| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,764,408 | T→C | 6.2% | intergenic (+12/+144) | trmL → / ← secB | tRNA (cytosine(34)‑2'‑O)‑methyltransferase TrmL/protein‑export protein SecB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,764,408 | 0 | T | C | 6.2% | 752.0 / 24.4 | 244 | intergenic (+12/+144) | trmL/secB | tRNA (cytosine(34)‑2'‑O)‑methyltransferase TrmL/protein‑export protein SecB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (77/145); new base C (2/13); total (79/165) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGAGAGGCGCTTTCTTGAAACCGGCAGTA > NC_002947/5764261‑5764550 | ggTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGC < 2:7797835‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 2:1267742‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:4820933‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:658868‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:3282122‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:7917454‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:2447526‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:2059381‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG > 2:7210459‑M1/1‑150 (MQ=255) cTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGC < 2:6588790‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGC < 2:7581267‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGC < 1:4457581‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCC > 1:6757076‑M1/1‑150 (MQ=255) tGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCC > 1:3966525‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC < 2:1583003‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GG < 1:2711095‑M1/150‑1 (MQ=255) gccgAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTGCGC‑GGGGAAg > 1:4328410‑M1/1‑149 (MQ=255) gcgaGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCAGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCACTACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAC < 2:1635344‑M1/149‑1 (MQ=255) ccgAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGGAAAC > 1:132737‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGCGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAC < 1:8767938‑M1/150‑1 (MQ=255) cgAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACC < 1:3631981‑M1/150‑1 (MQ=255) gAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC < 1:976927‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG < 2:2224933‑M1/150‑1 (MQ=255) cATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCT < 2:2020203‑M1/150‑1 (MQ=255) aTCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTTTACCCGCga < 1:163435‑M1/150‑3 (MQ=255) aTCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTC < 2:4522602‑M1/150‑1 (MQ=255) cctgcgcctgcCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGTGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTAC < 2:8502672‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgcctgcCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCa < 2:8085376/150‑1 (MQ=255) cgcctgcCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAg < 1:6936482/150‑1 (MQ=255) cgcctgcCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAg < 1:3967037/150‑1 (MQ=255) tgcCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCg < 1:2866090/150‑1 (MQ=255) ccGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAg < 2:6645040/150‑1 (MQ=255) cGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAgg < 2:6757076/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGcaacacat < 1:2295741/150‑8 (MQ=255) gCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGgc < 1:1671146/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGgc < 2:962712/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGgc < 1:625481/150‑1 (MQ=255) cGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGgcgc < 1:2336878/150‑1 (MQ=255) ggggTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCa < 1:4384136/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCaa > 2:545882/1‑150 (MQ=255) gTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATc < 2:6671105/150‑1 (MQ=255) gCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATccc < 2:8278090/150‑1 (MQ=255) ccGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGACCGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATcccc < 1:8457328/150‑1 (MQ=255) cGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCTGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCt < 1:6912897/150‑1 (MQ=255) cGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCt < 1:2720558/150‑1 (MQ=255) cGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCt < 2:5789814/150‑1 (MQ=255) cGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCt < 1:5041724/150‑1 (MQ=255) cGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCt < 2:8220626/150‑1 (MQ=255) gTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTg > 1:8034843‑M2/1‑149 (MQ=255) tAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCCCACCGACGCAGGCCGAGGGCACGGCGCAAACCCCGGt > 2:1193432/1‑150 (MQ=255) gCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtag > 2:844425‑M2/1‑146 (MQ=255) gCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtag > 1:7526820‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtagga < 1:7252372‑M1/150‑35 (MQ=255) tGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCGACGCAGGCCGCGGGAACGGCGCAAACCCCGggaggag < 1:4968846‑M2/150‑8 (MQ=255) gAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagc < 2:8587852‑M1/150‑37 (MQ=255) aaCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTGTGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCGgtaggagcg < 2:7319934‑M2/150‑10 (MQ=255) aaCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcg > 1:5323583‑M2/1‑141 (MQ=255) aaCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcg < 2:2374725‑M1/150‑38 (MQ=255) aCCTGTCCAATTCGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGTCGGCAGTACGGGTTTGCCGGTAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGTCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTAGatgggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:6205879‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:590659‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:5730509‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:3924486‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 2:359189‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 2:2990620‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:1398817‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgg > 2:2934517‑M2/1‑140 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgg > 2:7602591‑M2/1‑140 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgg > 2:6296094‑M2/1‑140 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgg > 1:5951090‑M2/1‑140 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTACGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:7342594‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:7594077‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 2:4411287‑M1/150‑39 (MQ=255) aCCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGAGGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCGTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgg > 2:7378363‑M2/1‑140 (MQ=255) ccTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcggg < 2:744817‑M1/150‑40 (MQ=255) cTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACAGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgggt < 1:2504935‑M1/150‑41 (MQ=255) tGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgggtt < 1:5732858‑M1/150‑42 (MQ=255) cactACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:4888078/147‑1 (MQ=255) cAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg > 2:1170462‑M1/1‑105 (MQ=255) cAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCGGCGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgg < 1:1170462‑M1/143‑39 (MQ=255) aaTACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttaccc < 2:5093584‑M2/150‑19 (MQ=255) aaTACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttaccc > 2:5817735‑M2/1‑132 (MQ=255) aTACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccg > 1:7683904‑M2/1‑131 (MQ=255) aTACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCCCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCGggaggagcggggttacccg < 2:2773395‑M2/150‑20 (MQ=255) cGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcga > 2:7642906‑M2/1‑128 (MQ=255) tGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 2:7883459‑M2/150‑26 (MQ=255) ggCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTTGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaggggattgcgccgttccctcggcctgcgtaggagcgggtttacccgcgaagag < 2:7262743‑M1/150‑55 (MQ=255) gggtGACGGTTTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGTGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGCGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc > 2:3498547‑M2/2‑122 (MQ=255) cGGGGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcggttttacccgcgaagaggc > 2:8638378‑M2/1‑122 (MQ=255) ggTGAGGGTGTTTGCGGGGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGTTGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCAACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcc > 2:6039817‑M2/1‑121 (MQ=255) ggTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAAACCCCGggaggagcgggtttacccgcgaagaggcc < 2:939877‑M2/150‑30 (MQ=255) tATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCAACGCAGGCCGAGGGAACCGCGCAAACCCCGGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCCGCCCCGGca > 2:1413334/1‑150 (MQ=39) ggcggcAGAACCGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGACTGTGAGTGCCTCTTCGC‑CGGTAAAACCGCACCTACGCAGGCCGAGGGAAACGCGCAAAACCCAGAAGGAGCGCGTTTACCAGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACaaaaaaac > 2:1749368/1‑148 (MQ=255) cAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCGCACCGACCCAGGCCGGGGGACCCGCGCAAACCCCCGGAGGAGCGGGGTTAACCCCGAAGAGGCCCGCGCCGGCCACAAAAAAGCGcccc > 2:3736753/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCCGCACCTCCGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTGTCGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCgaga < 2:7948537/149‑1 (MQ=255) cGGGTTGGCCGGGAGCTGAGGGGTTGCCTGGGCGGCCCACTCCGC‑GGGAAACCCCGCCCCTCCCCCGGCCGCGGGAACGCCGCAACCCCCGGCCGGAGGGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGagag < 2:4256774/150‑1 (MQ=255) tttGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTTAAACCCCTCCGAAGCCCGCCGAGGGCAACGCGCAAAACCCCCGAGGGGCGGGGTTAACCCCGAACAGGGCCCCGCCCGCCACAAAAAAACGCCCCCAGAGgcgc > 2:291312/1‑150 (MQ=255) tggcGGGTGCTTTTGTTTTGCCTGTGCGGGCCTCTCCGG‑GGGAAACCCCGCTCCTCCGCTGGCCGCGGGACGGGCGAAACCCCCTTTGGGTGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCTCTCGGGGCGCtt < 2:4226082/147‑1 (MQ=255) ggAGCTGTTGTTGTGCGTGGGCGGGCCTCTCCGG‑GGGTAACCCCGCTCCCCCGCCGGCCGCGGGAACGGCCCAACCCCCTGACGGAGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCTCTCGGGGCGCTTTTTTg < 2:6507151/150‑1 (MQ=255) tgttgggtTGCCTGTGGGGGCCTCTGGGG‑GTTAAAACCCGCCCCTCCGCCGGCCGCGGCAACGGCCCACCCCCGTGTCGGCGGGGTTTTCCCCGCGACGCGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGAGAGGCGCTTTCTTGAAAcc < 2:3829700/144‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGGTAAACCCCACCCAACCCGGGCC‑CGGGCACCGCGCCAAAACCCGTAGGTGCGGGGTTACCCCCGCAGTCGCCCCCCCCGGCCAAAAAAAATCGCCCCCCGAGGCGCGTTCGTGAAAACCGCAgga > 2:387687/1‑148 (MQ=255) | GGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGAGAGGCGCTTTCTTGAAACCGGCAGTA > NC_002947/5764261‑5764550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |