Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,542,072 | G→C | 12.3% | intergenic (+52/+51) | nadE → / ← PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,542,072 | 0 | G | C | 12.3% | 463.8 / 39.3 | 191 | intergenic (+52/+51) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (70/94); new base C (15/10); total (85/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.32e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCG > NC_002947/5541927‑5542219 | gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTG‑AACCGCGAATAAGATGGTGAACCCACCGAAGCATTagc > 2:4463301/1‑150 (MQ=255) gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGccatagc > 1:6552026/1‑144 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 1:7097956/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 1:932690/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:148373/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:8338593/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:7983939/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:4420434/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:6531424/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:5403176/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCggg < 1:4477474/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGt < 1:5117890/150‑1 (MQ=25) ccGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGt < 2:398643/150‑1 (MQ=25) ggTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGa < 1:2374991/150‑1 (MQ=25) gACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTC‑GCCCCCCAAAACGAGGGGGTACCCACCCCCGCAGTAGCGGGTGAAccc > 2:2190563/1‑150 (MQ=255) cggCAGCGTTCGACAACATCTTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTc < 1:7944844/149‑1 (MQ=255) aGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCCGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTc < 2:7777743/150‑1 (MQ=21) ggCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAAAACGAGGGTGAAACCACCGACGCAATAGCGGGTGGAACCGCGcc > 2:6958904/1‑150 (MQ=255) ttCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTA‑ACCCGCGGATACGGGGGTGCACCCACCGCCGGCTTCGGGGGTGAAGCCGCTCCTGCAggg > 2:7092570/1‑150 (MQ=255) tccGAAATCATCGAGGCCACCTACCGCACGCCCCACCACACCGGGGAACTGCGGTTCGCTCCTTGATATGTGGCCTGAAGGAGGGGTTTA‑ACCCTGTATTACTTGGGTCAACCCACAGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCattt < 2:6736596/148‑4 (MQ=255) catcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGCATACGAGGGTGAACCCACCGACGCAGTCGCGGGTGAACCCGCTCCGGCAGGGGTCGCCgg > 2:4314900/1‑149 (MQ=255) tggtcgCCACCCACCGCACGACCCCCCACACGCGCGACCTGCCGTGCGCTCCTTTATACGGGGCCGGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATCCGCGGGTGACCCCACCGACGCCTTCGGGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCa < 2:140031/148‑1 (MQ=255) tcgtccCCACCCCCCCCACGACCCACCCCACGCGCGAACTGCGGTTCGCCCCTTTATACGTGGCCGGCCGGTGGGGTTTC‑ACCGGCTAATACGCGGGTTAACCCCCCGACGCCTTCGCGGTTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCa < 2:3915323/150‑1 (MQ=255) gtcgCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCAGCGAAGACGAGGGTGAACCCACCGACGCAATCGCGGGTGAACCCCCTCCTGCAGGGTTCGCCGGCAGc > 2:92140/1‑150 (MQ=255) ccACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGCCGCCTTCGCGGGTGACCCCGCGCCTGCCGGGTTCGCCGTCAGCCttt > 2:5862935/1‑150 (MQ=255) cACCTACCGCAAGACCCCGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTg < 2:6387194/150‑1 (MQ=255) aCCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCGGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCCGGTGGGGGTTC‑ACCCGCTAATCCGCGGGTCAACCCACCGACGCATTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTAc < 1:2800553/150‑1 (MQ=255) cccaaccccccGCACACGCGCGACCTGCCGTCCGCTCCTGGATACGGGGCCTGCAGGCGCGGTTCC‑CCCCGCTAATACGAGGGTGACCCCACCGACGCATCCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACtt < 2:2983102/143‑1 (MQ=255) cGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCAGCGCCAGCAGGGTTCGCCGGCAGCCGATGATTaagt > 2:4963554/1‑147 (MQ=38) cGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTC‑ACCCCCGAATACGAGGGTGAACCCACCCACGCAGTCGCGGGGGACCCCCCGCCGGCCGGGTTCGCCGGCACCCGTTGATTAcat > 2:140616/1‑148 (MQ=255) cAACACCCACCACACGCGCTAACTGCCTTTCGCTCCTTTATAAGGGGCCTGCAGGAGCGGTTTC‑CCCCGCTAATACGCGGGTGAACCCCCCGACGCTTGCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGa < 1:5683578/150‑1 (MQ=255) aCCCCGCACAAGCGCGCCCGGCGGTCCGCACCTTGATACGGGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGAt < 2:7522606/150‑1 (MQ=25) aGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCAATCGCGGGTGAACCCGCGCCGGCAGGGTTCGCCGGCCGCCGTTGATTACTTGACGATGAcc > 2:4334550/1‑150 (MQ=255) cacaAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCtt < 2:7893357/150‑1 (MQ=255) cacgcgcCAACTGCCGTCCGCTCGTTTATATGGGGCCTGCTGGCGCGGGTTC‑ACCCGGTAAACCGTGGGTGAACCCACCGCCGCTTTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGc < 2:3170115/147‑1 (MQ=255) gcgACCTGCCGTTCGCTCGTTGATCCGGGGCCTGCTGGAGGGGGTGC‑CCCCGCGAATAGGGGGGTGCCCCCACGGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtc < 2:2275259/150‑1 (MQ=255) cgAACTGCGGTTCGCTCCTTTATACGTGCCGTGCTGGCGCGGGTTC‑ACCCGCTAATAGGGGGGTGAACCCACCGACGCTGTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 2:3671456/150‑1 (MQ=255) cgAACTGCCGTTCGCTCCTTTATATGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 2:4866169/150‑1 (MQ=255) cgAACTGCCGTTCGCTCCTTTATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCTAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 2:1330933/150‑1 (MQ=255) cgAACTGCCGTTCGCTCCTTGTTAAGTGGCCTGCTGGCGCGGGTTC‑CCCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCTACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 2:1565416/150‑1 (MQ=39) cgAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 2:8692609/150‑1 (MQ=255) accggCCGTTCGCTCCTTGACTAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGATTAGGTGGGTGAACCCACGGACGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtcatc < 2:5013263/146‑1 (MQ=38) ccGTTCGCTCCTTGATATGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGTGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCga < 2:1226772/150‑1 (MQ=255) cGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCgag < 2:8606895/150‑1 (MQ=255) tCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTA‑AACCCCCAAAAACAGGGTGAAACCAACCACGCCATAGCGGGTGAACCCCCGCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCGGTGATTACGTGTCGAGGACCGTGCCGTTCCTCCACGCGATGGGGc > 2:3848030/1‑150 (MQ=255) gATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCAACCCCCCAAAAC‑AGGGTGAACCCCCCCACGCATTAGCGGGTGAAACCCCGCCTGCAGGGGTAGCCCTCAGCCGTTTATTAAGTGACCATGACCTTGGCGTTAAGCATCGAGATGGGGGCCggg > 2:4515695/1‑150 (MQ=255) gATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCCCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAACCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTTATTACTTGACGATGACCATGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCggg > 2:5668116/1‑150 (MQ=255) aacgTGGCCTGCTGGCGCGGTTTC‑ACCCGCCAATACGCGGGTCAACCCACCCACGCCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGaa < 2:2194906/147‑1 (MQ=255) tGGCCTGCAGGAGGGGGTCC‑ACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGCCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTg < 2:3279590/150‑1 (MQ=255) gggCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTg < 2:4607262/149‑1 (MQ=255) ggccggccGGCGGGGGTCC‑CCCCGCTAATCGGCGGGTCACCCCCCCGCCGCATGCGGGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGc < 1:449048/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCCGGTGCGGTTCC‑CCCCGCTAATCCGGGGGGCACCCCACCGCCGCATTCGGGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCACCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGc < 1:6727642/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGCGGGTTG‑AACCCCGCAAACGAGGGTGTAACCACCCACCCCGTCGCGGGTGAACCCCCTCCTGCCGGGGTCGCCCTCAGCCATTTTTTACTTTACGAAGAACGAGGCATTCATCAACGAGAAGTGGCCCGGGAAGGTGCagaag > 2:3367124/1‑150 (MQ=255) cgggggTCC‑CCCCGCAAAACCGCGGGTCACCCCCCCGCCGCATGCGCGGGTCACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCt < 1:2941298/147‑1 (MQ=255) gCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTg > 2:4406797/1‑150 (MQ=255) cGGGTTC‑ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGt > 2:5931037/1‑150 (MQ=21) gggTTC‑ACCCGCGAATACGTGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTa < 2:1052574/150‑1 (MQ=255) gggTTC‑ACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTa < 2:3643978/150‑1 (MQ=255) gggTTC‑ACCCGATAAAACGTGGGCCAACCCACCGACGCATTGGCGGGTCAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGACAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTa < 1:2517961/150‑1 (MQ=255) ggTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAg < 2:8817010/150‑1 (MQ=255) gTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 1:884616/1‑150 (MQ=255) gTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 1:481584/1‑150 (MQ=255) ttC‑ACCCGCTATTACGTGGTTGAACCCACCGACGCTTTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCGGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTc < 1:1307747/150‑1 (MQ=255) tacccccGCCAATACGCGGGTCACCCCACCGCCGATTTCGGGGGTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTc < 1:464642/146‑1 (MQ=255) tC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTca > 1:3643595/1‑150 (MQ=255) tC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTca > 1:3863070/1‑150 (MQ=255) ctcccccGCGAATACGCGGGTCACCCCACCGCCGCCTCCGGGGGTCACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTc < 1:100768/146‑1 (MQ=255) c‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcac < 2:5551238/150‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCGGTGGATTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:7362138/1‑150 (MQ=37) ccGCGAATGCGTCGGTGAGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTTGCCGTCAGCCGTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:7260398/1‑150 (MQ=25) ccGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac < 2:7403689/150‑1 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:7959346/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:2033453/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:6131921/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:3587516/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:8537599/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:8800361/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:3989995/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:3313097/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:1705786/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGc < 2:5930010/128‑1 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCaccacc > 2:8519528/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCaccacc > 1:1480735/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCaccacc > 1:3615901/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCaccacc > 1:3615859/1‑150 (MQ=255) gcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCg > 2:8631683/1‑150 (MQ=255) tACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc > 2:2461375/1‑150 (MQ=255) ccgcgggTCAACCCCCCGACGCAGGCGGGGGTCACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTcc < 1:1062807/146‑1 (MQ=255) ggTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGAGGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCtt > 1:8803263/1‑150 (MQ=255) gttaaCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGAGTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTg < 2:6281814/147‑1 (MQ=255) gTGACCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTg < 2:1783959/150‑1 (MQ=255) gTGAACCCACCGTCGCTTTCGCGGGTGCCCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTg < 1:8398156/150‑1 (MQ=255) gTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTg < 1:1314463/150‑1 (MQ=255) gTGAACCCACCCCCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTg < 1:4951029/150‑1 (MQ=255) aaCCCACCTCCGATTTCGGGGGTCACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa < 1:6176517/150‑1 (MQ=255) aaCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa > 1:264623/1‑150 (MQ=255) ccACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTTGAAgtg > 1:6270726/1‑150 (MQ=255) cACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgtgt > 1:717951/1‑150 (MQ=255) aCCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGCTTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCCTCGAGCTGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTc > 2:6187574/1‑150 (MQ=255) aCCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTc > 2:7271764/1‑150 (MQ=255) | GCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTC‑ACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCG > NC_002947/5541927‑5542219 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |