| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 1,107,601 | A→C | 7.1% | K30T (AAG→ACG) | ttg2E → | toluene‑tolerance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,107,601 | 0 | A | C | 7.1% | 1440.8 / 3.5 | 493 | K30T (AAG→ACG) | ttg2E | toluene‑tolerance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (308/124); new base C (2/54); total (310/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-24 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 553 total aligned reads displayed.
GGGCCGGCGAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTG > NC_002947/1107452‑1107750 | gggCCGGCGAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCgcaa < 1:7052796/150‑1 (MQ=255) ccGGCGAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCgcaagca > 1:6199101/1‑150 (MQ=255) cGGCGAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCgcaagcaa > 2:630335/1‑150 (MQ=255) cGGCGAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCgcaagcaa > 2:4749423/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGcaagcaag < 2:8038022/150‑1 (MQ=255) tgcttGGCCTTGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAgcaaggca > 2:4464458/5‑150 (MQ=255) gAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAgcaaggca > 1:1639833/1‑150 (MQ=255) gTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGcaaggcaagg < 1:7755042/150‑1 (MQ=255) 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caaggccaagCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTg > 1:2234584/1‑150 (MQ=255) aaggccaagCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGa > 1:3067927/1‑150 (MQ=255) aaggccaagCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGa < 1:2401828/150‑1 (MQ=255) ggccaagCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATc > 1:2900393/1‑150 (MQ=255) ggccaagCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATc > 2:1195927/1‑150 (MQ=255) 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ccGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCAc > 1:6803729/1‑150 (MQ=255) cGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACt > 1:2646137/1‑150 (MQ=255) gccgCGGCCCGGCCTGGCGCAAGAACGGCATGGTGCTGATCGTTGGCCCGCGCGCGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTg < 2:2120870/147‑1 (MQ=255) gCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCa > 2:1798018/1‑150 (MQ=255) ccgggccTGGCGCAAGCACGGCATGGTGCTGATCGTGGGCGCGCGCGCCCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGc < 2:257239/147‑1 (MQ=255) cccggcgTGGCCCACGCACGGCTTGGTGCTGAGGGTGGGCGCGCGCGCCCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGc < 2:1784544/150‑1 (MQ=255) cccggccTCGCCCACGCCTGGCTTGGTGCTGATCGTGGGCCCGCGCGCCCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGc < 1:6529181/150‑1 (MQ=255) cccggccGTGCCCAACCACCGAAAGTTGCTTATCGATGGCCCGCCCGCGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGc < 2:4995969/150‑1 (MQ=255) ccggccTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCCCTGGCAAGGCg > 1:57566/1‑150 (MQ=255) ccggccTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCg > 1:4409110/1‑150 (MQ=255) cggccTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGt > 1:5214646/1‑150 (MQ=255) ggccTTGCGCACCACAGGAATGGTGCTGAGCGATGGCTCGCGCGCCCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTg < 2:3475768/150‑1 (MQ=255) gcgttGCGCACGCACGGCACGGTGTTGTTCGATGGCTCGCGCTCGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGc < 2:1350874/147‑1 (MQ=255) gccTTGCGCACTCACGGCTCGGTGCTGAGCGTGGGCCCGCGCGCCCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGc < 2:1020708/150‑1 (MQ=255) gccTTGCGCACGCACGGCTTGGTGCTGATCGCTGGCGCGCGCGCCCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGc < 1:8011012/150‑1 (MQ=255) 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aagcacgGCTCGGTGCTTTTCGTTGGCGCCCGCCCCCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGt < 1:3603629/150‑1 (MQ=255) aagcaagGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGCCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGt > 2:2753224/1‑150 (MQ=255) | GGGCCGGCGAAGTGGCCAAGGCCAAGCAGGCTGCCGACAACTCGCCAGAGAAGAGCGTCAAATGAGTGAGGCCGCTGTAAGCATGGCAGAGCCAGGCGTGCTGCGTCTGACTGGCGTGCTGGACTACCGCAGCGGCCCGGCCTTGCGCAAGCAAGGCAAGGTGCTGATCGATGGCTCGCGCGAGCCGCGACTGGTGCTTGATTGCTCGGCTGTCGAGAAGTCGTCGAGTGTTGGCCTGTCGCTACTGCTGGCGTACATGCGGGATGCTCAGGCCACTGGCAAGGCGTGCGAGGTGCGTG > NC_002947/1107452‑1107750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |