Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 648,294 | G→T | 6.0% | intergenic (+60/+31) | acoR → / ← accC | acetoin catabolism regulatory protein/acetyl‑CoA carboxylase biotin carboxylase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 648,294 | 0 | G | T | 6.0% | 899.6 / 28.4 | 272 | intergenic (+60/+31) | acoR/accC | acetoin catabolism regulatory protein/acetyl‑CoA carboxylase biotin carboxylase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (109/145); new base T (9/8); total (119/153) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
ATGCGGCACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCC‑TGGTTGGCCAGTTTGTGCTCGAGGTAGTGAATGTTGACGCCGCCTTTGCAGAAGCCTTCATCACGCACCAGGTCGCGGTGCAGCGGGATGTTGGTCTTGATGCCGTCGACGA > NC_002947/648146‑648443 | cGGCACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCg < 2:8799098/150‑1 (MQ=255) ggCACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCgg < 1:8643776/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGACGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCggg < 1:319720/150‑1 (MQ=255) gCACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCggg < 2:4942432/150‑1 (MQ=255) cACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAGAACCCCGGCCCTGTGCCgggg < 1:6322321/150‑1 (MQ=255) cACGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAGAACCCCGGCCCTGTGCCgggg < 1:2221397/150‑1 (MQ=255) cGGGCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGtt < 2:4518219/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCt < 2:8071325/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTg < 1:5635045/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACCCGGCCCCCGATTC‑TGGCCGGCAAAAAAAAAACCCCGCACACGGCCggggggatg > 1:4985894/1‑145 (MQ=255) cTTTGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTgg < 2:6949744/150‑1 (MQ=255) tttGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGGCGCGACCCCGCCCCAGAATA‑TGGGAGGCCATAAAAAAAACCCGCACACGGCCCGGGGTGTGGt > 2:8364455/1‑150 (MQ=255) tGGGCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTAc < 1:201306/150‑1 (MQ=255) gggCATTTCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAAACCCGGCACAGGGGCGGGGTTCTGGTACa > 2:7946676/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCacac < 1:5502690/150‑1 (MQ=255) cGACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGAt < 2:5879636/150‑1 (MQ=255) gACGCTTTATCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCCGCCCCAGCTTA‑GGGCAGGCCCAAAAAAAACCCCGCACCGCGCCGGGGGTCTGGTTCATCACACAAAACCATc > 2:3097882/1‑150 (MQ=255) aTCGGCGAGTGCATGAGCACCGCATCGACATGCCGCGTATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCC‑Tgg < 1:5957485/150‑1 (MQ=255) 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gAGCACCGCATCGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCC‑TGGTTGGCCAGTTtgtg < 1:2723606/150‑1 (MQ=255) cGACATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCC‑TGGTTGGCCAGTTTGTGCTCGAGGTAGt < 1:8099991/150‑1 (MQ=255) aCATGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCC‑TGGTTGGCCAGTTTGTGCTCGAGGTAGTGa < 1:4952486/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCC‑TGGTTGGCCAGTTTGTGCTCGAGGTAGTGAATg < 1:375494/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGGATGAAGGGGTAGAGCCCTGGGGCCGCGACGCGGCCCCAGATTC‑TGGCAGGCAATAAAAAACCCCGGCACAGGGCCGGGGTTCTGGTACATCACACTACACGATCACTCC‑TGGTTGGCCAGTTTGTGCTCGAGGTAGTGAATg < 1:6479187/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |