| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 591,535 | T→A | 28.1% | V260D (GTT→GAT) | PP_0501 → | NAD‑dependent epimerase/dehydratase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 591,535 | 0 | T | A | 28.1% | 468.9 / 231.9 | 288 | V260D (GTT→GAT) | PP_0501 | NAD‑dependent epimerase/dehydratase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (104/103); new base A (50/31); total (154/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.84e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GAACAGACCCGGGACTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTTCTCGGTAAA > NC_002947/591387‑591683 | cAGACCCGGGACTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTtgtg < 2:8000975/150‑1 (MQ=255) aGACCCGGGACTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTgg < 1:6900882/150‑1 (MQ=255) aCCCGGGACTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGTGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTgggg > 2:5414223/1‑150 (MQ=255) ccGGGACTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAg > 2:3847165/1‑150 (MQ=255) ggACTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCtt > 2:5744794/1‑150 (MQ=255) aCTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGc < 2:1984400/150‑1 (MQ=255) tCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAg > 1:640811/1‑150 (MQ=255) tCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAg > 2:777906/1‑150 (MQ=255) tCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAg > 1:4715095/1‑150 (MQ=255) ctgtATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCg < 2:1713291/147‑1 (MQ=255) cTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCg > 2:8577914/1‑150 (MQ=255) cTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCg < 1:6680316/150‑1 (MQ=255) cTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCg > 1:4505476/1‑150 (MQ=255) cTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCg > 2:6785121/1‑150 (MQ=255) ttATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGAt > 2:981533/1‑150 (MQ=255) aTGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCa > 1:1103047/1‑150 (MQ=255) tgtgGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAg < 1:3581997/150‑1 (MQ=255) tgGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCt > 1:6353199/1‑150 (MQ=255) tgGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCt > 1:74504/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTAt < 2:5306148/150‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATgc < 1:4220268/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATgcggc < 1:2739231/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATgcggcg > 1:2100436/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGgcgc < 2:3356397/150‑1 (MQ=255) aGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGAt > 1:1209891/1‑150 (MQ=255) gTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGa < 1:6102754/115‑1 (MQ=255) gATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCggg > 2:2633943/1‑150 (MQ=255) gATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCggg > 1:6061606/1‑150 (MQ=255) gATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCggg > 2:6184265/1‑150 (MQ=255) tGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTg < 2:6698896/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGat < 1:5883410/150‑1 (MQ=255) cAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGTAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCCGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATc > 2:6522946/1‑150 (MQ=255) aGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATcc < 2:3594083/150‑1 (MQ=255) ggCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCg > 2:3543071/1‑150 (MQ=255) agcagcCGCGGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTcgc > 1:7282358/1‑150 (MQ=255) cagcCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGa > 2:1009714/1‑150 (MQ=255) cagcCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGa < 1:8534312/150‑1 (MQ=255) cagcCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGa < 1:6735278/150‑1 (MQ=255) cagcCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGa > 1:4015200/1‑150 (MQ=255) cagcCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGa < 2:8216215/150‑1 (MQ=255) agcCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAg > 1:7239753/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCtt > 1:5415905/1‑95 (MQ=255) cGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAg < 1:8698041/150‑1 (MQ=255) aGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATa < 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ggTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGgc > 1:782703/1‑150 (MQ=255) tGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTcgc > 2:5133845/1‑123 (MQ=255) tGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTcgc < 1:5133845/123‑1 (MQ=255) tGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGgcgc > 2:7263134/1‑150 (MQ=255) aCATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGt < 2:640811/150‑1 (MQ=255) cATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGtt < 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cGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGa < 1:4388589/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGa < 1:7894502/150‑1 (MQ=255) cTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGttt > 2:2147536/1‑150 (MQ=255) tGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTg < 1:8430859/150‑1 (MQ=255) tGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTg < 1:4330279/150‑1 (MQ=255) 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ggCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGt > 2:7729736/1‑150 (MQ=255) gCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTg > 1:7112650/1‑150 (MQ=255) cGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGa < 2:2821243/150‑1 (MQ=255) ccTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGc > 1:2341654/1‑150 (MQ=255) cTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGcc > 2:3999764/1‑150 (MQ=255) cTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGcc > 1:3277179/1‑150 (MQ=255) aaCCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGtt < 2:8701399/150‑1 (MQ=255) aaCCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGtt < 2:5508002/150‑1 (MQ=255) aaCCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGtt < 2:2330546/150‑1 (MQ=255) aGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAg < 2:5884177/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAgg > 1:1015786/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAgg > 1:5407925/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGTAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCTCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGc < 1:2492172/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGc > 2:5033063/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCt < 2:3081633/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACaaa < 1:598633/150‑1 (MQ=255) cgcTGGAGAAGGATGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGc < 2:1937050/150‑1 (MQ=255) cTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCtt > 1:7009160/1‑150 (MQ=255) ggAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTtct < 1:8054250/150‑1 (MQ=255) gagaAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTtctc > 2:3921732/1‑150 (MQ=255) gagaAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTtctc > 1:8289585/1‑150 (MQ=255) gaAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTTCTCgg < 2:2092629/150‑1 (MQ=255) aaGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTTCTCGGt < 1:7517423/150‑1 (MQ=255) aGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTTCTCGGTa > 1:1729129/1‑150 (MQ=255) gTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTTCTCGGTaaa > 2:7559740/1‑150 (MQ=255) | GAACAGACCCGGGACTTCCTTTATGTGGGCGACCTGGTGCAGGTGATGGTGCAGGCACTGGAGCAGCCGCAGGTCGAGGAGGGGGCGGTGAACATCGGGCTGAACCAGGCGACCTCACTGAACCAGTTGCTGGCCGCGCTGGAGAAGGTTGTGGGGAGCTTGCCAGCGATCAGCTATGCGGCGGCGCGATCGGGTGATATCCGCCATTCGCGAGCAGATAACCAGCGGCTGTTGGCGCGGTTCGAGTTTGCGCAGGTGACGCCGATGGTTGAAGGCCTGACAAAGCTTCTCGGTAAA > NC_002947/591387‑591683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |