| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 977,876 | T→A | 5.0% | intergenic (+39/‑141) | cysE → / → iscR | serine acetyltransferase/DNA‑binding transcriptional regulator IscR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 977,876 | 0 | T | A | 5.0% | 2365.8 / 66.3 | 684 | intergenic (+39/‑141) | cysE/iscR | serine acetyltransferase/DNA‑binding transcriptional regulator IscR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (290/358); new base A (16/19); total (306/378) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 717 total aligned reads displayed.
GCGCTGACCAAGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCATGCGACTG > NC_002947/977727‑978025 | gcgcTGACCAAGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCgtgt < 2:6379216/150‑1 (MQ=255) cgcTGACCAAGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGtgtg < 2:2369374/150‑1 (MQ=255) gcTGACCAAGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGc < 2:7955960/150‑1 (MQ=255) cAAGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGc > 2:66829/1‑150 (MQ=255) cAAGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGc > 1:5931427/1‑150 (MQ=255) aGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGAGCACACGccc < 1:1637532/150‑1 (MQ=255) aGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGAGCACACGccc < 2:3714916/150‑1 (MQ=255) gATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGAGCACACGcccc < 1:5681360/150‑1 (MQ=255) gATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCCGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGAGCACACGcccc < 1:7007643/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGt < 2:4148191/150‑1 (MQ=255) gCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGAGGGGCGTGAGCACACGccccgcatg < 1:522334/150‑6 (MQ=255) cAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCt < 1:1892739/150‑1 (MQ=255) tATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACaa > 1:6529703/1‑150 (MQ=255) tATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACaa < 2:2506340/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATc < 1:2266308/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATc < 1:329826/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATc > 2:5677685/1‑150 (MQ=255) tgtgCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATcg > 1:6053787/1‑150 (MQ=255) tgCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATcgcg > 1:2012791/1‑150 (MQ=255) ccAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGcgcc > 1:7279331/1‑150 (MQ=255) aaGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGcgcccg > 2:4934046/1‑150 (MQ=255) aGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGcgcccgc > 2:4819445/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTc < 2:7628564/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTcc < 2:2017684/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCt > 1:4199832/1‑150 (MQ=255) cGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGAt < 1:1167262/150‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGAt < 2:450815/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTg > 2:8414332/1‑147 (MQ=255) ggCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCACAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATg < 1:8593988/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATcc < 2:3527831/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATccc < 1:3915079/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATccc < 2:3254041/150‑1 (MQ=255) ggaggaCGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGa < 1:4740818/150‑1 (MQ=255) ggaggaCGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGa < 2:6072822/150‑1 (MQ=255) ggaggaCGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGa > 2:4348918/1‑150 (MQ=255) gaggaCGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGAc > 2:737445/1‑150 (MQ=255) acgacTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTaaa < 2:6887299/150‑1 (MQ=255) cgacTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTTGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAg < 2:2271703/150‑1 (MQ=255) acTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCa < 1:5576529/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGt > 2:2556929/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGt < 1:8057321/150‑1 (MQ=255) gCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGt < 2:5116751/150‑1 (MQ=255) gCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGAC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGt > 1:100801/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGCAGACGAGGGGCGTGAGCACACGccccgcat > 2:1077498/1‑92 (MQ=25) ggCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTaa < 1:4535824/150‑1 (MQ=255) gCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAAt > 2:3060816/1‑150 (MQ=255) gCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAAt > 2:541313/1‑150 (MQ=255) tGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACGATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAg > 2:5992315/1‑150 (MQ=255) cccAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGtt > 1:4465313/1‑150 (MQ=255) cAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGa > 1:3805940/1‑150 (MQ=255) cAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGa < 1:5036034/150‑1 (MQ=255) aaGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGAc < 1:755422/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACACTTGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTCACGCAGTAGGTCTAAGAGGTGACTTaaa > 1:7138852/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTaaa < 2:8205045/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTaaa < 1:2485448/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTaaa > 1:6754637/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTaaa < 1:8267824/150‑1 (MQ=255) cccAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAAt < 2:271242/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATg > 2:4616988/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATg > 1:3614995/1‑150 (MQ=255) cacTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAAt < 2:1199112/150‑1 (MQ=255) acTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATc < 2:1384950/150‑1 (MQ=255) acTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATc > 1:995211/1‑150 (MQ=255) acTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATc < 1:3487050/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCa < 2:7787648/150‑1 (MQ=255) gCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATa < 2:693587/150‑1 (MQ=255) gCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATa < 2:7464943/150‑1 (MQ=255) gCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGcccc > 2:1583972/1‑57 (MQ=255) gCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGcccc < 1:1583972/57‑1 (MQ=255) ttGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGca < 2:8058568/150‑1 (MQ=255) ttGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGca < 1:6418282/150‑1 (MQ=255) ttGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGca < 2:4716787/150‑1 (MQ=255) cgcgCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACAt > 1:4072724/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATc < 2:2133846/150‑1 (MQ=255) cgccgcACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATcc > 1:2934989/1‑150 (MQ=255) cACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTc > 2:8724269/1‑120 (MQ=255) cACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTc < 1:8724269/120‑1 (MQ=255) cACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGaaa < 2:28784/150‑1 (MQ=255) aGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCg < 1:1103821/150‑1 (MQ=255) aGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCg < 1:2191185/150‑1 (MQ=255) gTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGt > 1:2650440/1‑150 (MQ=255) tCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTATGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTg < 1:6256124/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGt > 1:7809712/1‑150 (MQ=255) ggtggC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTAc < 1:3162224/150‑1 (MQ=255) gtggC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTAcc < 2:6310415/150‑1 (MQ=255) gC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCaa > 2:1683697/1‑150 (MQ=255) c‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAAt > 1:7948416/1‑150 (MQ=255) tGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAg < 2:7063251/150‑1 (MQ=255) gaggggCGTGAGCACACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGc > 2:8312453/3‑150 (MQ=255) cGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGcc < 2:6563090/150‑1 (MQ=255) ggggCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCa > 2:4026706/1‑150 (MQ=255) ggggCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCa > 2:2661449/1‑150 (MQ=255) gggCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCAt < 1:5420592/150‑1 (MQ=255) gggCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCAt < 1:7399524/150‑1 (MQ=255) gggCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCAt < 1:1769117/150‑1 (MQ=255) gggCGTGAGCACACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCAt > 1:2750229/1‑150 (MQ=255) gCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCATGc < 2:7279331/150‑1 (MQ=255) gCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCATGc < 1:835951/150‑1 (MQ=255) gtgtGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCATGCga < 2:5861067/150‑1 (MQ=255) tgtgCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCATGCgac > 1:4804966/1‑150 (MQ=255) | GCGCTGACCAAGATGGGCAGTGACTATTGTGCCAAGGAACTGCCGGCCTTGCCGGAGGACGACTTCAGCGAGGCTGCCCAAGTGGCCCAGCGCGACACTCAGCCGCATTGATCGCGCCGCACTGAAGTCATGGTGGC‑‑ATGCGGGGCGTGTGCTCACGCCCCTCGTCTGCTACAATCGCGCCCGCCTCCCTGATGCAATCCCGACTAAAGCAGTAGGTCTAATAGTTGACTTAAATGCTCGGGAATCGCATACTCGCACACATCCTGAAACTCCCGTGGTACCCAATAGCCATGCGACTG > NC_002947/977727‑978025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |