Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 954,438 | C→A | 5.5% | L93I (CTC→ATC) ‡ | cyoE → | protoheme IX farnesyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 954,438 | 0 | C | A | 5.5% | 2546.0 / 89.1 | 747 | L93I (CTC→ATC) ‡ | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (401/304); new base A (17/25); total (418/329) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.37e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 750 total aligned reads displayed.
GATCGGTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCG > NC_002947/954290‑954587 | aTCGGTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTc > 2:2818146/1‑150 (MQ=255) tCGGTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCg > 2:5281003/1‑150 (MQ=255) cGGTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCgg < 1:6598532/150‑1 (MQ=255) cGGTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCgg < 1:411761/150‑1 (MQ=255) cGGTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCgg < 2:4792144/150‑1 (MQ=255) gTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCgggg > 2:3038866/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTgg < 2:7252416/150‑1 (MQ=255) cTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCCGAGCAGGGTgg < 2:6935229/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGTGGGTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGAGGGAGCGCCCCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGCTCGACGCCACCCTGCTCGGGGTgg < 2:4081404/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCggg < 1:7004110/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCggg < 1:8575506/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCggg < 1:882939/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCCGAGCAGGGTGGCgta < 1:7601837/150‑3 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCCGAGCAGGGTGGCgta < 1:5761879/150‑3 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCCGAGCAGGGTGGCgta < 2:2554757/150‑3 (MQ=255) tggtggTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGtt > 1:4720236/1‑150 (MQ=255) ggtggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGttt < 1:6097281/150‑1 (MQ=255) ggtggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGttt < 1:1532409/150‑1 (MQ=255) tggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCa < 1:6246935/150‑1 (MQ=255) tggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCa < 2:4168311/150‑1 (MQ=255) gtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGc > 1:5461774/1‑150 (MQ=255) ttGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGcc > 1:1856827/1‑150 (MQ=255) gTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCAGGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCctgct > 2:5167950/1‑150 (MQ=255) tCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCctgctg > 1:2770305/1‑150 (MQ=255) ccGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGt > 1:2564220/1‑150 (MQ=255) ggATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTAt > 1:5987823/1‑150 (MQ=255) gtgtTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAg > 1:52454/1‑150 (MQ=255) gtgtTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAg > 2:5647708/1‑150 (MQ=255) gtTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGc < 1:1761478/150‑1 (MQ=255) gtTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGc < 1:7842499/150‑1 (MQ=255) tCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCa > 2:1707172/1‑150 (MQ=255) aacaacTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAAc > 2:1309710/1‑150 (MQ=255) aacaacTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAAc > 2:3898065/1‑150 (MQ=255) aacaacTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAAc > 2:8672602/1‑150 (MQ=255) acaacTGCATCGACCGTGACATCGACCAGAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAAcc > 2:8285234/1‑150 (MQ=255) acaacTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAAcc > 2:3357160/1‑150 (MQ=255) cTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCt < 1:5649672/150‑1 (MQ=255) cATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTc > 1:2883416/1‑150 (MQ=255) aTCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCt > 1:2095571/1‑150 (MQ=255) tCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTg > 1:8486225/1‑150 (MQ=255) cGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGc < 2:8128976/150‑1 (MQ=255) ccGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGtt > 2:4639704/1‑150 (MQ=255) gTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCt < 1:3693329/150‑1 (MQ=255) tGACATCGACCACAAGATGGAGTGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTg > 1:3545885/1‑150 (MQ=255) tGACATCGACCACAAGATGGAGTGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTg > 1:3921944/1‑150 (MQ=255) aCATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTgcg < 2:7563335/150‑1 (MQ=255) cATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTgcgc < 1:1104760/150‑1 (MQ=255) cATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTgcgc < 2:4520292/150‑1 (MQ=255) aTCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTGCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCCATCTGCGCa > 1:1917517/1‑150 (MQ=255) gACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTg < 2:5461774/150‑1 (MQ=255) gACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTg > 1:4018193/1‑150 (MQ=255) ccACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGAt < 1:7338479/150‑1 (MQ=255) acaAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGTGTTCTGCGCACTGATTg > 2:7951480/1‑150 (MQ=255) aaGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGc < 2:629286/150‑1 (MQ=255) aGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCt > 2:5883430/1‑150 (MQ=255) aGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCt < 2:2901327/150‑1 (MQ=255) aTGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCttt < 2:120516/150‑1 (MQ=255) tGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTg < 1:7761735/150‑1 (MQ=255) gAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTgtc < 2:5994648/150‑1 (MQ=255) gcgcACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTgtcgt > 1:6461235/1‑150 (MQ=255) aCCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTAc > 1:2404531/1‑150 (MQ=255) aCCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTAc > 2:5095079/1‑150 (MQ=255) cAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGt > 1:7479598/1‑150 (MQ=255) cAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGt > 2:217734/1‑150 (MQ=255) cAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGt > 1:5127158/1‑150 (MQ=255) cAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGt > 1:5398325/1‑150 (MQ=255) aaGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTc > 1:6801992/1‑150 (MQ=255) tgAACCATGACACGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCg > 2:6506495/2‑150 (MQ=255) tgAACCATGACACGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCg > 1:4257357/2‑150 (MQ=255) aGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGc > 2:3542212/1‑100 (MQ=255) ccGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGttt > 2:6760645/1‑150 (MQ=255) ccGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGttt > 2:1953864/1‑150 (MQ=255) gTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCtg > 1:3157278/1‑150 (MQ=255) gTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCtg > 1:338631/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGc > 1:8298020/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGc > 2:7517404/1‑150 (MQ=255) ggcATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAg < 2:3704744/150‑1 (MQ=255) gcATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGc > 2:2360113/1‑150 (MQ=255) cATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCg < 1:2262756/150‑1 (MQ=255) aTGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGt < 1:7980502/150‑1 (MQ=255) gCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGt < 1:4455111/150‑1 (MQ=255) ccTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCa > 1:1021183/1‑150 (MQ=255) cTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCAc > 1:327120/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCtgt < 2:3254638/126‑1 (MQ=255) tCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACg > 2:1516683/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACg > 1:3827867/1‑150 (MQ=255) gcgcTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGc > 1:8174726/1‑150 (MQ=255) tgaaacccGCCACCCCGAGCAGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCt > 1:1278809/8‑150 (MQ=255) tGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCt > 1:4542624/1‑150 (MQ=255) cTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGt < 2:7867973/150‑1 (MQ=255) tACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTc > 2:7358212/1‑150 (MQ=255) cGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCgg > 1:945926/1‑150 (MQ=255) gCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGc < 1:4939689/150‑1 (MQ=255) cACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAg > 2:7168646/1‑150 (MQ=255) cACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAg > 1:2970588/1‑150 (MQ=255) cACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAg > 1:7131911/1‑150 (MQ=255) cACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAg > 2:8386323/1‑150 (MQ=255) cACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAg > 2:44314/1‑150 (MQ=255) aCCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGc > 2:6445981/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTg > 2:7055523/1‑150 (MQ=255) | GATCGGTACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCG > NC_002947/954290‑954587 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |