| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,536,222 | 0 | T | C | 5.4% | 1368.6 / 38.7 | 429 | intergenic (+33/+15) | lpxC/PP_1344 | UDP‑3‑O‑[3‑hydroxymyristoyl] N‑acetylglucosamine deacetylase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (236/169); new base C (16/7); total (253/176) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 433 total aligned reads displayed.
GAACAACCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCCCTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTT > NC_002947/1536075‑1536371 | gAACAACCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCCCTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTc > 2:7949001/1‑150 (MQ=255)gAACAACCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCCCTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTc < 1:7411821/150‑1 (MQ=255) aacaacCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCCCTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCg < 2:3746363/150‑1 (MQ=255) 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ttCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCtt > 2:7372031/1‑150 (MQ=255) | GAACAACCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCCCTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTT > NC_002947/1536075‑1536371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |