| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,511,584 | 0 | T | A | 9.1% | 379.6 / 2.2 | 152 | intergenic (+46/‑153) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
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Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAG > NC_002947/5511435‑5511733 | tggtgctggGGGTGATGGCCCCGCTGGGGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:7974426/150‑1 (MQ=255)cggcgctggGGGTGATGGTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:7974672/146‑1 (MQ=255) gggcggggggTGATGGGCCCGCCGGCGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGGGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGGGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:8607191/145‑1 (MQ=38) 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ccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 1:3466632/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 2:6581608/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 2:6569021/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 1:5002062/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 1:6588197/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAagaaga > 2:7709268/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGAc > 1:1896822/1‑150 (MQ=255) tCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTg > 1:4803640/1‑150 (MQ=255) ccTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGc > 2:3846762/1‑150 (MQ=255) cTACGCGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa < 1:7130177/150‑1 (MQ=255) cTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAATAAGACTGCa > 1:3163924/1‑150 (MQ=255) cTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa > 2:4613264/1‑150 (MQ=255) cTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa > 1:1498265/1‑150 (MQ=255) tACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAg > 1:446308/1‑150 (MQ=255) | TGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAG > NC_002947/5511435‑5511733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |