Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,686,426 | T→G | 5.7% | intergenic (‑143/+65) | PP_4986 ← / ← PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,686,426 | 0 | T | G | 5.7% | 347.1 / 7.0 | 128 | intergenic (‑143/+65) | PP_4986/PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/54); new base G (6/3); total (71/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
ATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCC > NC_002947/5686278‑5686575 | aTACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGctgctg < 2:3596747/150‑1 (MQ=255) aCATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTgcg < 1:5095821/150‑1 (MQ=255) aCATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGGTTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTTCCACTGCATGAACCGCCGGGGCGGCTgcg > 2:538584/1‑150 (MQ=255) aTGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCGTTTTTAGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCACGCGTTCATTTCCACAGCATGAAACCCCCGGGCGGCAGCGCa > 1:6379416/1‑150 (MQ=255) tGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTTGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAg < 1:8282737/150‑1 (MQ=255) tGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCGTTCAGTTCCCCAGCAGGTACCGCCCGGGCTGCTgcgccc > 2:5904892/1‑148 (MQ=37) tGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGGTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGGCAGGGGCGCGCAGCGGCCCCCCGCGTTCAATGCCCCTGCAAGAAACCCCCGggcggcggccccg > 1:6499421/1‑146 (MQ=255) gCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGc < 2:5114996/150‑1 (MQ=255) gCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGc < 1:6153779/150‑1 (MQ=255) cAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTTTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCAGCGGCGCAGcc > 2:6954629/1‑150 (MQ=255) aaaCACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCGTGTGGCGCGCAAGGGGCGCCCAGCGGCCCCACGCGGTCCTTGCCCCCGCCTGAACCGCCCGGGCggccgcccccccc > 2:6925465/1‑143 (MQ=255) aaCACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGcccc < 1:3283696/150‑2 (MQ=255) aaCACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGcccc < 1:3283716/150‑2 (MQ=255) aaCACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGCAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACAGCAGGAACCGCCGGGGCTGCGGCGCCGcccg > 2:1137591/1‑149 (MQ=255) acaGACCTCCTGTGGTGGGCTGGGTTCTTTTTGTGTTGCTGTTGGCTTCTTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAACGGGGCGCGAAGCGGCCCCTGGCTTTCATGGCCACTGCATGAACCGCCAGGGCTGCGCAGCAGccccggc < 1:5268347/150‑5 (MQ=25) aGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgc < 1:6289427/150‑1 (MQ=255) aGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgc < 2:1865906/150‑1 (MQ=255) aGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgc < 1:8378552/150‑1 (MQ=255) aGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgc > 2:4675883/1‑150 (MQ=255) aGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgc < 1:8265228/150‑1 (MQ=255) aGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgc < 1:6946605/150‑1 (MQ=255) aGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgc < 1:6991764/150‑1 (MQ=255) gACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATcgcg < 1:7041256/150‑1 (MQ=255) aCCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGa < 1:1645710/150‑1 (MQ=255) aCCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGa < 1:8730050/150‑1 (MQ=255) cctcctGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGac < 1:1164890/150‑1 (MQ=255) cctcctGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGac < 1:1527891/150‑1 (MQ=255) tcctGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCAAGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGacac > 2:4224352/1‑150 (MQ=255) tGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAg < 1:8505899/150‑1 (MQ=255) tGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAg < 2:4863636/150‑1 (MQ=255) tGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAg < 1:7124432/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAgg < 2:3299147/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAgg < 1:2039386/150‑1 (MQ=255) aGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGc < 2:1831036/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCTGGGGTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGcc < 2:7366144/150‑1 (MQ=255) gTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCAGCGCAGCCCTAACGCCACCCACCGCCGCTCCCACTc > 2:8695713/1‑150 (MQ=37) tgttgtGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGGAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGac > 2:7234831/1‑150 (MQ=255) gttgtGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCATGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCGTTCAATGCCACAGCATGAACCGCCGGGGCTGCAGCCCAGCCCAATCGCGACACAACGCCCCACCCACTCCACacc > 2:3582167/1‑150 (MQ=25) gtgATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCCAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCAAGAAACGCCGGGGCTGCTGCGCCCCCCAAACGCGACACCAGGCCGCTCCCACGCCACaccacc > 2:2141985/1‑150 (MQ=25) aTGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGGCTTGTGTCGCGTAAGGGGGGCGGAGCGGCCCCAGGGTTTGATTGGCCCTGCATGAACCGCCGGGGCTGGTGCGCAGCCCGATCGCGACACCACGCCGCGGCCGCACCAGACCCCCCgg > 2:8188182/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAATGGGCGCCAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTTCCACAGCAAGAAACGCCCGGGGTGCTGCGCACCCCGATCGCCACACAAGGCCGCACCCCCACCACACCACCACGcccaac > 2:8565565/1‑147 (MQ=21) ttctttctTTGTGGGTGCGGCCTTGTTTCGCTAATGGGGCGCTACGGGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGAATGAACCGCGGGGGCTGCTGGGAAGCCATATCGCTACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTc < 2:5681294/150‑1 (MQ=255) cgttGTGTGGCGAATGGGGCGCGACGCGGCCCCTGGCTTTCTTTGCCACTGCATGAACGGCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAgg < 2:2873886/148‑1 (MQ=255) ttGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGtt > 2:6544431/1‑150 (MQ=255) tCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa > 2:4465867/1‑150 (MQ=255) gcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACAACCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATc > 1:1398850/1‑150 (MQ=255) gcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGACCCCAGGCCGCTCCCACGCCAGACCCCCCGGCCCTGCGCCGCACATCCTAACCAAGGGCCGGGTGCAGATc > 1:4901934/1‑150 (MQ=37) gcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCGGCGGCGCCGCCCGAACGCGACACAAGGCCGCGCCCACACCCGACCACCACGCCCGGCGCCGCACCGCCGAACCAAGGTCAGGGTGCAGATc > 1:1012520/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGGTGCTGCGCAGCCCGATCGCGCCACAAGGCCGCGCCCACACCACACCACCACGCCCAGCGCCGCACAACCGAACCAACGTCAGGTTGCAGATAcg > 1:3670800/1‑150 (MQ=37) gAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCcg > 1:648581/1‑150 (MQ=255) accggggCGCCCCGCGGCCCCAGGCTTACTTTGCCACTGCATGACCCGCCGGGGCTGCTGCGCACCCCAATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCcgc < 2:5602356/147‑1 (MQ=255) aaaGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCAcaaa > 1:8683014/1‑93 (MQ=255) aaaGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCAcaaa < 2:8683014/96‑4 (MQ=255) ggggCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTc > 1:8799592/1‑150 (MQ=255) ggggCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTc > 1:4914886/1‑150 (MQ=255) ggCGCGACGCGCCCCCCGGCTTCCCTGCCCCCGGCATCACCCGCGGGGGCGGCTGCCCCCCCCCACCGCCCCACCCGCCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCAc < 2:7526973/150‑1 (MQ=255) ggCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCAGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCAc > 1:2141967/1‑150 (MQ=255) ggCGCGAAGCGGCCCCAGGATTTCATTGCCACTGCAGCAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCAc < 2:7284566/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGc > 1:7331775/1‑150 (MQ=255) gcgACGCGGCCCCAGGCTTTCTTTGCCACTGCATTAACCGCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACAAACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCa < 2:8233130/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCa > 2:5305565/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCa > 2:5304996/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCACACCTCCTAACCCAGGTCCGGTTGCAGTTCCGCGTCACGcc > 2:5221901/1‑149 (MQ=39) gcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGTCCCAAGGCCGCACCCACTCCAGACCACCAGGCCCAGCGCCTCCCCTCCTGACCAAGGTCAGGGTGCAGATCCGCGTCACGCa > 1:762228/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCGGCTGCGCCGCCCAATCGCGCCACAAGGCCGCTCCCACGCCACACCACCAGGCCCAGCGCCTCACATACAAACCAATGTCAGGTTTCAGTACCGCGTCACGCa > 1:7555085/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCGGCTGCGCAGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACACCACACCACCCGGCCCAGCGCCGCACAAACAAAACAACGGCAGGTTGCAGATCCCCGTCACGCAcc > 1:3133436/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCCCCAGGCTTAAATTCCCACTGCATTAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCCACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCAcc < 2:623771/150‑1 (MQ=39) gCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACGGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACGAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGc < 2:6395421/150‑1 (MQ=255) ccgcccccAGGCGTTCATGGCCACTGCATGACCCGCCGGGGCTGCTGCGCCGCCCTACCGCGACACACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGc < 2:8606691/146‑1 (MQ=255) gCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATc > 1:5832370/1‑107 (MQ=255) gCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATc < 2:5832370/107‑1 (MQ=255) ccccAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCTGGCCCTGCGCCTCACATCCAAAACAAGGTCAGGTTGCAGAACCGCGTCACGCACCAGCCttt > 2:4660339/1‑150 (MQ=255) ccccAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCCGCCatt > 2:8518836/1‑150 (MQ=255) cccAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCGGCTGCGCCGCCCGATCGCGCCACAAAGCCCCGCCCCCACCACACCACCCCGCCCAGCGCCACACAAACAAAACAAGGTCAGGTTTCAGATCCCCCTCACCCACCAcccaata > 1:64596/1‑146 (MQ=255) ccAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCAATAGCGACACAAGGCCGCTCCCACGCCCGACCACCCGGCCCAGCGCCGCACATCCGAACCAACGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCAAGCCCCCCCCGTTcc > 1:6792545/1‑150 (MQ=37) aGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCaa < 2:8023818/150‑1 (MQ=255) tttCTTTGCCACTGCATGACCGGCGGGGGGTGGTGCGCAGCCCTATCGCGACACACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCg < 2:6021285/150‑1 (MQ=255) tttCATTGCCACTGCCTGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCAGCGCCTCACATCCTAACCAACGTCAGGTTGCAGATCCGCGGCACGCACCAGCCTTTCCAATGCg > 2:8254950/1‑150 (MQ=255) ttCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGa > 2:1312420/1‑150 (MQ=255) aTTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACaa < 1:1208506/52‑1 (MQ=255) ttGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACACCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAAACAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCCGCCTTTCCAATGCGACCAg > 2:2315825/1‑150 (MQ=255) cACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTcc > 2:4543677/1‑150 (MQ=255) cTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATAGCGACACAAGGCCGCTCCCACACCACACCACCACGCCCAGCGCCTCACAAACAAAACAAGGTCAGGTTTCAGATACGCGTCACCCACCAGCCATTACAAAGCGACCAGGTcccg > 1:6066999/1‑148 (MQ=25) cATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAc > 2:1407166/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCcgcg > 2:6116358/1‑150 (MQ=255) agcctggggCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGGTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCAACAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCgcgc < 1:5075488/145‑1 (MQ=37) cgccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACACCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGcc > 2:3534382/1‑150 (MQ=255) gccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCa > 2:6485190/1‑150 (MQ=255) gatagggCTGCGCAGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCa > 1:503233/5‑150 (MQ=255) gatagggCTGCGCAGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCa > 1:3893675/5‑150 (MQ=255) gatagggCTGCGCAGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCa > 2:13506/5‑150 (MQ=255) ccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGTGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAc > 1:6511908/1‑150 (MQ=255) ccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAc < 1:4621779/150‑1 (MQ=255) ccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCACACAACCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAc > 1:7647720/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTca < 2:648581/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTca > 2:8113659/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTca > 2:3089736/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTca > 1:4604528/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccc > 2:7375971/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccc > 1:3674187/1‑150 (MQ=255) | ATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCC > NC_002947/5686278‑5686575 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |