctGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtggtgg < 1:5885934/150‑1 (MQ=255) tggccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCt > 1:7097108/1‑150 (MQ=255) tggacctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCt > 2:3303088/1‑150 (MQ=255) gccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTAc < 2:426987/150‑1 (MQ=255) gccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTAc < 2:5201216/150‑1 (MQ=255) cctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGt > 2:661256/1‑150 (MQ=255) gcCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCAt > 2:726404/1‑150 (MQ=255) gTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGaa < 1:4355322/150‑1 (MQ=255) cGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAacac > 1:5462891/1‑150 (MQ=255) cGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAacac < 2:5948165/150‑1 (MQ=255) aTCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTAc > 2:7472895/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTAcgg > 1:6178515/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTAcggc < 2:2015465/150‑1 (MQ=255) ggCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTAcggcg > 2:4987608/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTAcggcgg > 1:2996729/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGgcgc < 2:1685507/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGcc < 1:3988021/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCGGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGcc > 1:496249/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCt > 1:7705361/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTc < 2:2849254/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgc < 2:6187493/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgcc > 2:1231608/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgcc > 1:5356500/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgcc < 1:2260385/150‑1 (MQ=255) gtgtTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgccg < 2:3380967/150‑1 (MQ=255) tgttgtCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgccgc < 1:1321586/150‑1 (MQ=255) tgttgtCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTcgccgc > 2:686651/1‑150 (MQ=255) tCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGctgctg > 1:654016/1‑150 (MQ=255) tCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGctgctg < 1:2775153/150‑1 (MQ=255) tCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGctgctg > 2:632898/1‑150 (MQ=255) cATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGGTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGc > 2:261381/1‑150 (MQ=255) aTCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCa > 2:822977/1‑150 (MQ=255) aTCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCa > 1:1083857/1‑150 (MQ=255) tCGCGGTGCTCTACCATGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCaa > 1:8025610/1‑150 (MQ=255) ggTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgt > 2:7841645/1‑150 (MQ=255) ggTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgt < 2:3246680/150‑1 (MQ=255) gTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgtg < 1:968111/150‑1 (MQ=255) gTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgtg < 1:7844865/150‑1 (MQ=255) tGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgtgt < 1:3521563/150‑1 (MQ=255) ctctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTtg > 2:4691767/1‑150 (MQ=255) ctctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTtg > 1:8332790/1‑150 (MQ=255) ctctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTtg > 2:1470105/1‑150 (MQ=255) tctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGtt > 2:798793/1‑148 (MQ=255) ctACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTtgct < 1:6400046/150‑1 (MQ=255) tACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTtgctg < 2:8604381/150‑1 (MQ=255) tACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAGGTGGCGTGGCTGGGGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGGGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCACTCGTGTtgctg > 2:4821741/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTgctgct > 2:3963878/1‑150 (MQ=255) ttGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTgg > 2:2577431/1‑150 (MQ=255) ggCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCg < 1:4722026/150‑1 (MQ=255) gcctggcgcGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGt > 1:3246318/6‑150 (MQ=255) gcctggcgcGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGt > 2:2981607/6‑150 (MQ=255) cT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGttc > 2:536173/1‑150 (MQ=255) cT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGttc > 1:2809280/1‑150 (MQ=255) t‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGttct > 2:3730662/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTcg > 1:6792348/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTcg < 1:7521543/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTcg > 2:4630912/1‑150 (MQ=255) gAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgt > 2:158132/1‑128 (MQ=255) aGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTcgccg < 1:2591280/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTcgccg < 1:1634590/150‑1 (MQ=255) cTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCa > 1:4148126/1‑150 (MQ=255) tCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCAc > 1:1499699/1‑150 (MQ=255) aGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGTGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGTTCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTg < 2:1883946/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTg > 1:5590798/1‑150 (MQ=255) aGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTg < 2:7737720/150‑1 (MQ=255) cccGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTGGc > 2:769433/1‑150 (MQ=255) cccGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTGGc > 2:4128745/1‑150 (MQ=255) | TGCGTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTGGCC > NC_002947/5456468‑5456766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |