Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,709,543 | T→C | 6.5% | intergenic (+63/+49) | PP_5006 → / ← PP_5007 | TetR family transcriptional regulator/polyhydroxyalkanoate granule‑associated protein GA2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,709,543 | 0 | T | C | 6.5% | 953.0 / 34.5 | 309 | intergenic (+63/+49) | PP_5006/PP_5007 | TetR family transcriptional regulator/polyhydroxyalkanoate granule‑associated protein GA2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (156/127); new base C (14/6); total (171/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.84e-01 |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CAGGTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTGGC > NC_002947/5709394‑5709690 | ggTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTgg < 2:2012892/150‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTgg > 2:8112745/1‑150 (MQ=255) gatgCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATc > 1:4996082/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGt < 2:4714939/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGCCGAATCTTCAGGCCCAGTCGCGGGCGGCGGCGGAGCAGATGGCAGTGTAGTAGCTGGAGGTGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGt < 1:8356314/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTa < 1:1111551/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTa < 2:3053722/150‑1 (MQ=255) gtggCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAAACCCCTCCAACAAGGTTTGGCGCATATTGTAgg > 1:36113/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGc < 1:5027530/150‑1 (MQ=255) gccgcATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCgg < 2:6219739/150‑1 (MQ=255) gccgcATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCgg < 1:4104448/150‑1 (MQ=255) gccgcATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGATGCGCCAAACCTTGTAGGAGCgg < 2:835000/150‑1 (MQ=37) ccgcATCTGTAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCggg < 2:6398991/150‑1 (MQ=255) cgcATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGt < 2:2895517/150‑1 (MQ=255) aTCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:6680784/1‑150 (MQ=255) aTCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAAACCGCTCCAAAAAGGTTTGGCGCATGTTGGTGGAGCGGGtttg > 1:311606/1‑149 (MQ=255) caggcccaggccCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGTGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGAAGCCGAATCATTCGCGGGTAAAACAGCTAATACAAGTTTTTGAGGATATTGTAGGAGCGGGTTTaaacga > 1:1259644/1‑145 (MQ=255) caggcccaggccCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:7290618/150‑1 (MQ=255) caggcccaggccCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:5969681/150‑1 (MQ=255) ggcccaggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTAAACCcgctc < 1:1032748/150‑3 (MQ=255) cccaggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCgaag > 2:3791283/1‑150 (MQ=255) cccaggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGATGCGCCAAACCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCgaat < 2:3541347/150‑2 (MQ=25) ccaggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTTCCCGCgaaga > 1:5518384/1‑150 (MQ=255) ccaggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCgaaga > 1:6366183/1‑150 (MQ=255) aggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTGGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaagaag > 2:8173409/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCGGGAGAGGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGa > 2:692183/1‑150 (MQ=255) ggcggAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatc < 2:7798616/150‑1 (MQ=255) ggAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcaga < 2:8190973/150‑1 (MQ=255) gAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcagat < 2:8755248/150‑1 (MQ=255) gctgcTGGCAGTGAAGTACCTGGTGGGGTAGGCCGGCTGGAGATGTTGGGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAATGTTTTGGCGCATCTTGTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcagatca < 1:2232170/147‑1 (MQ=255) gcagcTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcagatca < 1:4258124/150‑1 (MQ=255) gcagcTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcagatca < 1:2051509/150‑1 (MQ=255) aGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCgg > 2:4224169/1‑150 (MQ=255) 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gagaTGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTgg > 2:4905414/1‑150 (MQ=255) gaTGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGcc < 1:7975899/150‑1 (MQ=255) gaTGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCCGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGcc > 2:4294734/1‑150 (MQ=255) gTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCggg < 1:5629559/150‑1 (MQ=255) tAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCgggg > 1:6468260/1‑150 (MQ=255) tAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACAAGGTTTGGCGCCTCGTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCgggg > 1:1183108/1‑150 (MQ=255) tAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCgggg > 1:5056466/1‑150 (MQ=255) aGTGTCGCTGCCGACGCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCGTACAAGGTTTGGCGCAACTTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGt < 1:1497062/150‑1 (MQ=39) gCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTggcggc < 2:3887250/150‑1 (MQ=255) cAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCa < 2:1395657/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGGTGCCGGTGc > 1:3785779/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCt < 1:212806/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCtgt < 1:2408877/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCCGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTgg < 2:2249278/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTc > 2:1658437/1‑150 (MQ=255) 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2:7442372/1‑150 (MQ=37) cGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAg < 2:6839010/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAgg > 2:8003765/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAgg > 1:7626432/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAAGATGCGCCAAACCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAgg > 1:1709542/1‑150 (MQ=38) cTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGgc < 2:6005245/150‑1 (MQ=255) tCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTCCCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGgcg > 1:8146033/1‑150 (MQ=255) tCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGTCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGgcg > 2:2768814/1‑150 (MQ=255) tACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAg > 2:7692338/1‑150 (MQ=255) tACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAg > 1:8067119/1‑150 (MQ=255) tACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAg > 2:5669516/1‑150 (MQ=255) tACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAg > 1:8770397/1‑150 (MQ=255) tACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAg > 2:2374089/1‑150 (MQ=255) tACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAg > 2:3653902/1‑150 (MQ=255) aCAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgc > 1:2316811/1‑150 (MQ=255) aCAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgc > 2:1150565/1‑150 (MQ=255) 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aaGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcgc > 2:8298386/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcgc > 2:3114811/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcgc > 1:4757967/1‑150 (MQ=255) ggTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTg < 2:3486707/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTg > 1:690752/1‑150 (MQ=255) tttGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGACAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTGGc < 2:5566072/150‑1 (MQ=255) | CAGGTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTGGC > NC_002947/5709394‑5709690 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |