Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,037,798 | G→C | 9.9% | intergenic (+57/+79) | dppA‑IV → / ← PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,037,798 | 0 | G | C | 9.9% | 637.5 / 39.9 | 206 | intergenic (+57/+79) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (80/104); new base C (8/13); total (88/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.17e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
ACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGATGTGATCCAGC > NC_002947/6037649‑6037946 | aCGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGGCCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTgg < 2:5153475/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTgg < 2:4715030/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTgg < 1:325659/150‑1 (MQ=255) ggcggcGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCa < 2:8594271/150‑1 (MQ=255) ggcgACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑Gtt < 1:5769073/150‑1 (MQ=255) cgACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGa < 2:4593085/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGAc > 2:910366/1‑150 (MQ=255) gACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGAc < 2:8410350/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGAc < 2:7236837/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTGCGCCTAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGc < 2:3611518/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGc < 2:802272/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGca > 1:6564903/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCt > 2:7159546/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGTCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTa < 2:1979676/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc < 2:5332842/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc < 2:6786484/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc < 2:822710/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc < 1:2241173/150‑1 (MQ=255) tgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAcccc > 2:2814940/1‑150 (MQ=255) gcgcCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCt < 2:1150800/150‑1 (MQ=25) gcCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGt < 2:2475129/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGGGTAGCGCCAGCCAGGCA‑GTTGACGCTACCCCGGTa > 2:1067521/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTa < 1:6128870/150‑1 (MQ=25) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTa < 2:745729/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTa < 1:910366/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTa < 2:700864/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTa < 2:184289/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCACCAAAAGGGGTAGCGCCCGCCGGGCA‑GTTTAAGCGACCCCAGTAg > 1:2526964/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAgg < 1:5695075/150‑1 (MQ=255) gCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGc < 2:2567315/150‑1 (MQ=255) gCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGc < 1:4204530/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCCAGGTGACGGTGACCAAGGAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCgg < 1:5450088/150‑1 (MQ=255) tCGTGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCACGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCggg < 1:460935/150‑1 (MQ=21) cGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGt < 1:3856121/150‑1 (MQ=21) aGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCGGGCA‑CGTGACGCGACCCCGGTAGGAGCGGGttt > 1:8587436/1‑150 (MQ=39) ggggTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:6324210/1‑150 (MQ=255) ggggTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTa < 1:2846712/150‑1 (MQ=255) ggggTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGGAGCGCCCGCCTGGCA‑GGGGACGCTACCCCGGGAGGAGCGGGGTTa > 1:5024835/1‑150 (MQ=38) ggTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑cc < 1:6297537/150‑1 (MQ=255) ggTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCAGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑cc < 1:1265552/150‑1 (MQ=21) gTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCACGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑ccc < 1:3785535/150‑1 (MQ=255) gTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑ccc < 1:7192018/150‑1 (MQ=255) tACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCcg > 1:4317810/1‑150 (MQ=255) gTGAGCCCGTGCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGCCGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAg < 2:7282936/150‑1 (MQ=255) ccGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCg > 2:2116605/1‑150 (MQ=255) gggCGGCTGGATTTCCGCACGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCCGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGa < 2:6287494/150‑1 (MQ=38) tGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCtata > 2:6248928/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCa < 2:7343458/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCa < 2:8005328/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCa < 2:8676111/150‑1 (MQ=255) ccAAGGTGACGGTGACCAATTATGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCCGGGTTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGAGGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCa < 2:3189800/149‑1 (MQ=38) cAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGACAGGGGTAGCGCCAGCCAGGCA‑GGTGACGCTACCCCGGTAGGTGCGGGTTTA‑ACCGCGCAAGGGCCCGTACTGACCCGATAAGGCTCGCAg > 1:592830/1‑150 (MQ=255) ggtgacCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCACCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGTCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑ACCGCGAAAGGGCCCCTACTGACCCAAAAAGGCGCTCAGTACTcccgc > 1:6368774/1‑148 (MQ=37) aaGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCAGGCA‑GTTGACGCTACCCCGGGAGGAGCGGGGTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCCTACAGACCCAATAAGGCTCGCAGTACACCCGCAGACcac > 2:3109695/1‑150 (MQ=37) gTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACaa < 2:677092/150‑1 (MQ=255) gTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑ACCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTAAGACCACaa > 2:5654048/1‑150 (MQ=255) aGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGTTAACCCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGCCT‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGGGGTTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATcc < 1:7113405/150‑1 (MQ=255) gCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCC‑GTTGACGCTACCCCGGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCa > 2:5101773/1‑150 (MQ=255) gCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GGTGACGCTACCCCGGGAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCCTACTGTCCCTCTAAGGGGCGCAGGTCTCCCTCAGACCACAATCCa > 2:6630423/1‑150 (MQ=25) ggCCTCTGCGCGGTTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTc < 1:5829806/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGa < 2:6961726/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGGAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCGATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAAACCACCCAAGCGCGAcc > 2:6150872/1‑150 (MQ=38) ctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCa > 2:6865779/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCAGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCCTACTGACCCAATAAGGCTCTCATTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCCTGCACGACCaa > 2:7628078/1‑149 (MQ=37) tgggggttAAACCCGCTCCTACTGGGGTTGCGCCAGCCTGGCT‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGGGGTTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATc < 1:6911785/143‑1 (MQ=255) ccgcgGGTAACCCCGCTCCTCCCGGGGTCGCGCCAGCCGGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTCGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATc < 2:382536/149‑1 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGAc < 2:7576879/150‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGAGGGTTTA‑CCCGCGAAATTGCCCGTAATGACCCAATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCAACGACaa > 1:4738730/1‑150 (MQ=17) ccGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTcc > 2:395393/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATACGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACACTCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTcccc > 2:55491/1‑150 (MQ=255) cTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCa > 1:4458650/1‑150 (MQ=255) tcctccTGGGGTCGCGCCAGCGGGGCT‑GTTGACGCTACCCCTTTTGGTGGGGTTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCAt < 1:5255626/150‑1 (MQ=255) tCCTACTGGGTGAGCGCCCGCCGGGCA‑GTTGACGCTCCCCCTGTCGGCGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCAt < 1:1173168/150‑1 (MQ=255) cccTACGGGGGTCGCGCCCGCCGGGCA‑GTTGCCGCTCCCCCGGACGTCGGGGTTTAA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCAt < 1:81090/149‑1 (MQ=255) ccTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATc < 2:4317810/150‑1 (MQ=255) cTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATc > 2:2736983/1‑132 (MQ=21) cTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCa < 2:591590/150‑1 (MQ=255) tACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 1:467042/1‑150 (MQ=25) tACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 1:47510/1‑150 (MQ=25) tACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 2:1671682/1‑150 (MQ=25) tACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 1:1718873/1‑150 (MQ=255) tACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 1:2195550/1‑150 (MQ=255) accggggTAGCCCCAGCCTGCCA‑GTTGACGCAACCCCTGAAGCAGCGGTTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAcc < 2:2952277/147‑1 (MQ=255) aCAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAcc > 1:2371103/1‑150 (MQ=255) tgggtTAGCGCCAGCCTGGAT‑TTTGACGCTACCCCTTTTGGAG‑GGGTTTACCCCGCTAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCaa < 1:1067264/149‑1 (MQ=255) ggggTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAat > 2:8525113/1‑150 (MQ=255) ggggTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAat > 2:4807397/1‑150 (MQ=255) gggTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatg > 1:665392/1‑150 (MQ=255) gTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgat > 1:5308555/1‑150 (MQ=255) gTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgat > 1:2697604/1‑150 (MQ=255) cgcCTGCCTGGCT‑GTTGACGCTACCCCTGTTGGAGCGGTTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatgatg < 2:1458135/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatgatg > 1:7571458/1‑150 (MQ=255) gcCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGAtgt > 1:6848620/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGAtgtg > 1:3434303/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGAtgtg < 2:6564937/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGAtgtg > 1:3576380/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGAtgtg > 2:8578131/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGATGTGAt > 2:2427073/1‑150 (MQ=255) tGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGATGTGATCCAg < 2:1051517/150‑1 (MQ=255) tGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGATGTGATCCAg > 1:1579411/1‑150 (MQ=255) | ACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGATGTGATCCAGC > NC_002947/6037649‑6037946 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |