| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 648,292 | A→T | 6.4% | intergenic (+58/+33) | acoR → / ← accC | acetoin catabolism regulatory protein/acetyl‑CoA carboxylase biotin carboxylase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 648,292 | 0 | A | T | 6.4% | 824.2 / 30.6 | 266 | intergenic (+58/+33) | acoR/accC | acetoin catabolism regulatory protein/acetyl‑CoA carboxylase biotin carboxylase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (101/143); new base T (9/8); total (115/151) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
ATGCGGCACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCCTGGTTGGCCAGTTTGTGCTCGAGGTAGTGAATGTTGACGCCGCCTTTGCAGAAGCCTTCATCACGCACCAGGTCGCGGTGCAGCGGGATGTTGGTCTTGATGCCGTCGA > NC_002947/648146‑648440 | cGGCACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCg < 2:8799098/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGACGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCggg < 1:319720/150‑1 (MQ=255) gCACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCggg < 2:4942432/150‑1 (MQ=255) cACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAGAACCCCGGCCCTGTGCCgggg < 1:6322321/150‑1 (MQ=255) cACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAGAACCCCGGCCCTGTGCCgggg < 1:2221397/150‑1 (MQ=255) cGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGtt < 2:130554/150‑1 (MQ=255) cGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGtt < 1:7134101/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCt < 2:1827575/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCt < 2:8071325/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGGCTTTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTg < 1:5947145/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTg < 1:5635045/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACCCGGCCCCCGATTC‑TGGCCGGCAAAAAAAAAACCCCGCACACGGCCggggggatg > 1:4985894/1‑145 (MQ=255) cTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGGCCCGCCGCCGCCCCCCAGTA‑AGGCAGGCCCAAAAAAACCCCCGCCCACGGCCGGGGGTCggg > 2:1720485/1‑150 (MQ=255) cTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTgg < 2:3657735/150‑1 (MQ=255) tttGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGGCGCGACCCCGCCCCAGAATA‑TGGGAGGCCATAAAAAAAACCCGCACACGGCCCGGGGTGTGGt > 2:8364455/1‑150 (MQ=255) gCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGGCGCCACCCGGCCCCACCTTC‑TGGCAGGCACTAAAAAAACCCCGCACCGGGGCGGGGGTCGGGGACATc > 2:7819678/1‑150 (MQ=255) gCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATc < 2:3586436/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCacac < 1:5502690/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |