| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 718,465 | C→G | 5.4% | intergenic (+32/+45) | thiO → / ← PP_0613 | FAD‑dependent glycine/D‑amino acid oxidase/amidase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 718,465 | 0 | C | G | 5.4% | 1160.3 / 26.6 | 367 | intergenic (+32/+45) | thiO/PP_0613 | FAD‑dependent glycine/D‑amino acid oxidase/amidase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (151/193); new base G (5/18); total (156/211) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
TTATCGCAATGGGCTGGTGCTGGCGCCGGCTTCGTGCCAGCTGTTTACCGATTTGCTGACAGGGGCCGAGCCGATTATCGACCCGGCGCCGTATGCGCCAGAAGGGCGTTTGGGCTGAGGACCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑AGGGCCGCAGAAGCCAATACAGATTTCAGCCAGTAATCGGTGCTTGCAGGTGCCGGCTCGGATAATGCTGCTCATACACCTTGCACACCCGCAGCACTTGCTCATCAGCAAAGCGCCCGGCCACCACCTG > NC_002947/718316‑718614 | aTCGCAATGGGCTGGTGCTGGCGCCGGCTTCGTGCCAGCTGTTTACCGATTTGCTGACAGGGGCCGAGCCGATTATCGACCCGGCGCCGTATGCGCCAGAAGGGCGTTTGGGCTGAGGACCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCGa > 2:8506082/1‑150 (MQ=255) gCAATGGGCTGGTGCTGGCGCCGGCTTCGTGCCAGCTGTTTACCGATTTGCTGACAGGGGCCGAGCCGATTATCGACCCGGCGCCGTATGCGCCAGAAGGGCGTTTGGGCTGAGGACCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCGAGCg < 1:7773278/150‑1 (MQ=255) gCAATGGGCTGGTGCTGGCGCCGGCTTCGTGCCAGCTGTTTACCGATTTGCTGACAGGGGCCGAGCCGATTATCGACCCGGCGCCGTATGCGCCAGAAGGGCGTTTGGGCTGAGGACCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCGAGCg < 2:8374668/150‑1 (MQ=255) 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ccTACGCGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑AGGGCCGCAGAAGCCAATACAGATTTCAGCCAGTAATCGGTGCTTGCAGGTGCCGGCTCGGATAATGCTGCTCATACACCTTGCACACCCGCAGCACTTGCTCATCAGCAAAGCGCCCGGccac > 1:3498833/1‑150 (MQ=255) aCGCGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑AGGGCCGCAGAAGCCAATACAGATTTCAGCCAGTAATCGGTGCTTGCAGGTGCCGGCTCGGATAATGCTGCTCATACACCTTGCACACCCGCAGCACTTGCTCATCAGCAAAGCGCCCGGCcaccac < 2:7047853/150‑1 (MQ=255) | TTATCGCAATGGGCTGGTGCTGGCGCCGGCTTCGTGCCAGCTGTTTACCGATTTGCTGACAGGGGCCGAGCCGATTATCGACCCGGCGCCGTATGCGCCAGAAGGGCGTTTGGGCTGAGGACCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑AGGGCCGCAGAAGCCAATACAGATTTCAGCCAGTAATCGGTGCTTGCAGGTGCCGGCTCGGATAATGCTGCTCATACACCTTGCACACCCGCAGCACTTGCTCATCAGCAAAGCGCCCGGCCACCACCTG > NC_002947/718316‑718614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |