| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,206,908 | A→C | 5.5% | Q119H (CAA→CAC) | xcpW → | type II secretion pathway protein XcpW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,206,908 | 0 | A | C | 5.5% | 2222.4 / 13.1 | 710 | Q119H (CAA→CAC) | xcpW | type II secretion pathway protein XcpW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (417/228); new base C (2/63); total (419/291) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.23e-24 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 733 total aligned reads displayed.
TACGACCAGCGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCA > NC_002947/1206759‑1207057 | tACGACCAGCGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCaa > 1:8083564/1‑150 (MQ=255) aCGACCAGCGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAAc < 1:7220593/150‑1 (MQ=255) aCCAGCGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGcc > 2:6362152/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCct > 1:5973767/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCctg > 2:7403778/1‑150 (MQ=255) cGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCctgctg < 2:2108294/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCctgctgctg < 1:5175584/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCctgctgctg < 1:6172602/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCctgctgctg < 1:1241007/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGaa > 1:6492928/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGaaa < 2:4363082/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAg > 1:1507300/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCt < 1:2202107/150‑1 (MQ=255) agtccAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCt > 2:7259926/4‑150 (MQ=255) ccAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcgg < 1:7928300/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTTGGCTGGACTGGCGGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcggc > 2:8338562/1‑150 (MQ=255) cAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcggc > 2:2832321/1‑150 (MQ=255) cAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcggc < 1:8779466/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcggc < 1:7644982/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcggc > 2:12540/1‑150 (MQ=255) cAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcggc > 1:2581992/1‑150 (MQ=255) aGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTcggcg > 2:4901893/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGAc > 2:7796115/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGAc > 2:4577984/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGAc < 2:3071450/150‑1 (MQ=255) ttGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCt < 2:326896/150‑1 (MQ=255) gCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTa < 1:141986/150‑1 (MQ=255) cTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTAc > 1:7721878/1‑150 (MQ=255) tGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTAcg > 1:4944878/1‑150 (MQ=255) gACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTAcgcc > 1:8495436/1‑150 (MQ=255) gACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTAcgcc > 1:3070413/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTAcgccgc > 1:1783473/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGTACAGGTccgccgag < 2:6868521/150‑3 (MQ=255) gCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTgg > 2:6228156/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGgc < 2:3788175/150‑1 (MQ=255) gCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGTACAGGTccgccgagctttc < 1:19286/150‑8 (MQ=255) gCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGgcgc < 2:3884931/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGccc > 2:4646954/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGccc > 1:2800507/1‑150 (MQ=255) ccacAGCAACTGGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCTGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGcccc > 2:564633/4‑150 (MQ=255) cGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGcccc < 1:532684/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGcccc > 2:2131123/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGcccc > 2:80203/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCcg > 1:4603022/1‑150 (MQ=255) aGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCgcgc < 1:5701673/150‑1 (MQ=255) aGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCgcgc > 1:4556436/1‑150 (MQ=255) gCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCt > 1:3189918/1‑150 (MQ=255) cAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTg > 2:8714992/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGt > 2:6827202/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAg < 2:4117517/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAgc < 1:1609479/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAgc < 1:3584256/150‑1 (MQ=255) tgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 1:5879794/150‑1 (MQ=255) tgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 1:6396141/150‑1 (MQ=255) tgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 2:6065755/150‑1 (MQ=255) tgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 2:5029594/150‑1 (MQ=255) tgGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGACTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGaa < 2:6618336/150‑1 (MQ=255) gggTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAAc < 2:560272/150‑1 (MQ=255) gggTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAAc < 1:2918910/150‑1 (MQ=255) gggTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCACCTGCAACGCCAGTGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAAc > 1:6956815/1‑150 (MQ=255) gTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGa > 1:2308880/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGAc > 1:8168221/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTc > 2:5183011/1‑150 (MQ=255) 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ggCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACgttctgttc > 2:8555313/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTAc > 1:5400884/1‑150 (MQ=255) gcgcgCCTGCAACGCCAGCGCCGGCGGTTCGCGGCCCGCGAGCAACGCCTGCGGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTAc < 2:5721490/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCa > 1:3443675/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCa > 1:5055514/1‑150 (MQ=255) gcCTGCACCGCCCGCGCTGGGGTTTCGCGGCCCGCGACAACCGCGGGGGGGGGCAACGCGGGGCGCACGTGTCCGCCGGGGGCGCCCGGGGGTGGGTCCCGCGCCCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAgg < 2:2581992/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGcc > 2:7944489/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGcc > 2:8136213/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGcc > 2:7152257/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctgg > 2:7592640/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCGTTTCGCGGCCCGCGACCAACGCGTGCTGCTGTAAAGCGCGGGGCACCTTTACGCCGCGGGCGCCCCGCGCTGGTTACCGCGCCCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctggct < 2:5345787/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGGTTCGCGGCCCGCGCGCACCGCGTGGTGGTGGAAGGGTCGGGGGACCTGGCCGCGGGGGGCGCCCCGCGGGGGGTCCCGCGCGCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctggct < 2:449605/150‑1 (MQ=255) cgcgTGGGGTTCGCGGCCCGCTAGCAACGCCTGCTGCTGGAATGCTGGGCGGACGTGTACGCCGCTGGCGCCCGGCGGTGGGTACCGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctggctg < 2:1922094/150‑1 (MQ=255) cgcCTGCGGTGCGCGGCCCGGTACCAACCCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCGGGCGCCCCGCGGGGGGTCCTGCGCGCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCgctggctg < 1:8668531/150‑1 (MQ=255) gcCGGCGGTTCGCGGCCCGCGCGCACCGCCTGCTGGTGGAACGCTCGGCGGCCCTGCACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACCGCGCCAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGctggctgg < 2:5845480/150‑1 (MQ=255) tGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGctggcct > 1:7354487/1‑150 (MQ=255) ggggTTCGTGGCCCGCGAGCACCGCCTGGTGGTTGAAAGCGGGGGGGACCTTTACGCCGGGGGCGCCCCGGGGTGGTTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGctggcctg < 2:1578128/148‑1 (MQ=255) ggggTTCGCGGCCCGCGAGCACCGCCTGCTGCGGCAACGCGCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCGGGGCACCGCGCCAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGctggcctg < 2:1353429/148‑1 (MQ=255) gcggCCCGCGCGCACGGCCTGCGGCGGGACCGCGCGGGGGCCCTGGACGCCGGGGGCGCCCCGCGGGGGGTCCCGCGCGCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCt < 2:7719827/148‑1 (MQ=255) gcgcccggcgACCACCGCCTGGTGGTGTAACGGGCGGGGGACCTGTCCGCGGGGGGCGCCCCGCGGGGGGTCCCGCGCCCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCt < 1:552455/143‑1 (MQ=255) aGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTg > 2:6969516/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCGCCCACCGCCTGCTGGTGGAACGCGGGGGGGACCTGCCCGCCGGTGGCGCCCCGGGGTGGGTACCGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGa < 1:6576435/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCGAGCACCGCGTGGTGCTGGACCGCGGGGCGCACCTGTCGGCCGCGGGCGCCCGGGGGTGGGTACCGCGCCCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGa < 2:1044334/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGa > 1:1031828/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGACCACCGCGTGCTGCTGGAAAGCGCGGCGCACCTGTCCGCCGCGGGCGCCCCGCGGGGGTCCCCGCGCGCACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGAc < 1:6763759/150‑1 (MQ=255) cgcgAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCaa > 1:5266326/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCa > 1:2741616/1‑150 (MQ=255) | TACGACCAGCGTCTGCCGCTGGCCAGCCGTTGGCTGGACTGGCAGCCCGCCAGCAACCAGTTGCTGTGGGTCGCCAGCACCGGCCTGCCGGCAGCCGAAGGTGGCTCGCGCCTGCAACGCCAGCGCCTGCGGTTCGAGGCCCGCGAGCAACGCCTGCTGCTGGAAAGCTCGGCGGACCTGTACGCCGCTGGCGCCCCGCGCTGGGTACAGCGCGAACGACTCGACCAGGTCAGCGCCATGAACGTTCTGTTCTACCAGGGCGGCCGCTGGCTGGCCTGGCCTTCTGACCAACCGGTGCA > NC_002947/1206759‑1207057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |