| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,187,840 | T→A | 6.6% | intergenic (+52/+42) | tadA → / ← mltF | tRNA adenosine(34) deaminase TadA/membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,187,840 | 0 | T | A | 6.6% | 2272.6 / 68.7 | 719 | intergenic (+52/+42) | tadA/mltF | tRNA adenosine(34) deaminase TadA/membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (280/383); new base A (39/16); total (320/399) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.49e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 727 total aligned reads displayed.
TTCTCAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAGGTGAG > NC_002947/1187691‑1187989 | tctcAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATc > 2:5394573/1‑150 (MQ=255) tctcAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATc < 2:2235593/150‑1 (MQ=255) ctcAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCt < 2:8029343/150‑1 (MQ=255) tcAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCtt < 1:6842289/150‑1 (MQ=255) tcAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCtt > 1:4530908/1‑150 (MQ=255) tcAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGCCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAACCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAAACtt > 1:8603357/1‑150 (MQ=255) cAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTg < 2:7432513/150‑1 (MQ=255) aaCCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGTGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCTCCAGGTTCTGCGCAAATCTTgg > 2:492724/1‑149 (MQ=255) aaCCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGTGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGt > 2:8704089/1‑150 (MQ=255) accaccGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTa < 2:3156059/150‑1 (MQ=255) accaccGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTa < 2:3658191/150‑1 (MQ=255) accaccGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTa < 1:5216243/150‑1 (MQ=255) accaccGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTa < 1:4926115/150‑1 (MQ=255) accaccGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTa < 1:4700893/150‑1 (MQ=255) accaccGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTa < 2:7179067/150‑1 (MQ=255) caccGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCGACAGGGTCTGCGCAAATCTTGTAgg > 1:2654239/1‑150 (MQ=255) accGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGgc < 1:6460725/150‑1 (MQ=255) cGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGgcgc < 2:1683852/150‑1 (MQ=255) gggTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGcgcg > 2:5700248/1‑150 (MQ=255) ggTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCgg < 1:476956/150‑1 (MQ=255) gATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTa < 2:5557400/140‑1 (MQ=255) ggAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCcg > 1:7823160/1‑150 (MQ=255) ggAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCGTGTAGGCGCGGGTTTGCCcg > 2:2039617/1‑150 (MQ=255) gAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCcgc < 2:5156791/150‑1 (MQ=255) gggCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGttt > 2:4761592/1‑142 (MQ=255) ggCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGaa < 2:786132/150‑1 (MQ=255) cGGGGTGCTGGCGCAGGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAaga < 1:7314045/150‑1 (MQ=255) cGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAATCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAaga < 1:80268/150‑1 (MQ=255) cGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAaga < 1:6062673/150‑1 (MQ=255) cGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAaga < 2:3780201/150‑1 (MQ=255) ggggTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTTCCCGCGAagag > 1:2961492/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCt < 1:7536988/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTg > 1:4970609/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCATGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTTGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGa < 1:1691989/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGa > 1:1926601/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGa < 1:2369842/150‑1 (MQ=255) cAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGc < 1:710966/150‑1 (MQ=255) aaGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCt < 1:593666/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACa < 1:3794742/150‑1 (MQ=255) gggCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAAt > 2:4609135/1‑100 (MQ=255) aGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCGCCAGGTTCTGCGCAAATCGTGTAGGCGCGGGGTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGTCCGGCTTACATCGGcgac > 1:1196673/1‑150 (MQ=38) aTCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGcgacga < 1:2827436/150‑1 (MQ=255) aTCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGcgacga < 1:7195806/150‑1 (MQ=255) tCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCgacgac < 1:7945705/150‑1 (MQ=255) tCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCGACAGGGTCTGCGCAAATCTTTTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGCAGAGGTCCAGACAGGCTTACAACGGCgacgac > 1:6628923/1‑150 (MQ=255) cTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACtt < 2:6158181/150‑1 (MQ=255) tCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCAACGAAAGGGTCTTCGCAAAACATTTTGGCGCGGGGTTTCCCCCCAAGAGGTCCTGACAGGCGTAAAAAGGCGACGACTTa > 1:8103739/1‑150 (MQ=255) aGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGcga > 1:6344410/1‑141 (MQ=255) gACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGc > 2:112111/1‑150 (MQ=255) ttcttcAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTgg > 2:4072069/1‑150 (MQ=255) ttcttcAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTgg > 2:2688855/1‑150 (MQ=255) cttcAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCGTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAATAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCt > 2:5968342/1‑150 (MQ=255) ttcAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCtt > 1:5315860/1‑150 (MQ=255) tcAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTg > 2:680353/1‑150 (MQ=255) ccttggCCCGGCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTGGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACGTATCCGCGGGCGTg > 1:3409865/5‑150 (MQ=38) ccttggCCCGGCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTg > 2:3873110/5‑150 (MQ=255) aaGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTc < 1:1013570/150‑1 (MQ=255) aaGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTc < 1:5406191/150‑1 (MQ=255) aGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTcc < 2:131689/150‑1 (MQ=255) gCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCGGGCTTGTCCtt > 2:6644916/1‑150 (MQ=255) gggCCATGGCTTGAGCTGCACCTGCCTCTTCGAGGTCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCTATTCTTGTTGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTTCATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGAcc < 2:4251167/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGTCCCCgg < 2:5232554/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCGTGTTGACCCCgg > 2:2561500/1‑150 (MQ=255) taGGATTGAGGTGCACCGGCGTCTTGGCGGGCAAGCCCGATCCTACAGGTTCTGGGCAAATGTTTTAGGGGGGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATAGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGAGCCCggg < 1:6202116/149‑1 (MQ=255) gCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGcac < 2:2440667/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGcaca > 2:6964580/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGc < 1:2505841/150‑1 (MQ=255) aGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCa > 2:7529610/1‑150 (MQ=255) cACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTg < 2:1429286/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGcc < 1:3916950/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGccc < 1:556778/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCgg < 1:506738/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCgg < 1:1370924/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGc < 1:3280383/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCAcc < 2:6050682/150‑1 (MQ=255) gcgGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCt > 2:3336563/1‑150 (MQ=255) cgGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTg < 2:4992182/150‑1 (MQ=255) ggCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGc < 1:3592110/150‑1 (MQ=255) ggCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGc < 2:4395863/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTGGCCGAGGGCAACCTgcat < 1:4353639/150‑4 (MQ=255) aaacccGCGCCTACAAGATTTGCGCAGAACCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCtt > 1:8331900/4‑150 (MQ=21) gCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTcc < 1:7008630/150‑1 (MQ=255) acccGCGCCTACAAGAGTTGCGCAGAACCTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTcc > 2:8313291/2‑150 (MQ=37) cccGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCa < 1:5729939/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAg < 1:1114915/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAg > 2:6418117/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGc < 2:2913456/150‑1 (MQ=255) cTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTg > 2:7623938/1‑150 (MQ=255) tCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGc < 2:2335381/150‑1 (MQ=255) cTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCgg > 2:7257041/1‑150 (MQ=255) tACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGc > 1:8233598/1‑150 (MQ=255) aCAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCt > 2:1862822/1‑150 (MQ=255) aGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTgg < 1:895621/150‑1 (MQ=255) aGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTgg < 2:8473616/150‑1 (MQ=255) gcAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAg > 1:4027879/1‑150 (MQ=255) gcAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAg > 1:2209636/1‑150 (MQ=255) gcAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAg > 2:3268740/1‑150 (MQ=255) aTCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAGGTGa < 1:8704085/150‑1 (MQ=255) aTCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAGGTGa < 1:8474414/150‑1 (MQ=255) tCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAGGTGAg < 1:2039617/150‑1 (MQ=255) | TTCTCAACCACCGGGTGATGGTGGAGGGCGGGGTGCTGGCGCAAGAGTGCGGGCAGATCCTCAGCGACTTCTTCAAGGCCCGCCGGGCCAAGGCTTGAGCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGTTCTGCGCAAATCTTGTAGGCGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGTCCTGACAGGCTTACATCGGCGACGACTTATCCGCTGGCTTGTCCTTGTTGACCCCGGGCACATGCAGGTTGCCCTCGGCCACCTGGCCTTCCAGCTGCGGCTGGGTCACCCAGGTGAG > NC_002947/1187691‑1187989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |