| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_002947 | 5,639,457 | 0 | T | G | 5.8% | 1195.2 / 43.1 | 356 | intergenic (+33/+350) | putA/PP_5718 | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase/membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (130/205); new base G (12/9); total (142/214) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
ACGGGCTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGCTCTCCTTTTTTATGCGTGCATGTCCTGAAGCAGGGGCTGGACTAACAGGTGCTCACCAGAACGTGGTCATGCCAACGGTGACTTGGGTGTCTTCTGTTGTTACCGTTTATCCCCTGGAAATTCTCGGCTGCCTGGGCCGGTCCTT > NC_002947/5639309‑5639606 | aCGGGCTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTc > 1:7507802/1‑150 (MQ=255) cGGGCTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCg > 2:6398761/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCCAGCGGGGATCACCAGATTGCGCTGGAGCGCCTGGTCATCGAGCGCGCGGTGAGCGTGAACACTGCAGCGGCGGGTGGTAACGCCAGCCTGATGACCATTGGCTAATGGCTGAGGGTTGTTGAAGAAGAAGGAGAGCCTCGGc < 1:5377209/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |