| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,123,696 | A→C | 8.1% | intergenic (‑28/+23) | holC ← / ← pepA | DNA polymerase III subunit chi/cytosol aminopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,123,696 | 0 | A | C | 8.1% | 1579.9 / 20.7 | 532 | intergenic (‑28/+23) | holC/pepA | DNA polymerase III subunit chi/cytosol aminopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (128/341); new base C (58/2); total (186/346) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.31e-27 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 548 total aligned reads displayed.
TCCTGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGTTGTAGGCT > NC_002947/1123547‑1123845 | tCCTGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCa > 2:6789162/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCaa < 2:2802932/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGT‑‑CGCGCAAGGc < 2:7444610/150‑1 (MQ=255) tGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCCAgg > 1:7941330/1‑150 (MQ=255) tGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAgg < 2:3819106/150‑1 (MQ=255) tGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGGGGCGCGCCAgg > 1:3349105/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGca < 1:8464476/150‑1 (MQ=255) gCAGATAGACCCGGGGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCaccacc < 1:1380245/150‑1 (MQ=255) gATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACcggc < 2:215733/150‑1 (MQ=255) tAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGATATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACcggctt < 1:1023868/150‑1 (MQ=255) aGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGGCGGTGGCGCGCCAGGCACCACccgcgtc > 1:4563038/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACcggcttcac < 2:2882895/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACcggcttcac < 1:2228656/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACcggcttcacggcttc < 2:3543584/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACcggcttcacggcttc < 2:3961215/150‑1 (MQ=255) cGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGgc < 2:6584661/150‑1 (MQ=255) cGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGgc < 1:7478608/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGgcgc < 1:7745653/150‑1 (MQ=255) gcCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCacc > 2:8557491/1‑148 (MQ=255) gcCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCGGCACGGCTTCAGGCGCCAgc > 2:7526912/1‑150 (MQ=255) aaGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGGCCGGGGCGCGCCAGGCCCCCCCCGCGGCCCGGCGGCCGGCGCCAGcgcg > 1:2510282/1‑150 (MQ=255) aaGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCCAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGcgcg > 2:5533484/1‑150 (MQ=255) aaGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGcgcg < 2:1579187/150‑1 (MQ=255) aGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGAATTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCgg < 2:6364548/150‑1 (MQ=255) tttCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTcc < 1:6817247/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCca < 2:4958184/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCca < 1:5008019/150‑1 (MQ=255) tcGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCcagca < 2:796208/150‑1 (MQ=255) tcGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCcagca < 1:5426582/150‑1 (MQ=255) tcGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGGGGGGCGCAACGCCCCCCCCGCGTCACGGCGTCAGGCGCCCGCGCGGGCccgca > 1:1260518/1‑150 (MQ=255) gCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGGCGGGGGCGCGCAAGGCACCACCCGCGTCACCGCGTAAGGCCCCCGCGCGGGCCCGCAgg > 1:1116036/1‑150 (MQ=255) gCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAgg < 1:6521300/150‑1 (MQ=255) gCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAgg < 1:2057260/150‑1 (MQ=255) tttGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTgg < 2:1839441/150‑1 (MQ=255) tttGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTgg < 1:589064/150‑1 (MQ=255) tttGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTgg < 2:2677491/150‑1 (MQ=255) tttGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTgg < 1:4000019/150‑1 (MQ=255) tttGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTgg < 2:5585919/150‑1 (MQ=255) taagtcGAAAACGAGACGCGCAGAAAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTAATGTTGGGAATCGCAGGCCGGTGCCGCGCAACGAACCAACCGCTAAACCGCATAAGGCGACATCGCGGTCAAGAACGAACTGGGTc > 2:7922184/6‑150 (MQ=255) aGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGACGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCGTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCCGCAGGTACAGGGTcag > 2:8751762/1‑150 (MQ=255) gCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAATGCACCACCGGCTTCACGGCTTCATGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTAATGGGTcagca > 2:5351875/1‑150 (MQ=255) cGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGGGGCGCGCCAGGCACCACCCGCGTAACGGCTGCAGGCGGCCCCGCGGGCCCGCCGGGACggggggcgcag > 1:4812787/1‑143 (MQ=255) gAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCaga < 1:7988941/150‑1 (MQ=255) gAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCaga < 1:4138137/150‑1 (MQ=255) aaaTCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCagag < 1:2666800/150‑1 (MQ=255) aaaTCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCagag < 2:7791779/150‑1 (MQ=255) aaaTCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCagag < 1:347575/150‑1 (MQ=255) aaTCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGGCGGGGGGGCGCCCCGCCCCACCCGCGTAACGGCGTAAGGCGCCCCCGCGGTCCACCCGGGACTGGGGGCGCAGAgg > 1:3118634/1‑150 (MQ=255) aCAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGt < 1:578768/150‑1 (MQ=255) cccgctgTCGGCGGGCAGAATGTAGACGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTg < 1:4358278/144‑1 (MQ=255) aGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTgg < 1:3757045/150‑1 (MQ=255) gCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGTCGGCCAGTGgc < 1:4649737/150‑1 (MQ=255) cGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGgcg < 2:766222/150‑1 (MQ=255) cGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGgcg < 2:2263340/150‑1 (MQ=255) cGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGGGGCGCGCCAGGCACCACCCGCTTCACGGGGTCAGGCCCCCCCGCGGTCCAGCCCGTGCAGGGGCAGCAGAGGGTCCGGGCGGGCCGTGgcg > 1:4898045/1‑150 (MQ=255) gAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGgcgc < 2:4673396/150‑1 (MQ=255) cGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCttt < 2:1442252/150‑1 (MQ=255) cGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCttt < 1:8685469/150‑1 (MQ=255) gCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCtt < 1:5686868/150‑1 (MQ=255) gCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCCGCTTAACGGCGTCAGGCGCCACCGCCGTCCAGCAGGTACGGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTGTGTCCtt > 2:4091979/1‑150 (MQ=255) gCAGAATGGAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCtt < 2:1166280/150‑1 (MQ=255) gAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTgcc < 1:7203133/150‑1 (MQ=255) aTGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCCGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTgccgc < 2:4259836/150‑1 (MQ=255) aTGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAACGCACCACCCGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTgccgc > 2:2019160/1‑150 (MQ=255) tGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGGGGCGCGCCAGGCACCACCGGCTTAACCGCGGCAGGCGCCCCCGCCGTCCACCAGGTACGGGGTCAGCAGAGGTACCCGGCGGGCCGGGGCGCCGTTGTCCTGgccccc > 2:1656443/1‑150 (MQ=255) aGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACt < 1:7113018/150‑1 (MQ=255) aaGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGa < 2:5755245/150‑1 (MQ=255) gTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCCAGGCCCCACCGGCTTAACGGCTTCAGGCGCCCGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCACAGGTACCGGGCGGCCCGTGGCGCCTGTGTACTTGCCCCCAcagccc > 2:4800493/1‑145 (MQ=255) gTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAACGCACCACCGGCTTCACGGCGTCAGGCCCCCGCGCGGTCCAGCACGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCCCTGGCGCCAGTGTCCTTGCCGCCCCAGAcc > 2:6917759/1‑150 (MQ=255) tCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCCGGCGGCCAGTGGCGCCCTTGTCCGTGCCGCCACTGAccc > 2:5873316/1‑150 (MQ=255) tCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCCGGGGCCCGCAAACCACCACCCGCGTAACCGCATCAGGCGCCCGCCCGGGCCACCACGTACGGGGTCAGCACAGGTACCCGGCGGCCCGAGGCGCCGTTTTCCTAGCCGCCACTGAccc > 2:4408931/1‑150 (MQ=255) gACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCCGTGGCCCCCAACGCCCCCACGGCTTAACGGCTTGAGGAGCCACCGCCGTCCAGCACGTACAGGGTCAGCAGAAGTAAAGGGCGGCCACTTGCGCCATTGTCCGTGACGCCCCAGACCCAg > 2:8113126/1‑150 (MQ=255) ccTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCGTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAgg < 2:7174058/149‑1 (MQ=255) cTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGc < 1:3589091/150‑1 (MQ=255) tCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAACGCACCACCCGCGTCAAGGCGTCAGGCCCCCCCCCGGTCCAGCAGGTACATGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCCGTGGCGCCTGTGTCCTTGCCGCCACAGACCCAGGCGGTAcc > 2:5434521/1‑150 (MQ=255) cATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCg < 1:2760140/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCgg < 2:331099/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGGAATCGCCGGCCGGGGGCGCCCAACGCACCACCCGCGTAAACGCGTAAGGCGCCCGCCCGGTACACCAGGTACTGGGTCAGCACAGGTACCCGGCGGCCAGTGGCGCCATTGTACATTCCGCCACAGAACCACGCCGTACCgg > 2:1285325/1‑150 (MQ=255) tggtggGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCCGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTAATGGGTCAGCAGAGGTAACGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCCCCGACCCCGGCGGTACCGGc > 2:7043041/1‑150 (MQ=255) ggtggGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCa < 2:3678305/150‑1 (MQ=255) ggAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGAGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGt < 2:2391943/150‑1 (MQ=255) aTCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCa < 2:5701199/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCAt < 2:8258216/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCAt < 2:5274121/150‑1 (MQ=255) ccggccggTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCATTGTCCGAGCCCCCACTGACCCAGGCGGGACCCGCCATGTCCAtgtg > 2:101259/1‑150 (MQ=255) cggccggTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGGCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTgc < 2:2988576/150‑1 (MQ=255) gccggTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCTGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTgcgc > 1:4239098/1‑150 (MQ=255) ccggTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGcc > 2:2516385/1‑150 (MQ=255) cggTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGccc > 2:4574673/1‑150 (MQ=255) ggTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCa > 1:1467093/1‑150 (MQ=255) ggTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCa > 2:5979034/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGt < 1:6105911/88‑1 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGt > 2:6105911/1‑88 (MQ=255) ggCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGtt < 1:82096/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGtt < 1:3520196/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGTGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGTTGTa > 2:6635338/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGTTGTa < 1:2953320/150‑1 (MQ=255) cgcAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGTTGTAg < 1:3922494/150‑1 (MQ=255) gcAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGTTGTAgg > 1:1845411/1‑150 (MQ=255) aaGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGTTGTAGGCt > 1:1642011/1‑150 (MQ=255) | TCCTGGCAGTGCAGATAGACCCGGTGGCCGAGGCGCCAAGCTTTCTCGCACAGTTTGCAGGCGAAATCGAGCCGCGCCGACAGCGAGTCGGTGGGCAGAATGTAGAAGTCGACTTTGCTCATGGTGGGAATCGCCGGCCGGTGGCGCGCAAGGCACCACCGGCTTCACGGCTTCAGGCGCCAGCGCGGTCCAGCAGGTACTGGGTCAGCAGAGGTACCGGGCGGCCAGTGGCGCCTTTGTCCTTGCCGCCACTGACCCAGGCGGTACCGGCAATGTCCATGTGCGCCCAGTTGTAGGCT > NC_002947/1123547‑1123845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |