Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 798,665 | C→A | 5.6% | intergenic (+17/+10) | fklB‑I → / ← PP_0685 | FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 798,665 | 0 | C | A | 5.6% | 2221.5 / 74.4 | 654 | intergenic (+17/+10) | fklB‑I/PP_0685 | FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (312/304); new base A (21/17); total (333/321) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 677 total aligned reads displayed.
GCAGCTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTTCGT > NC_002947/798516‑798814 | cTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGc > 2:7198737/1‑150 (MQ=255) atgaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCgg < 1:2756402/150‑1 (MQ=255) tgaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGc > 2:6405954/1‑150 (MQ=255) gaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGcc < 1:7509545/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTc < 2:5882539/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTc < 1:920694/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAAt < 1:3280497/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCACGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCCCAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTccagg < 1:6098834/150‑5 (MQ=255) caAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTc > 2:6635586/1‑150 (MQ=255) caAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTc > 2:5078580/1‑150 (MQ=255) caAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGAATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTTTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTc < 2:1606577/150‑1 (MQ=255) aaaTGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCt > 1:6725038/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCt > 1:783636/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGt > 2:6099750/1‑150 (MQ=255) tGTAGGTCCCATGGGAGGTGGCTTAGGGCGCCCAAGGGGTTGGCAGATCCCCGCCGCACCGGGTTGTGGTGTTCGAGGTCGAGCTGCTGGACGTTCTGTAAGGCCCTGGCGGCGGGCCCGGCGGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAg < 1:4680331/150‑1 (MQ=255) gTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAgg > 1:1960766/1‑150 (MQ=255) gTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCGGGTGTTCGACGTCGCGCTGCTCGACGTTCTGTATTGCCCTGGCGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAgg < 2:3942041/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGgc > 1:2047215/1‑150 (MQ=255) cGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCAACGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGGGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGgcg < 1:8540368/150‑1 (MQ=255) tGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCa > 1:5626122/1‑150 (MQ=255) ccAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCacc > 2:5485311/1‑148 (MQ=255) aaGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTcca > 2:5228899/1‑119 (MQ=255) tgCTGGCTTACGGCGCCCACGGCGTTGGCAGAATCCCGCCGCACTGCTTTCTGGGGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCcgcg < 1:4257295/149‑1 (MQ=255) cgcgggCTTCCGGCGCCCAAGGGGTTGGCCGCACCCCGCCGCACGGCGTTGTGGTGTTCGCCGTCGCGCGGCGCGCCGTTCTGTATGGCCCTGGCGGCCGGCCCGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCcgcg < 1:111589/146‑1 (MQ=255) cTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGAATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCa < 2:2958819/150‑1 (MQ=255) ggCTTACGGCGCCCATGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCACAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATa < 1:1322721/150‑1 (MQ=255) gCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAg < 1:4898399/150‑1 (MQ=255) ttACGGCGCCCAAGGGGTTGGCTGCATCCCGCCGCACCGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCGGCGCGACGTTCTGTAATGCCCTGGCGGCCGGCCCGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGca < 1:6918538/150‑1 (MQ=255) ttACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGca < 2:4879284/150‑1 (MQ=255) ttACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGca > 1:6627735/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACCGCGTTCTGGTTTTCGACGTCGCGCTGCTCGACTTTCTGGACTGCCGGGGAGGCCGGCCCGGCCGGCCCCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGcagaa < 1:2603622/150‑1 (MQ=255) ggCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGcagaac > 2:3344139/1‑150 (MQ=255) gcCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCCCAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGcagaacaga < 2:4237632/150‑1 (MQ=255) cccAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGcagaacagaa < 1:6577440/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaa > 2:3430675/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCTGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaac > 1:7299288/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaac > 2:7062803/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaac > 1:5450003/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaac > 2:1775933/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCCGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaaca > 1:79720/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaaca < 1:6017785/150‑1 (MQ=255) cggCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaacag < 2:3806079/149‑1 (MQ=255) aGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTTTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTATTGCCCTGGAGGCGGGCCCTGCCGTCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaacag < 2:4449521/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGaacagaaacag > 2:2471265/1‑150 (MQ=255) gtgggCAGCACCCCGCCCCCCCGCGTTGTGGTTTTCGCCGTCGAGCGGCTCGACTTTCTGTACGGCCCTGGCGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTc < 1:1516466/147‑1 (MQ=255) gTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTc > 1:3525661/1‑150 (MQ=255) ggCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGt < 2:7531530/150‑1 (MQ=255) gcagcaTCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTa > 1:1742879/1‑150 (MQ=255) gcagcaTCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTa < 2:2032001/150‑1 (MQ=255) gcaTCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCa > 1:588589/1‑150 (MQ=255) cccGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTc > 2:3554467/1‑150 (MQ=255) cgccgcACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCt > 2:2284739/1‑150 (MQ=255) gccgcACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCtt > 1:3716664/1‑150 (MQ=255) cgcACCGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGa < 2:1219877/150‑1 (MQ=255) cgcACAGCTTTCTTGTTTTCGACGTGGTGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGa < 1:4488133/150‑1 (MQ=255) cgcACAGCTTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGa < 1:5766076/150‑1 (MQ=255) cgcACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGTGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGa < 1:5268287/150‑1 (MQ=255) cgcACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGa < 1:7158065/150‑1 (MQ=255) cgcACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGa < 1:4996176/150‑1 (MQ=255) acaGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCa > 2:7789617/1‑150 (MQ=255) acaGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAAATACAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCACCGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCATGGAGCa > 1:4355267/1‑150 (MQ=255) cGTTCTGGCGTTCGCCGACGAGCTGCTCGCCGTTCTGAACTGCCCTGCAGGCCGGCCCCGCCGGCCCCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGAGTCCGTACCAGTTCCTTGAGCAcccc < 1:4096439/150‑1 (MQ=255) tgtGGTGTTCGACGTCGAGCTGCGCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCGGCGGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCgg < 1:8388304/148‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGt < 2:8308502/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCTAGGTGGAGCTGCTCGAGTTTCTTTAATGCCCTGGAGGCCGTCCCTGCGGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACTCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTc < 1:5516952/150‑1 (MQ=255) tgtTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCAc < 2:870082/150‑1 (MQ=255) ttCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTc > 1:8234070/1‑150 (MQ=255) agaaCGTCGAGCAGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCg > 1:6465807/4‑150 (MQ=255) agaaCGTCGAGCAGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACAAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCg > 1:3853430/4‑150 (MQ=255) ggACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAAAAGAAACAGATTACGTACCAGTTCCATGAGCACCCCCGGTTCACTCGa > 1:7601501/2‑150 (MQ=255) gaaCGTCGAGCAGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGa > 2:3639880/3‑150 (MQ=255) gACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGaa > 2:5663421/1‑150 (MQ=255) gACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCACAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGaa < 2:7693076/150‑1 (MQ=255) aaCGTCGAGCAGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGaa > 1:3070880/2‑150 (MQ=255) gAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGAAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGc < 2:7339477/150‑1 (MQ=255) cgcggctCGCGGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCGGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGcc < 1:8090283/146‑1 (MQ=255) gctCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCt > 2:5255927/1‑150 (MQ=255) cGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCAt > 2:6935203/1‑150 (MQ=255) gACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATg > 1:7755707/1‑150 (MQ=255) ttCTGTCATGCCCTGGAGGCCGGCCCGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCa < 2:4573686/150‑1 (MQ=255) ttCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCa < 1:2259930/150‑1 (MQ=255) ttCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCa < 2:3076508/150‑1 (MQ=255) tCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAg > 2:2148725/1‑150 (MQ=255) cTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAgg > 1:4181472/1‑150 (MQ=255) tGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCAGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGt > 1:7050013/1‑150 (MQ=255) cccTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTg > 1:2539843/1‑150 (MQ=255) cccTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCACAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTg < 1:140887/150‑1 (MQ=255) ttgAGGCCGGCAGGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGa > 2:4340928/3‑98 (MQ=255) tGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTc > 2:8562658/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTc > 2:2697637/1‑150 (MQ=255) tgAGGCCGGCAGGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCa > 2:3165559/2‑150 (MQ=255) ggAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCa < 2:4125868/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCtt < 1:2402120/94‑1 (MQ=255) gAGGCCGGCAGGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCAc > 1:6272718/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGGCAGGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCAc > 2:1374090/1‑150 (MQ=255) gccggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCa > 2:8056579/1‑150 (MQ=255) cggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGt > 1:1006850/1‑150 (MQ=255) gccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTtc > 1:3978684/1‑150 (MQ=255) gccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTtc < 1:1890822/150‑1 (MQ=255) cccTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGT‑CCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTtcgt > 2:5415562/1‑150 (MQ=255) | GCAGCTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTTCGT > NC_002947/798516‑798814 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |