| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 479,499 | 0 | A | T | 5.3% | 1346.3 / 39.1 | 390 | intergenic (‑28/+28) | cca/ycgB | multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase/type IV piliation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (167/202); new base T (10/11); total (177/213) | |||||||||||
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Only 100 of 396 total aligned reads displayed.
GGCCGATAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTGGA > NC_002947/479350‑479648 | gATAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAAc < 2:7509683/150‑1 (MQ=255) gATAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACCGCCGACGGGTTatc < 1:5772599/150‑3 (MQ=255) gATAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCACCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAAc < 2:1799160/150‑1 (MQ=255) 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cTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTc > 1:5616690/1‑150 (MQ=255) tAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAATTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCa > 1:1590268/1‑150 (MQ=255) tAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCa > 2:7819682/1‑150 (MQ=255) tAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCa > 2:7660630/1‑150 (MQ=255) tAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCa > 1:3805827/1‑150 (MQ=255) 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tGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtc < 1:8334311/150‑1 (MQ=255) tGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtc < 2:6855978/150‑1 (MQ=255) cGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTcc < 2:3125848/150‑1 (MQ=255) gACAGGATAACCCGTCGGCGGTCGTGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCAGAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCa > 2:8816456/1‑150 (MQ=255) gACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCCTAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCa > 2:8156934/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |